Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P9

RABGAP1, Rab GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1Q9Y3P9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGAP1Q9Y3P9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGAP1Q9Y3P9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms