Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBSP08397 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBSP08397 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBSP08397 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBSP08397 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBSP08397 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBSP08397 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBSP08397 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBSP08397 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBSP08397 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBSP08397 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBSP08397 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBSP08397 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBSP08397 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBSP08397 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBSP08397 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBSP08397 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBSP08397 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBSP08397 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBSP08397 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBSP08397 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBSP08397 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBSP08397 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBSP08397 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBSP08397 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBSP08397 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms