Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL24A1Q17RW2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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