Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 PIB2YGL023C 1908 nt15.7■□□□□ 0.1
TY2B-BQ12491 GOR1YNL274C 1053 nt15.69■□□□□ 0.1
TY2B-BQ12491 YCR102CYCR102C 1107 nt15.67■□□□□ 0.1
TY2B-BQ12491 UTH1YKR042W 1098 nt15.67■□□□□ 0.1
TY2B-BQ12491 YJL195CYJL195C 702 nt15.65■□□□□ 0.1
TY2B-BQ12491 CLB6YGR109C 1143 nt15.64■□□□□ 0.1
TY2B-BQ12491 TIR3YIL011W 810 nt15.58■□□□□ 0.08
TY2B-BQ12491 AAC1YMR056C 930 nt15.58■□□□□ 0.08
TY2B-BQ12491 CCA1YER168C 1641 nt15.58■□□□□ 0.08
TY2B-BQ12491 HIP1YGR191W 1812 nt15.58■□□□□ 0.08
TY2B-BQ12491 LOT5YKL183W 921 nt15.57■□□□□ 0.08
TY2B-BQ12491 CPD1YGR247W 720 nt15.56■□□□□ 0.08
TY2B-BQ12491 RAX1YOR301W 1308 nt15.55■□□□□ 0.08
TY2B-BQ12491 ESS1YJR017C 513 nt15.53■□□□□ 0.08
TY2B-BQ12491 YFL054CYFL054C 1941 nt15.51■□□□□ 0.07
TY2B-BQ12491 AQY2YLL052C 450 nt15.51■□□□□ 0.07
TY2B-BQ12491 SEN2YLR105C 1134 nt15.51■□□□□ 0.07
TY2B-BQ12491 RIB3YDR487C 627 nt15.49■□□□□ 0.07
TY2B-BQ12491 PUP1YOR157C 786 nt15.49■□□□□ 0.07
TY2B-BQ12491 PTK1YKL198C 1989 nt15.47■□□□□ 0.07
TY2B-BQ12491 NBP35YGL091C 987 nt15.47■□□□□ 0.07
TY2B-BQ12491 ZTA1YBR046C 1005 nt15.47■□□□□ 0.07
TY2B-BQ12491 TIF6YPR016C 738 nt15.46■□□□□ 0.07
TY2B-BQ12491 ATG15YCR068W 1563 nt15.42■□□□□ 0.06
TY2B-BQ12491 YEL008WYEL008W 381 nt15.41■□□□□ 0.06
TY2B-BQ12491 YPI1YFR003C 468 nt15.41■□□□□ 0.06
TY2B-BQ12491 POM34YLR018C 900 nt15.39■□□□□ 0.05
TY2B-BQ12491 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt15.39■□□□□ 0.05
TY2B-BQ12491 RDN18-1RDN18-1 1800 nt15.37■□□□□ 0.05
TY2B-BQ12491 RDN18-2RDN18-2 1800 nt15.37■□□□□ 0.05
TY2B-BQ12491 PRO1YDR300C 1287 nt15.33■□□□□ 0.04
TY2B-BQ12491 APT2YDR441C 546 nt15.33■□□□□ 0.04
TY2B-BQ12491 RIB2YOL066C 1776 nt15.29■□□□□ 0.04
TY2B-BQ12491 GND1YHR183W 1470 nt15.29■□□□□ 0.04
TY2B-BQ12491 MET28YIR017C 564 nt15.27■□□□□ 0.04
TY2B-BQ12491 AKR2YOR034C 2250 nt15.27■□□□□ 0.03
TY2B-BQ12491 DUS1YML080W 1272 nt15.26■□□□□ 0.03
TY2B-BQ12491 SWE1YJL187C 2460 nt15.26■□□□□ 0.03
TY2B-BQ12491 PGC1YPL206C 966 nt15.24■□□□□ 0.03
TY2B-BQ12491 NAP1YKR048C 1254 nt15.22■□□□□ 0.03
TY2B-BQ12491 PAU5YFL020C 369 nt15.21■□□□□ 0.02
TY2B-BQ12491 YML089CYML089C 369 nt15.21■□□□□ 0.02
TY2B-BQ12491 LSB3YFR024C-A 1380 nt15.19■□□□□ 0.02
TY2B-BQ12491 YJL055WYJL055W 738 nt15.15■□□□□ 0.02
TY2B-BQ12491 FIT3YOR383C 615 nt15.15■□□□□ 0.02
TY2B-BQ12491 SMM1YNR015W 1155 nt15.14■□□□□ 0.01
TY2B-BQ12491 ALD4YOR374W 1560 nt15.14■□□□□ 0.01
TY2B-BQ12491 LSC2YGR244C 1284 nt15.13■□□□□ 0.01
TY2B-BQ12491 YJR114WYJR114W 393 nt15.13■□□□□ 0.01
TY2B-BQ12491 UGA4YDL210W 1716 nt15.12■□□□□ 0.01
TY2B-BQ12491 STR3YGL184C 1398 nt15.12■□□□□ 0.01
TY2B-BQ12491 YJL064WYJL064W 396 nt15.09■□□□□ 0.01
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TY2B-BQ12491 PRY1YJL079C 900 nt15.08■□□□□ 0.01
TY2B-BQ12491 YBR232CYBR232C 360 nt15.07■□□□□ 0
TY2B-BQ12491 DIF1YLR437C 402 nt15.06■□□□□ 0
TY2B-BQ12491 PAU19YMR325W 375 nt15.03■□□□□ -0
TY2B-BQ12491 YCL074WYCL074W 927 nt15.02□□□□□ -0.01
TY2B-BQ12491 TIP1YBR067C 633 nt15.01□□□□□ -0.01
TY2B-BQ12491 GAP1YKR039W 1809 nt15□□□□□ -0.01
TY2B-BQ12491 YAR028WYAR028W 705 nt14.99□□□□□ -0.01
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TY2B-BQ12491 FCY21YER060W 1587 nt14.93□□□□□ -0.02
TY2B-BQ12491 HXT12YIL170W 1374 nt14.93□□□□□ -0.02
TY2B-BQ12491 PLB1YMR008C 1995 nt14.91□□□□□ -0.02
TY2B-BQ12491 THI72YOR192C 1800 nt14.89□□□□□ -0.03
TY2B-BQ12491 RTN2YDL204W 1182 nt14.89□□□□□ -0.03
TY2B-BQ12491 VRG4YGL225W 1014 nt14.88□□□□□ -0.03
TY2B-BQ12491 MTG2YHR168W 1557 nt14.88□□□□□ -0.03
TY2B-BQ12491 UTR1YJR049C 1593 nt14.83□□□□□ -0.03
TY2B-BQ12491 HSP60YLR259C 1719 nt14.83□□□□□ -0.04
TY2B-BQ12491 CCT5YJR064W 1689 nt14.82□□□□□ -0.04
TY2B-BQ12491 ALP1YNL270C 1722 nt14.81□□□□□ -0.04
TY2B-BQ12491 TIM44YIL022W 1296 nt14.8□□□□□ -0.04
TY2B-BQ12491 ERG6YML008C 1152 nt14.8□□□□□ -0.04
TY2B-BQ12491 YJL118WYJL118W 660 nt14.77□□□□□ -0.05
TY2B-BQ12491 MEP3YPR138C 1470 nt14.76□□□□□ -0.05
TY2B-BQ12491 STP3YLR375W 1032 nt14.71□□□□□ -0.05
TY2B-BQ12491 YER190C-AYER190C-A 576 nt14.69□□□□□ -0.06
TY2B-BQ12491 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt14.69□□□□□ -0.06
TY2B-BQ12491 YML133W-AYML133W-A 576 nt14.69□□□□□ -0.06
TY2B-BQ12491 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt14.69□□□□□ -0.06
TY2B-BQ12491 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt14.69□□□□□ -0.06
TY2B-BQ12491 SED1YDR077W 1017 nt14.68□□□□□ -0.06
TY2B-BQ12491 SNZ1YMR096W 894 nt14.68□□□□□ -0.06
TY2B-BQ12491 PRM5YIL117C 957 nt14.67□□□□□ -0.06
TY2B-BQ12491 FUR4YBR021W 1902 nt14.62□□□□□ -0.07
TY2B-BQ12491 YPL251WYPL251W 303 nt14.61□□□□□ -0.07
TY2B-BQ12491 GAL3YDR009W 1563 nt14.61□□□□□ -0.07
TY2B-BQ12491 POP2YNR052C 1302 nt14.59□□□□□ -0.07
TY2B-BQ12491 RIB1YBL033C 1038 nt14.58□□□□□ -0.08
TY2B-BQ12491 YMR262WYMR262W 942 nt14.57□□□□□ -0.08
TY2B-BQ12491 LSB5YCL034W 1065 nt14.57□□□□□ -0.08
TY2B-BQ12491 APS2YJR058C 444 nt14.57□□□□□ -0.08
TY2B-BQ12491 TAF13YML098W 504 nt14.53□□□□□ -0.08
TY2B-BQ12491 CSM1YCR086W 573 nt14.52□□□□□ -0.09
TY2B-BQ12491 YER152W-AYER152W-A 567 nt14.5□□□□□ -0.09
TY2B-BQ12491 SOD2YHR008C 702 nt14.5□□□□□ -0.09
TY2B-BQ12491 SAM3YPL274W 1764 nt14.5□□□□□ -0.09
TY2B-BQ12491 YGR259CYGR259C 441 nt14.46□□□□□ -0.09
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