Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 SPO20YMR017W 1194 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 LDS2YOL047C 1071 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 IAH1YOR126C 717 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 IRC14YOR135C 342 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 PNT1YOR266W 1272 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 ECM8YBR076W 1065 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 ZDS2YML109W 2829 nt3.79□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 KTR6YPL053C 1341 nt3.78□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 SUC2YIL162W 1599 nt3.78□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.78□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 ADH4YGL256W 1149 nt3.78□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 YAL069WYAL069W 315 nt3.78□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 YPR136CYPR136C 513 nt3.78□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 PWP2YCR057C 2772 nt3.78□□□□□ -1.8
SMF3Q12078 REB1YBR049C 2433 nt3.78□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 TRM12YML005W 1389 nt3.77□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 TMA108YIL137C 2841 nt3.77□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 PMT6YGR199W 2280 nt3.77□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.77□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 ASI2YNL159C 870 nt3.77□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 RIM4YHL024W 2142 nt3.77□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 IPI3YNL182C 1668 nt3.77□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 GPI10YGL142C 1851 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YDR149CYDR149C 708 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 CTH1YDR151C 978 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YDR355CYDR355C 303 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 IES6YEL044W 501 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 IRC18YJL037W 675 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 ENT3YJR125C 1227 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 TFA2YKR062W 987 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 IRC25YLR021W 540 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 BUR2YLR226W 1188 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 MED11YMR112C 396 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 IZH2YOL002C 954 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 CAF20YOR276W 486 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 CPA2YJR109C 3357 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 TRK1YJL129C 3708 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YPL109CYPL109C 1974 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YTM1YOR272W 1383 nt3.76□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 AEP2YMR282C 1743 nt3.75□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 QRI7YDL104C 1224 nt3.75□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 PCL2YDL127W 927 nt3.75□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 TLG1YDR468C 675 nt3.75□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 GLO4YOR040W 858 nt3.75□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YOR263CYOR263C 408 nt3.75□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 BAR1YIL015W 1764 nt3.75□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 PPZ1YML016C 2079 nt3.75□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 SSU1YPL092W 1377 nt3.75□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 CHD1YER164W 4407 nt3.75□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 TOP1YOL006C 2310 nt3.75□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 SIN4YNL236W 2925 nt3.74□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 BYE1YKL005C 1785 nt3.74□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 STP1YDR463W 1560 nt3.74□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YER076CYER076C 909 nt3.74□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 LSM1YJL124C 519 nt3.74□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 NRK1YNL129W 723 nt3.74□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 SWH1YAR042W 3567 nt3.74□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 AVT7YIL088C 1473 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 TRM1YDR120C 1713 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YDR089WYDR089W 2610 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 FRQ1YDR373W 573 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 POP6YGR030C 477 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 RPS0AYGR214W 759 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 DPH1YIL103W 1278 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 SOP4YJL192C 705 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YLR444CYLR444C 303 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YMR310CYMR310C 954 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 FYV5YCL058C 459 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 UBX5YDR330W 1503 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 MIG1YGL035C 1515 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 COP1YDL145C 3606 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 ACK1YDL203C 1872 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 ABP140YOR239W 1887 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 ALG8YOR067C 1734 nt3.73□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 RAD5YLR032W 3510 nt3.72□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 ETP1YHL010C 1758 nt3.72□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 FMP25YLR077W 1752 nt3.72□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YDR336WYDR336W 945 nt3.72□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 RRP17YDR412W 708 nt3.72□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 OTU1YFL044C 906 nt3.72□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YGL108CYGL108C 423 nt3.72□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 YLL047WYLL047W 384 nt3.72□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 IDP2YLR174W 1239 nt3.72□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 MRPL51YPR100W 423 nt3.72□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 SCD6YPR129W 1050 nt3.72□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 GRX1YCL035C 333 nt3.72□□□□□ -1.81
SMF3Q12078 RPS29BYDL061C 171 nt3.71□□□□□ -1.82
SMF3Q12078 YDR290WYDR290W 330 nt3.71□□□□□ -1.82
SMF3Q12078 YDR340WYDR340W 303 nt3.71□□□□□ -1.82
SMF3Q12078 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.71□□□□□ -1.82
SMF3Q12078 YOL166CYOL166C 339 nt3.71□□□□□ -1.82
SMF3Q12078 SSP2YOR242C 1116 nt3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 110.5 ms