Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms