Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB1P53618 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB1P53618 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB1P53618 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB1P53618 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB1P53618 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB1P53618 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB1P53618 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB1P53618 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB1P53618 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB1P53618 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB1P53618 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB1P53618 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB1P53618 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB1P53618 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB1P53618 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB1P53618 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB1P53618 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB1P53618 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB1P53618 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB1P53618 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB1P53618 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB1P53618 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB1P53618 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB1P53618 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB1P53618 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB1P53618 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB1P53618 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB1P53618 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB1P53618 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB1P53618 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB1P53618 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB1P53618 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB1P53618 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB1P53618 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB1P53618 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB1P53618 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB1P53618 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB1P53618 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB1P53618 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB1P53618 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB1P53618 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPB1P53618 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPB1P53618 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPB1P53618 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPB1P53618 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB1P53618 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB1P53618 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB1P53618 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB1P53618 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB1P53618 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB1P53618 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB1P53618 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB1P53618 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB1P53618 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB1P53618 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB1P53618 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB1P53618 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB1P53618 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB1P53618 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB1P53618 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB1P53618 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB1P53618 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB1P53618 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB1P53618 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB1P53618 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB1P53618 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB1P53618 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB1P53618 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB1P53618 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms