Protein–RNA interactions for Protein: Q01589

SED1, Cell wall protein SED1, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED1Q01589 YAL065CYAL065C 387 nt2.33□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YNL143CYNL143C 393 nt2.33□□□□□ -2.04
SED1Q01589 VAM10YOR068C 345 nt2.33□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YOR385WYOR385W 873 nt2.33□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YPL276WYPL276W 438 nt2.33□□□□□ -2.04
SED1Q01589 GAS2YLR343W 1668 nt2.33□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YPL216WYPL216W 3309 nt2.33□□□□□ -2.04
SED1Q01589 TRM13YOL125W 1431 nt2.33□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YPP1YGR198W 2454 nt2.32□□□□□ -2.04
SED1Q01589 SPT15YER148W 723 nt2.32□□□□□ -2.04
SED1Q01589 LST7YGR057C 729 nt2.32□□□□□ -2.04
SED1Q01589 UNG1YML021C 1080 nt2.32□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YNL013CYNL013C 378 nt2.32□□□□□ -2.04
SED1Q01589 RPL20BYOR312C 519 nt2.32□□□□□ -2.04
SED1Q01589 GYP6YJL044C 1377 nt2.32□□□□□ -2.04
SED1Q01589 NRP1YDL167C 2160 nt2.32□□□□□ -2.04
SED1Q01589 GYP7YDL234C 2241 nt2.32□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YGL082WYGL082W 1146 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 MRPL25YGR076C 474 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 SED5YLR026C 1023 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 RSA3YLR221C 663 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 DDP1YOR163W 567 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 ALG5YPL227C 1005 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 RRM3YHR031C 2172 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 PRS5YOL061W 1491 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 SMI1YGR229C 1518 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 ERG11YHR007C 1593 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 RAX2YLR084C 3663 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 UBP12YJL197W 3765 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YHR078WYHR078W 1659 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 TCM62YBR044C 1719 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 HBT1YDL223C 3141 nt2.31□□□□□ -2.04
SED1Q01589 PRM2YIL037C 1971 nt2.3□□□□□ -2.04
SED1Q01589 snR70snR70 164 nt2.3□□□□□ -2.04
SED1Q01589 SCM4YGR049W 564 nt2.3□□□□□ -2.04
SED1Q01589 BET1YIL004C 429 nt2.3□□□□□ -2.04
SED1Q01589 ARC15YIL062C 465 nt2.3□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YKR033CYKR033C 426 nt2.3□□□□□ -2.04
SED1Q01589 GCD7YLR291C 1146 nt2.3□□□□□ -2.04
SED1Q01589 PPA2YMR267W 933 nt2.3□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YBR116CYBR116C 528 nt2.3□□□□□ -2.04
SED1Q01589 NAT1YDL040C 2565 nt2.3□□□□□ -2.04
SED1Q01589 SET1YHR119W 3243 nt2.3□□□□□ -2.04
SED1Q01589 SPO1YNL012W 1896 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 AIM14YGL160W 1713 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 RAD55YDR076W 1221 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YDR149CYDR149C 708 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YHP1YDR451C 1062 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 RRT13YER066W 558 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YGR015CYGR015C 987 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 OKP1YGR179C 1221 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 JIP3YLR331C 378 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 PEX12YMR026C 1200 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 SEC14YMR079W 915 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YPL150WYPL150W 2706 nt2.29□□□□□ -2.04
SED1Q01589 MAK21YDR060W 3078 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 TSC11YER093C 4293 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 NPL4YBR170C 1743 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 TCB2YNL087W 3537 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 ALG1YBR110W 1350 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 TIM21YGR033C 720 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YKL091CYKL091C 933 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 TIS11YLR136C 858 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 YAR069CYAR069C 294 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 SNO1YMR095C 675 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 DNA2YHR164C 4569 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 EMP70YLR083C 2004 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 CEP3YMR168C 1827 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 SLP1YOR154W 1764 nt2.28□□□□□ -2.04
SED1Q01589 BUD6YLR319C 2367 nt2.28□□□□□ -2.05
SED1Q01589 VPS33YLR396C 2076 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 SER3YER081W 1410 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 BUB1YGR188C 3066 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 VPS27YNR006W 1869 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 DYN2YDR424C 279 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 YOR186WYOR186W 435 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 SAS5YOR213C 747 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 MAL12YGR292W 1755 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 MAL32YBR299W 1755 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 MIF2YKL089W 1650 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 YDR089WYDR089W 2610 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 STP2YHR006W 1626 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 CHS3YBR023C 3498 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 MOT1YPL082C 5604 nt2.27□□□□□ -2.05
SED1Q01589 SEC7YDR170C 6030 nt2.26□□□□□ -2.05
SED1Q01589 PRP3YDR473C 1410 nt2.26□□□□□ -2.05
SED1Q01589 NMA111YNL123W 2994 nt2.26□□□□□ -2.05
SED1Q01589 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.26□□□□□ -2.05
SED1Q01589 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.26□□□□□ -2.05
SED1Q01589 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.26□□□□□ -2.05
SED1Q01589 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.26□□□□□ -2.05
SED1Q01589 YER138CYER138C 5268 nt2.26□□□□□ -2.05
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