Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYL1P12980 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYL1P12980 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYL1P12980 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYL1P12980 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYL1P12980 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LYL1P12980 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LYL1P12980 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LYL1P12980 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LYL1P12980 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LYL1P12980 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LYL1P12980 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LYL1P12980 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LYL1P12980 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LYL1P12980 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LYL1P12980 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LYL1P12980 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LYL1P12980 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LYL1P12980 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LYL1P12980 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.7 ms