Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 snR17asnR17a 333 nt3.69□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 MRPS9YBR146W 837 nt3.69□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 MNT4YNR059W 1743 nt3.69□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 BUD27YFL023W 2391 nt3.69□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 AKR1YDR264C 2295 nt3.69□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 GCN5YGR252W 1320 nt3.69□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 KRI1YNL308C 1776 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 IPI3YNL182C 1668 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 NUF2YOL069W 1356 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 APE2YKL157W 2859 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 FLO5YHR211W 3228 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 YGL074CYGL074C 327 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 PCL7YIL050W 858 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 ENT3YJR125C 1227 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 EAF7YNL136W 1278 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 YPR136CYPR136C 513 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 DER1YBR201W 636 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 TED1YIL039W 1422 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 CPA2YJR109C 3357 nt3.68□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 MSD1YPL104W 1977 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 BCS1YDR375C 1371 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 YDR271CYDR271C 372 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 TLG1YDR468C 675 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 AML1YGR001C 747 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 SIC1YLR079W 855 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 YAR075WYAR075W 474 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 REH1YLR387C 1299 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 YML047W-AYML047W-A 366 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 SEC65YML105C 822 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 YNL035CYNL035C 1170 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 YOR082CYOR082C 342 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 HNT3YOR258W 654 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 LCB5YLR260W 2064 nt3.67□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 MAL12YGR292W 1755 nt3.66□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 MAL32YBR299W 1755 nt3.66□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 FAD1YDL045C 921 nt3.66□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 YPT7YML001W 627 nt3.66□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 POP8YBL018C 402 nt3.66□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 FDH1YOR388C 1131 nt3.66□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 LDH1YBR204C 1128 nt3.66□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 SIN4YNL236W 2925 nt3.66□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 RRI1YDL216C 1323 nt3.66□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 PBI1YPL272C 1554 nt3.65□□□□□ -1.82
SPE3Q12074 DBP5YOR046C 1449 nt3.65□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 YDR340WYDR340W 303 nt3.65□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 IZH1YDR492W 951 nt3.65□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 MTC3YGL226W 372 nt3.65□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 ERP1YAR002C-A 660 nt3.65□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 CTL1YMR180C 963 nt3.65□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 RRN6YBL014C 2685 nt3.65□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 MDN1YLR106C 14733 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 QRI7YDL104C 1224 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 RNH202YDR279W 1053 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 PDX1YGR193C 1233 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 FIP1YJR093C 984 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 YLL047WYLL047W 384 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 ATG5YPL149W 885 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 HUT1YPL244C 1020 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 YPR078CYPR078C 1119 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 YBR137WYBR137W 540 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 ARA1YBR149W 1035 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 SYT1YPR095C 3681 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 HDA2YDR295C 2025 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 CET1YPL228W 1650 nt3.64□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 ATG21YPL100W 1491 nt3.63□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 RPS29BYDL061C 171 nt3.63□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 MRPL11YDL202W 750 nt3.63□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 RRG1YDR065W 1098 nt3.63□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 HIM1YDR317W 1245 nt3.63□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt3.63□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 HUB1YNR032C-A 222 nt3.63□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 AEP2YMR282C 1743 nt3.63□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 SEA4YBL104C 3117 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 NHP10YDL002C 612 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 KXD1YGL079W 657 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 TAM41YGR046W 1158 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 ECM4YKR076W 1113 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 MOH1YBL049W 417 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 LDS2YOL047C 1071 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 PLP2YOR281C 861 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 YBR053CYBR053C 1077 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 DAN4YJR151C 3486 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 OSH3YHR073W 2991 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 TRS120YDR407C 3870 nt3.62□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 PMT6YGR199W 2280 nt3.61□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt3.61□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 RRP17YDR412W 708 nt3.61□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 MPC1YGL080W 393 nt3.61□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 YHL026CYHL026C 948 nt3.61□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 CAP2YIL034C 864 nt3.61□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt3.61□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 MAK16YAL025C 921 nt3.61□□□□□ -1.83
SPE3Q12074 AHP1YLR109W 531 nt3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 70.1 ms