Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOPBP1Q92547 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197 ms