Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms