Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms