Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 PHO89YBR296C 1725 nt10.18□□□□□ -0.78
LDB17Q12342 YGL034CYGL034C 366 nt10.15□□□□□ -0.78
LDB17Q12342 POM34YLR018C 900 nt10.15□□□□□ -0.78
LDB17Q12342 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.13□□□□□ -0.79
LDB17Q12342 PBP1YGR178C 2169 nt10.13□□□□□ -0.79
LDB17Q12342 PLB1YMR008C 1995 nt10.12□□□□□ -0.79
LDB17Q12342 YCR087WYCR087W 516 nt10.12□□□□□ -0.79
LDB17Q12342 XYL2YLR070C 1071 nt10.11□□□□□ -0.79
LDB17Q12342 PRO1YDR300C 1287 nt10.1□□□□□ -0.79
LDB17Q12342 COQ2YNR041C 1119 nt10.1□□□□□ -0.79
LDB17Q12342 YML089CYML089C 369 nt10.09□□□□□ -0.79
LDB17Q12342 CYT2YKL087C 675 nt10.07□□□□□ -0.8
LDB17Q12342 TOM6YOR045W 186 nt10.06□□□□□ -0.8
LDB17Q12342 AIM45YPR004C 1035 nt10.06□□□□□ -0.8
LDB17Q12342 GAP1YKR039W 1809 nt10.05□□□□□ -0.8
LDB17Q12342 MRP20YDR405W 792 nt10.05□□□□□ -0.8
LDB17Q12342 ATG15YCR068W 1563 nt10.01□□□□□ -0.81
LDB17Q12342 HIP1YGR191W 1812 nt10□□□□□ -0.81
LDB17Q12342 TIF6YPR016C 738 nt9.99□□□□□ -0.81
LDB17Q12342 UTR1YJR049C 1593 nt9.98□□□□□ -0.81
LDB17Q12342 RPL4BYDR012W 1089 nt9.98□□□□□ -0.81
LDB17Q12342 PEX2YJL210W 816 nt9.98□□□□□ -0.81
LDB17Q12342 RPL4AYBR031W 1089 nt9.98□□□□□ -0.81
LDB17Q12342 RBG1YAL036C 1110 nt9.97□□□□□ -0.81
LDB17Q12342 SBA1YKL117W 651 nt9.97□□□□□ -0.81
LDB17Q12342 NDI1YML120C 1542 nt9.93□□□□□ -0.82
LDB17Q12342 CLB6YGR109C 1143 nt9.93□□□□□ -0.82
LDB17Q12342 RPS14BYJL191W 417 nt9.93□□□□□ -0.82
LDB17Q12342 UTH1YKR042W 1098 nt9.93□□□□□ -0.82
LDB17Q12342 PRM5YIL117C 957 nt9.92□□□□□ -0.82
LDB17Q12342 MET28YIR017C 564 nt9.92□□□□□ -0.82
LDB17Q12342 DIF1YLR437C 402 nt9.92□□□□□ -0.82
LDB17Q12342 NRT1YOR071C 1797 nt9.89□□□□□ -0.83
LDB17Q12342 CMP2YML057W 1815 nt9.89□□□□□ -0.83
LDB17Q12342 ALD4YOR374W 1560 nt9.85□□□□□ -0.83
LDB17Q12342 SAM35YHR083W 990 nt9.85□□□□□ -0.83
LDB17Q12342 HIF1YLL022C 1158 nt9.84□□□□□ -0.83
LDB17Q12342 GLR1YPL091W 1452 nt9.84□□□□□ -0.83
LDB17Q12342 YAT1YAR035W 2064 nt9.83□□□□□ -0.84
LDB17Q12342 YAR028WYAR028W 705 nt9.82□□□□□ -0.84
LDB17Q12342 FIT3YOR383C 615 nt9.82□□□□□ -0.84
LDB17Q12342 YMR244WYMR244W 1068 nt9.81□□□□□ -0.84
LDB17Q12342 HSL7YBR133C 2484 nt9.81□□□□□ -0.84
LDB17Q12342 TSC10YBR265W 963 nt9.79□□□□□ -0.84
LDB17Q12342 MTG2YHR168W 1557 nt9.78□□□□□ -0.84
LDB17Q12342 FRE6YLL051C 2139 nt9.77□□□□□ -0.84
LDB17Q12342 DBP1YPL119C 1854 nt9.76□□□□□ -0.85
LDB17Q12342 YLR279WYLR279W 390 nt9.75□□□□□ -0.85
LDB17Q12342 ALP1YNL270C 1722 nt9.74□□□□□ -0.85
LDB17Q12342 ZTA1YBR046C 1005 nt9.73□□□□□ -0.85
LDB17Q12342 YGR012WYGR012W 1182 nt9.72□□□□□ -0.85
LDB17Q12342 RAD23YEL037C 1197 nt9.71□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 SDH5YOL071W 489 nt9.71□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 AKR2YOR034C 2250 nt9.7□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 SED1YDR077W 1017 nt9.7□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.69□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.69□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.69□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 YMR226CYMR226C 804 nt9.69□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.69□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.69□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 HXT1YHR094C 1713 nt9.68□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 MSB4YOL112W 1479 nt9.67□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 LIP1YMR298W 453 nt9.67□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 YBL086CYBL086C 1401 nt9.65□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 YLR111WYLR111W 333 nt9.65□□□□□ -0.86
LDB17Q12342 CAB5YDR196C 726 nt9.64□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 RBG2YGR173W 1107 nt9.64□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.64□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.64□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 RPC82YPR190C 1965 nt9.63□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 ZRT3YKL175W 1512 nt9.63□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 SPT20YOL148C 1815 nt9.62□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 LEU9YOR108W 1815 nt9.62□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 RIB3YDR487C 627 nt9.62□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.61□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 INA1YLR413W 2028 nt9.61□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 SHY1YGR112W 1170 nt9.6□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 YPL251WYPL251W 303 nt9.6□□□□□ -0.87
LDB17Q12342 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.57□□□□□ -0.88
LDB17Q12342 FCY21YER060W 1587 nt9.56□□□□□ -0.88
LDB17Q12342 UFO1YML088W 2007 nt9.55□□□□□ -0.88
LDB17Q12342 APT2YDR441C 546 nt9.55□□□□□ -0.88
LDB17Q12342 BRR1YPR057W 1026 nt9.55□□□□□ -0.88
LDB17Q12342 SAM1YLR180W 1149 nt9.54□□□□□ -0.88
LDB17Q12342 UGA4YDL210W 1716 nt9.52□□□□□ -0.89
LDB17Q12342 URA6YKL024C 615 nt9.52□□□□□ -0.89
LDB17Q12342 YJL067WYJL067W 351 nt9.51□□□□□ -0.89
LDB17Q12342 TOA2YKL058W 369 nt9.5□□□□□ -0.89
LDB17Q12342 GND1YHR183W 1470 nt9.48□□□□□ -0.89
LDB17Q12342 YMR103CYMR103C 363 nt9.48□□□□□ -0.89
LDB17Q12342 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.47□□□□□ -0.89
LDB17Q12342 MEP3YPR138C 1470 nt9.47□□□□□ -0.89
LDB17Q12342 HEL2YDR266C 1920 nt9.46□□□□□ -0.89
LDB17Q12342 GND2YGR256W 1479 nt9.45□□□□□ -0.9
LDB17Q12342 SMM1YNR015W 1155 nt9.44□□□□□ -0.9
LDB17Q12342 OYE3YPL171C 1203 nt9.44□□□□□ -0.9
LDB17Q12342 SSN3YPL042C 1668 nt9.43□□□□□ -0.9
LDB17Q12342 LOT5YKL183W 921 nt9.43□□□□□ -0.9
LDB17Q12342 PRY1YJL079C 900 nt9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.2 ms