Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SHARPINQ9H0F6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHARPINQ9H0F6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms