Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 VPS75YNL246W 795 nt9.41□□□□□ -0.9
HER1Q12276 MUP1YGR055W 1725 nt9.39□□□□□ -0.91
HER1Q12276 SSN3YPL042C 1668 nt9.39□□□□□ -0.91
HER1Q12276 BSP1YPR171W 1731 nt9.39□□□□□ -0.91
HER1Q12276 YGL114WYGL114W 2178 nt9.39□□□□□ -0.91
HER1Q12276 DAT1YML113W 747 nt9.38□□□□□ -0.91
HER1Q12276 NBP35YGL091C 987 nt9.36□□□□□ -0.91
HER1Q12276 ZRT3YKL175W 1512 nt9.36□□□□□ -0.91
HER1Q12276 NIT1YIL164C 600 nt9.34□□□□□ -0.91
HER1Q12276 YCR102CYCR102C 1107 nt9.32□□□□□ -0.92
HER1Q12276 SGT2YOR007C 1041 nt9.31□□□□□ -0.92
HER1Q12276 UTR1YJR049C 1593 nt9.31□□□□□ -0.92
HER1Q12276 MSF1YPR047W 1410 nt9.31□□□□□ -0.92
HER1Q12276 SAM35YHR083W 990 nt9.3□□□□□ -0.92
HER1Q12276 HOL1YNR055C 1761 nt9.29□□□□□ -0.92
HER1Q12276 PAU7YAR020C 168 nt9.27□□□□□ -0.93
HER1Q12276 YJL067WYJL067W 351 nt9.26□□□□□ -0.93
HER1Q12276 MIR1YJR077C 936 nt9.26□□□□□ -0.93
HER1Q12276 YMR244WYMR244W 1068 nt9.26□□□□□ -0.93
HER1Q12276 THI74YDR438W 1113 nt9.24□□□□□ -0.93
HER1Q12276 MAE1YKL029C 2010 nt9.23□□□□□ -0.93
HER1Q12276 YNL024CYNL024C 741 nt9.22□□□□□ -0.93
HER1Q12276 GAP1YKR039W 1809 nt9.21□□□□□ -0.94
HER1Q12276 SHB17YKR043C 816 nt9.19□□□□□ -0.94
HER1Q12276 ILV3YJR016C 1758 nt9.17□□□□□ -0.94
HER1Q12276 YDR010CYDR010C 333 nt9.17□□□□□ -0.94
HER1Q12276 LSC2YGR244C 1284 nt9.17□□□□□ -0.94
HER1Q12276 GLR1YPL091W 1452 nt9.15□□□□□ -0.94
HER1Q12276 UBA4YHR111W 1323 nt9.15□□□□□ -0.94
HER1Q12276 TIR3YIL011W 810 nt9.13□□□□□ -0.95
HER1Q12276 YOR325WYOR325W 474 nt9.13□□□□□ -0.95
HER1Q12276 HXT1YHR094C 1713 nt9.12□□□□□ -0.95
HER1Q12276 YMR209CYMR209C 1374 nt9.12□□□□□ -0.95
HER1Q12276 RET2YFR051C 1641 nt9.1□□□□□ -0.95
HER1Q12276 PRO1YDR300C 1287 nt9.1□□□□□ -0.95
HER1Q12276 HIS2YFR025C 1008 nt9.1□□□□□ -0.95
HER1Q12276 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.1□□□□□ -0.95
HER1Q12276 MET2YNL277W 1461 nt9.08□□□□□ -0.96
HER1Q12276 RBG2YGR173W 1107 nt9.08□□□□□ -0.96
HER1Q12276 YSR3YKR053C 1215 nt9.08□□□□□ -0.96
HER1Q12276 ACO2YJL200C 2370 nt9.08□□□□□ -0.96
HER1Q12276 DBP1YPL119C 1854 nt9.08□□□□□ -0.96
HER1Q12276 COQ8YGL119W 1506 nt9.07□□□□□ -0.96
HER1Q12276 SHY1YGR112W 1170 nt9.07□□□□□ -0.96
HER1Q12276 PHO89YBR296C 1725 nt9.06□□□□□ -0.96
HER1Q12276 YGL034CYGL034C 366 nt9.06□□□□□ -0.96
HER1Q12276 SHH4YLR164W 507 nt9.06□□□□□ -0.96
HER1Q12276 ATG15YCR068W 1563 nt9.04□□□□□ -0.96
HER1Q12276 UGP1YKL035W 1500 nt9.04□□□□□ -0.96
HER1Q12276 SFA1YDL168W 1161 nt9.03□□□□□ -0.96
HER1Q12276 OPI10YOL032W 741 nt9.03□□□□□ -0.96
HER1Q12276 POM34YLR018C 900 nt9.02□□□□□ -0.97
HER1Q12276 DIF1YLR437C 402 nt9.02□□□□□ -0.97
HER1Q12276 YCR087WYCR087W 516 nt9.01□□□□□ -0.97
HER1Q12276 CWC15YDR163W 528 nt9.01□□□□□ -0.97
HER1Q12276 XYL2YLR070C 1071 nt9.01□□□□□ -0.97
HER1Q12276 GID7YCL039W 2238 nt9.01□□□□□ -0.97
HER1Q12276 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9□□□□□ -0.97
HER1Q12276 ARO8YGL202W 1503 nt9□□□□□ -0.97
HER1Q12276 CCT2YIL142W 1584 nt8.99□□□□□ -0.97
HER1Q12276 MRP20YDR405W 792 nt8.97□□□□□ -0.97
HER1Q12276 YML089CYML089C 369 nt8.97□□□□□ -0.97
HER1Q12276 COQ2YNR041C 1119 nt8.97□□□□□ -0.97
HER1Q12276 BET2YPR176C 978 nt8.97□□□□□ -0.97
HER1Q12276 KES1YPL145C 1305 nt8.97□□□□□ -0.97
HER1Q12276 YBL086CYBL086C 1401 nt8.96□□□□□ -0.98
HER1Q12276 SGA1YIL099W 1650 nt8.94□□□□□ -0.98
HER1Q12276 URA6YKL024C 615 nt8.94□□□□□ -0.98
HER1Q12276 LIP1YMR298W 453 nt8.94□□□□□ -0.98
HER1Q12276 AIM45YPR004C 1035 nt8.94□□□□□ -0.98
HER1Q12276 PSD1YNL169C 1503 nt8.94□□□□□ -0.98
HER1Q12276 RBG1YAL036C 1110 nt8.93□□□□□ -0.98
HER1Q12276 TOM6YOR045W 186 nt8.93□□□□□ -0.98
HER1Q12276 SFP1YLR403W 2052 nt8.92□□□□□ -0.98
HER1Q12276 CYT1YOR065W 930 nt8.9□□□□□ -0.98
HER1Q12276 SED1YDR077W 1017 nt8.89□□□□□ -0.99
HER1Q12276 YMR226CYMR226C 804 nt8.89□□□□□ -0.99
HER1Q12276 LSB6YJL100W 1824 nt8.87□□□□□ -0.99
HER1Q12276 RPL4BYDR012W 1089 nt8.87□□□□□ -0.99
HER1Q12276 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.87□□□□□ -0.99
HER1Q12276 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.87□□□□□ -0.99
HER1Q12276 SAM1YLR180W 1149 nt8.87□□□□□ -0.99
HER1Q12276 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.87□□□□□ -0.99
HER1Q12276 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.87□□□□□ -0.99
HER1Q12276 RPL4AYBR031W 1089 nt8.87□□□□□ -0.99
HER1Q12276 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.87□□□□□ -0.99
HER1Q12276 UFO1YML088W 2007 nt8.87□□□□□ -0.99
HER1Q12276 YHL008CYHL008C 1884 nt8.86□□□□□ -0.99
HER1Q12276 PEX2YJL210W 816 nt8.86□□□□□ -0.99
HER1Q12276 HIP1YGR191W 1812 nt8.86□□□□□ -0.99
HER1Q12276 RSC8YFR037C 1674 nt8.85□□□□□ -0.99
HER1Q12276 CLB6YGR109C 1143 nt8.85□□□□□ -0.99
HER1Q12276 DMA2YNL116W 1569 nt8.85□□□□□ -0.99
HER1Q12276 ESBP6YNL125C 2022 nt8.85□□□□□ -0.99
HER1Q12276 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.84□□□□□ -0.99
HER1Q12276 YAR028WYAR028W 705 nt8.84□□□□□ -0.99
HER1Q12276 PET8YNL003C 855 nt8.84□□□□□ -0.99
HER1Q12276 OYE3YPL171C 1203 nt8.84□□□□□ -0.99
HER1Q12276 TIF6YPR016C 738 nt8.84□□□□□ -0.99
HER1Q12276 TOA2YKL058W 369 nt8.82□□□□□ -1
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