Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK12Q9NYV4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms