Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNPLA3Q9NST1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms