Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARID3CA6NKF2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms