Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 RBG1YAL036C 1110 nt10.75□□□□□ -0.69
SLX4Q12098 YGR259CYGR259C 441 nt10.74□□□□□ -0.69
SLX4Q12098 RTN2YDL204W 1182 nt10.73□□□□□ -0.69
SLX4Q12098 PRO1YDR300C 1287 nt10.72□□□□□ -0.69
SLX4Q12098 MRP20YDR405W 792 nt10.72□□□□□ -0.69
SLX4Q12098 TOM6YOR045W 186 nt10.72□□□□□ -0.69
SLX4Q12098 DPS1YLL018C 1674 nt10.72□□□□□ -0.69
SLX4Q12098 LSC2YGR244C 1284 nt10.71□□□□□ -0.69
SLX4Q12098 PLB1YMR008C 1995 nt10.7□□□□□ -0.7
SLX4Q12098 NDI1YML120C 1542 nt10.69□□□□□ -0.7
SLX4Q12098 NAR1YNL240C 1476 nt10.66□□□□□ -0.7
SLX4Q12098 PEX2YJL210W 816 nt10.65□□□□□ -0.7
SLX4Q12098 YMR244WYMR244W 1068 nt10.65□□□□□ -0.7
SLX4Q12098 HIP1YGR191W 1812 nt10.65□□□□□ -0.71
SLX4Q12098 YML089CYML089C 369 nt10.64□□□□□ -0.71
SLX4Q12098 GLR1YPL091W 1452 nt10.63□□□□□ -0.71
SLX4Q12098 GAP1YKR039W 1809 nt10.63□□□□□ -0.71
SLX4Q12098 ATG15YCR068W 1563 nt10.62□□□□□ -0.71
SLX4Q12098 RPL4BYDR012W 1089 nt10.61□□□□□ -0.71
SLX4Q12098 RPL4AYBR031W 1089 nt10.61□□□□□ -0.71
SLX4Q12098 SNF1YDR477W 1902 nt10.6□□□□□ -0.71
SLX4Q12098 RPS14BYJL191W 417 nt10.6□□□□□ -0.71
SLX4Q12098 BMT6YLR063W 1098 nt10.6□□□□□ -0.71
SLX4Q12098 TIF6YPR016C 738 nt10.6□□□□□ -0.71
SLX4Q12098 HSL7YBR133C 2484 nt10.56□□□□□ -0.72
SLX4Q12098 AAC1YMR056C 930 nt10.56□□□□□ -0.72
SLX4Q12098 IRC24YIR036C 792 nt10.55□□□□□ -0.72
SLX4Q12098 UTR1YJR049C 1593 nt10.55□□□□□ -0.72
SLX4Q12098 CLB6YGR109C 1143 nt10.54□□□□□ -0.72
SLX4Q12098 UTH1YKR042W 1098 nt10.54□□□□□ -0.72
SLX4Q12098 NRT1YOR071C 1797 nt10.52□□□□□ -0.73
SLX4Q12098 CMP2YML057W 1815 nt10.51□□□□□ -0.73
SLX4Q12098 MET28YIR017C 564 nt10.51□□□□□ -0.73
SLX4Q12098 DIF1YLR437C 402 nt10.5□□□□□ -0.73
SLX4Q12098 PRM5YIL117C 957 nt10.48□□□□□ -0.73
SLX4Q12098 BIO5YNR056C 1686 nt10.46□□□□□ -0.74
SLX4Q12098 HEL2YDR266C 1920 nt10.45□□□□□ -0.74
SLX4Q12098 CAB5YDR196C 726 nt10.43□□□□□ -0.74
SLX4Q12098 RBG2YGR173W 1107 nt10.43□□□□□ -0.74
SLX4Q12098 TSC10YBR265W 963 nt10.42□□□□□ -0.74
SLX4Q12098 YLR279WYLR279W 390 nt10.41□□□□□ -0.74
SLX4Q12098 SDH5YOL071W 489 nt10.41□□□□□ -0.74
SLX4Q12098 BSP1YPR171W 1731 nt10.4□□□□□ -0.74
SLX4Q12098 YGR012WYGR012W 1182 nt10.39□□□□□ -0.75
SLX4Q12098 MTG2YHR168W 1557 nt10.39□□□□□ -0.75
SLX4Q12098 YAR028WYAR028W 705 nt10.38□□□□□ -0.75
SLX4Q12098 YMR226CYMR226C 804 nt10.38□□□□□ -0.75
SLX4Q12098 FIT3YOR383C 615 nt10.38□□□□□ -0.75
SLX4Q12098 ZTA1YBR046C 1005 nt10.38□□□□□ -0.75
SLX4Q12098 RAD23YEL037C 1197 nt10.36□□□□□ -0.75
SLX4Q12098 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.36□□□□□ -0.75
SLX4Q12098 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.36□□□□□ -0.75
SLX4Q12098 MSB4YOL112W 1479 nt10.36□□□□□ -0.75
SLX4Q12098 YLR111WYLR111W 333 nt10.34□□□□□ -0.75
SLX4Q12098 HIF1YLL022C 1158 nt10.33□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.33□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 ALD4YOR374W 1560 nt10.31□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.31□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.31□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 SAM35YHR083W 990 nt10.31□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.31□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.31□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.31□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 MET2YNL277W 1461 nt10.3□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 ALP1YNL270C 1722 nt10.3□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 AKR2YOR034C 2250 nt10.3□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 DBP1YPL119C 1854 nt10.29□□□□□ -0.76
SLX4Q12098 RIB3YDR487C 627 nt10.27□□□□□ -0.77
SLX4Q12098 PBP1YGR178C 2169 nt10.26□□□□□ -0.77
SLX4Q12098 YAT1YAR035W 2064 nt10.26□□□□□ -0.77
SLX4Q12098 SSN3YPL042C 1668 nt10.25□□□□□ -0.77
SLX4Q12098 SED1YDR077W 1017 nt10.24□□□□□ -0.77
SLX4Q12098 CYT2YKL087C 675 nt10.24□□□□□ -0.77
SLX4Q12098 NME1NME1 340 nt10.23□□□□□ -0.77
SLX4Q12098 SFP1YLR403W 2052 nt10.22□□□□□ -0.77
SLX4Q12098 LIP1YMR298W 453 nt10.21□□□□□ -0.77
SLX4Q12098 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.21□□□□□ -0.77
SLX4Q12098 YBL086CYBL086C 1401 nt10.21□□□□□ -0.78
SLX4Q12098 HXT1YHR094C 1713 nt10.19□□□□□ -0.78
SLX4Q12098 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.19□□□□□ -0.78
SLX4Q12098 YPL251WYPL251W 303 nt10.18□□□□□ -0.78
SLX4Q12098 FCY21YER060W 1587 nt10.16□□□□□ -0.78
SLX4Q12098 UGA4YDL210W 1716 nt10.16□□□□□ -0.78
SLX4Q12098 LEU9YOR108W 1815 nt10.14□□□□□ -0.79
SLX4Q12098 NPP1YCR026C 2229 nt10.14□□□□□ -0.79
SLX4Q12098 GND1YHR183W 1470 nt10.13□□□□□ -0.79
SLX4Q12098 SAM1YLR180W 1149 nt10.13□□□□□ -0.79
SLX4Q12098 SHY1YGR112W 1170 nt10.12□□□□□ -0.79
SLX4Q12098 GID7YCL039W 2238 nt10.1□□□□□ -0.79
SLX4Q12098 LOT5YKL183W 921 nt10.1□□□□□ -0.79
SLX4Q12098 BRR1YPR057W 1026 nt10.1□□□□□ -0.79
SLX4Q12098 SMM1YNR015W 1155 nt10.09□□□□□ -0.79
SLX4Q12098 Q0010Q0010 387 nt10.09□□□□□ -0.79
SLX4Q12098 UFO1YML088W 2007 nt10.09□□□□□ -0.79
SLX4Q12098 YMR103CYMR103C 363 nt10.07□□□□□ -0.8
SLX4Q12098 APT2YDR441C 546 nt10.06□□□□□ -0.8
SLX4Q12098 TOA2YKL058W 369 nt10.06□□□□□ -0.8
SLX4Q12098 MEP3YPR138C 1470 nt10.05□□□□□ -0.8
SLX4Q12098 ZRT3YKL175W 1512 nt10.05□□□□□ -0.8
SLX4Q12098 PRY1YJL079C 900 nt10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.7 ms