Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 798.5
UTP3Q9NQZ2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 798.5
UTP3Q9NQZ2 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 798.5
UTP3Q9NQZ2 PRDM16-210ENST00000607632 581 ntTSL 215.2■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 798.5
UTP3Q9NQZ2 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 798.5
UTP3Q9NQZ2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.312e-11■■■■■ 795
UTP3Q9NQZ2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.312e-11■■■■■ 795
UTP3Q9NQZ2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.242e-11■■■■■ 795
UTP3Q9NQZ2 RTEL1-202ENST00000356810 1339 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.152e-11■■■■■ 795
UTP3Q9NQZ2 RTEL1-207ENST00000463361 575 ntTSL 414.56□□□□□ -0.082e-11■■■■■ 795
UTP3Q9NQZ2 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-11■■■■■ 795
UTP3Q9NQZ2 LRRC45-205ENST00000583302 1289 ntTSL 219.29■□□□□ 0.682e-64■■■■■ 788.8
UTP3Q9NQZ2 CDK9-202ENST00000421939 702 ntTSL 328.17■■■□□ 2.11e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-219ENST00000497483 578 ntTSL 226.24■■□□□ 1.791e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.751e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.721e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.551e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.091e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-208ENST00000470965 810 ntTSL 521.23■□□□□ 0.991e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.581e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-216ENST00000489424 759 ntTSL 518.17■□□□□ 0.51e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 CDK9-203ENST00000480353 706 ntTSL 216.32■□□□□ 0.21e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 780.5
UTP3Q9NQZ2 CNDP2-226ENST00000584581 4523 ntTSL 213.21□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 780.5
UTP3Q9NQZ2 CNDP2-202ENST00000324301 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 780.5
UTP3Q9NQZ2 CNDP2-209ENST00000579847 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 780.5
UTP3Q9NQZ2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 780.4
UTP3Q9NQZ2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 780.4
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-220ENST00000532278 506 ntTSL 425.04■■□□□ 1.63e-12■■■■■ 770.1
UTP3Q9NQZ2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.133e-28■■■■■ 768.6
UTP3Q9NQZ2 MOB2-202ENST00000526462 795 ntTSL 214.27□□□□□ -0.133e-28■■■■■ 768.6
UTP3Q9NQZ2 PIGG-216ENST00000508669 584 ntTSL 219.41■□□□□ 0.72e-80■■■■■ 768.1
UTP3Q9NQZ2 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 764.7
UTP3Q9NQZ2 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 764.7
UTP3Q9NQZ2 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 764.7
UTP3Q9NQZ2 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.042e-31■■■■■ 763.9
UTP3Q9NQZ2 APEH-210ENST00000463616 699 ntTSL 318.1■□□□□ 0.492e-9■■■■■ 762.4
UTP3Q9NQZ2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 761.3
UTP3Q9NQZ2 CENPU-205ENST00000510146 1549 ntTSL 1 (best)22.41■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 761.3
UTP3Q9NQZ2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.765e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-205ENST00000479672 776 ntTSL 325.14■■□□□ 1.625e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.445e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 PROSER2-204ENST00000474155 728 ntTSL 323.42■■□□□ 1.345e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.275e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.265e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.225e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SEMA6C-201ENST00000341697 5262 ntTSL 1 (best)22.56■■□□□ 1.25e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.175e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 XXYLT1-208ENST00000473200 698 ntTSL 221.82■■□□□ 1.085e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.085e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 LTBP2-202ENST00000553939 6462 ntTSL 520.95■□□□□ 0.945e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.945e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.895e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.855e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.825e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ATPAF2-201ENST00000444058 685 ntTSL 319.95■□□□□ 0.784e-61■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.785e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 LAMP1-203ENST00000472564 5242 ntTSL 219.83■□□□□ 0.775e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-207ENST00000487505 913 ntTSL 319.73■□□□□ 0.755e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 LTBP2-206ENST00000557425 582 ntTSL 219.72■□□□□ 0.755e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.695e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.685e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 PLIN5-203ENST00000588887 597 ntTSL 319.08■□□□□ 0.645e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.525e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-203ENST00000463568 723 ntTSL 318.26■□□□□ 0.515e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-222ENST00000484526 2969 ntTSL 217.97■□□□□ 0.475e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.395e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 PLIN5-205ENST00000590350 887 ntTSL 217.27■□□□□ 0.365e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SEMA6C-202ENST00000368912 3697 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.35e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TRIM66-207ENST00000530502 858 ntTSL 316.07■□□□□ 0.168e-30■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SEMA6C-204ENST00000368914 3892 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.155e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.125e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TRIM66-204ENST00000525788 854 ntTSL 515.13■□□□□ 0.018e-30■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.145e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.165e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SEMA6C-203ENST00000368913 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)13.86□□□□□ -0.195e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.25e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ATPAF2-207ENST00000488753 796 ntTSL 313.78□□□□□ -0.24e-61■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-221ENST00000480230 4640 ntTSL 213.31□□□□□ -0.285e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 AC087163.3-201ENST00000624345 700 ntBASIC13.06□□□□□ -0.324e-61■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 AC097374.1-202ENST00000582835 3329 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.55e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-217ENST00000459901 3936 ntTSL 411.09□□□□□ -0.635e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 FAM9B-204ENST00000461107 3592 ntTSL 210.24□□□□□ -0.775e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 FAM9B-205ENST00000472522 1533 ntTSL 510.23□□□□□ -0.775e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.985e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.035e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SUPT5H-214ENST00000598786 238 ntTSL 58.59□□□□□ -1.034e-61■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.092e-12■■■■■ 744.3
UTP3Q9NQZ2 VAMP8-201ENST00000263864 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.622e-12■■■■■ 744.3
UTP3Q9NQZ2 VAMP8-202ENST00000409760 805 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.792e-12■■■■■ 744.3
UTP3Q9NQZ2 PFKFB4-209ENST00000467176 643 ntTSL 315.35■□□□□ 0.053e-18■■■■■ 742.2
UTP3Q9NQZ2 AC007780.1-201ENST00000590353 719 ntTSL 49.96□□□□□ -0.821e-10■■■■■ 739.1
UTP3Q9NQZ2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.694e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.234e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 HADHB-201ENST00000317799 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.364e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 HADHB-202ENST00000405867 1588 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.514e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 HADHB-207ENST00000494615 2883 ntTSL 27.74□□□□□ -1.174e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 DPEP1-207ENST00000565249 1165 ntTSL 220.92■□□□□ 0.948e-16■■■■■ 726.7
UTP3Q9NQZ2 DPEP1-205ENST00000564281 1772 ntTSL 519.21■□□□□ 0.678e-16■■■■■ 726.7
UTP3Q9NQZ2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.558e-16■■■■■ 726.7
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3672.3 ms