Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMDP11532 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMDP11532 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMDP11532 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMDP11532 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMDP11532 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMDP11532 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMDP11532 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMDP11532 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMDP11532 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMDP11532 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMDP11532 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMDP11532 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMDP11532 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMDP11532 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMDP11532 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DMDP11532 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DMDP11532 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMDP11532 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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