Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRP68Q9UHB9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRP68Q9UHB9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms