Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPG2Q9UBF2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms