Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms