Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV5

RAPGEFL1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1Q9UHV5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAPGEFL1Q9UHV5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms