Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
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