Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCTN1Q2MV58 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms