Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 RPL4AYBR031W 1089 nt10.43□□□□□ -0.74
SPE3Q12074 SFA1YDL168W 1161 nt10.4□□□□□ -0.74
SPE3Q12074 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.39□□□□□ -0.75
SPE3Q12074 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.39□□□□□ -0.75
SPE3Q12074 NBP35YGL091C 987 nt10.36□□□□□ -0.75
SPE3Q12074 PRP4YPR178W 1398 nt10.36□□□□□ -0.75
SPE3Q12074 UTH1YKR042W 1098 nt10.34□□□□□ -0.75
SPE3Q12074 YKR005CYKR005C 1578 nt10.34□□□□□ -0.75
SPE3Q12074 BMT6YLR063W 1098 nt10.33□□□□□ -0.76
SPE3Q12074 YGR259CYGR259C 441 nt10.32□□□□□ -0.76
SPE3Q12074 RAD23YEL037C 1197 nt10.31□□□□□ -0.76
SPE3Q12074 RPS14BYJL191W 417 nt10.31□□□□□ -0.76
SPE3Q12074 RTN2YDL204W 1182 nt10.3□□□□□ -0.76
SPE3Q12074 TIR3YIL011W 810 nt10.29□□□□□ -0.76
SPE3Q12074 DPS1YLL018C 1674 nt10.28□□□□□ -0.76
SPE3Q12074 TOM6YOR045W 186 nt10.27□□□□□ -0.77
SPE3Q12074 TSC10YBR265W 963 nt10.27□□□□□ -0.77
SPE3Q12074 NAR1YNL240C 1476 nt10.26□□□□□ -0.77
SPE3Q12074 PEX2YJL210W 816 nt10.26□□□□□ -0.77
SPE3Q12074 NRT1YOR071C 1797 nt10.24□□□□□ -0.77
SPE3Q12074 LSC2YGR244C 1284 nt10.24□□□□□ -0.77
SPE3Q12074 SHH4YLR164W 507 nt10.24□□□□□ -0.77
SPE3Q12074 YGR012WYGR012W 1182 nt10.23□□□□□ -0.77
SPE3Q12074 ARP6YLR085C 1317 nt10.22□□□□□ -0.77
SPE3Q12074 YML089CYML089C 369 nt10.2□□□□□ -0.78
SPE3Q12074 AAC1YMR056C 930 nt10.2□□□□□ -0.78
SPE3Q12074 HIP1YGR191W 1812 nt10.19□□□□□ -0.78
SPE3Q12074 STE4YOR212W 1272 nt10.18□□□□□ -0.78
SPE3Q12074 IRC24YIR036C 792 nt10.17□□□□□ -0.78
SPE3Q12074 POM34YLR018C 900 nt10.17□□□□□ -0.78
SPE3Q12074 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.17□□□□□ -0.78
SPE3Q12074 ATG15YCR068W 1563 nt10.17□□□□□ -0.78
SPE3Q12074 PRO1YDR300C 1287 nt10.16□□□□□ -0.78
SPE3Q12074 RIB3YDR487C 627 nt10.16□□□□□ -0.78
SPE3Q12074 PLB1YMR008C 1995 nt10.15□□□□□ -0.78
SPE3Q12074 MET28YIR017C 564 nt10.15□□□□□ -0.78
SPE3Q12074 RAD51YER095W 1203 nt10.14□□□□□ -0.79
SPE3Q12074 RPM1RPM1 483 nt10.14□□□□□ -0.79
SPE3Q12074 GAP1YKR039W 1809 nt10.12□□□□□ -0.79
SPE3Q12074 ADH7YCR105W 1086 nt10.11□□□□□ -0.79
SPE3Q12074 YNR029CYNR029C 1290 nt10.11□□□□□ -0.79
SPE3Q12074 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.11□□□□□ -0.79
SPE3Q12074 PAU15YIR041W 375 nt10.09□□□□□ -0.79
SPE3Q12074 YJL195CYJL195C 702 nt10.09□□□□□ -0.79
SPE3Q12074 FUN14YAL008W 597 nt10.08□□□□□ -0.8
SPE3Q12074 FIT3YOR383C 615 nt10.08□□□□□ -0.8
SPE3Q12074 TIF6YPR016C 738 nt10.08□□□□□ -0.8
SPE3Q12074 YLR279WYLR279W 390 nt10.07□□□□□ -0.8
SPE3Q12074 CAB5YDR196C 726 nt10.06□□□□□ -0.8
SPE3Q12074 YLR349WYLR349W 507 nt10.05□□□□□ -0.8
SPE3Q12074 BIO5YNR056C 1686 nt10.05□□□□□ -0.8
SPE3Q12074 SNF1YDR477W 1902 nt10.03□□□□□ -0.8
SPE3Q12074 MSB4YOL112W 1479 nt10.03□□□□□ -0.8
SPE3Q12074 YPI1YFR003C 468 nt10.02□□□□□ -0.81
SPE3Q12074 SAM35YHR083W 990 nt10.02□□□□□ -0.81
SPE3Q12074 PBP1YGR178C 2169 nt10.02□□□□□ -0.81
SPE3Q12074 UTR1YJR049C 1593 nt10.01□□□□□ -0.81
SPE3Q12074 LOT5YKL183W 921 nt9.99□□□□□ -0.81
SPE3Q12074 GPN2YOR262W 1044 nt9.99□□□□□ -0.81
SPE3Q12074 CYT2YKL087C 675 nt9.98□□□□□ -0.81
SPE3Q12074 ADH1YOL086C 1047 nt9.98□□□□□ -0.81
SPE3Q12074 CMP2YML057W 1815 nt9.96□□□□□ -0.81
SPE3Q12074 PRM5YIL117C 957 nt9.95□□□□□ -0.82
SPE3Q12074 DIF1YLR437C 402 nt9.94□□□□□ -0.82
SPE3Q12074 GND1YHR183W 1470 nt9.93□□□□□ -0.82
SPE3Q12074 HSL7YBR133C 2484 nt9.91□□□□□ -0.82
SPE3Q12074 YEL008WYEL008W 381 nt9.91□□□□□ -0.82
SPE3Q12074 CPD1YGR247W 720 nt9.91□□□□□ -0.82
SPE3Q12074 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.91□□□□□ -0.82
SPE3Q12074 ALD4YOR374W 1560 nt9.91□□□□□ -0.82
SPE3Q12074 YAR028WYAR028W 705 nt9.9□□□□□ -0.82
SPE3Q12074 FRE6YLL051C 2139 nt9.89□□□□□ -0.83
SPE3Q12074 ALP1YNL270C 1722 nt9.89□□□□□ -0.83
SPE3Q12074 AKR2YOR034C 2250 nt9.89□□□□□ -0.83
SPE3Q12074 APT2YDR441C 546 nt9.88□□□□□ -0.83
SPE3Q12074 HIF1YLL022C 1158 nt9.83□□□□□ -0.84
SPE3Q12074 SMM1YNR015W 1155 nt9.83□□□□□ -0.84
SPE3Q12074 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.83□□□□□ -0.84
SPE3Q12074 ZTA1YBR046C 1005 nt9.82□□□□□ -0.84
SPE3Q12074 MTG2YHR168W 1557 nt9.8□□□□□ -0.84
SPE3Q12074 SED1YDR077W 1017 nt9.8□□□□□ -0.84
SPE3Q12074 ESS1YJR017C 513 nt9.8□□□□□ -0.84
SPE3Q12074 HXT1YHR094C 1713 nt9.76□□□□□ -0.85
SPE3Q12074 YAT1YAR035W 2064 nt9.76□□□□□ -0.85
SPE3Q12074 RIB2YOL066C 1776 nt9.76□□□□□ -0.85
SPE3Q12074 LIP1YMR298W 453 nt9.76□□□□□ -0.85
SPE3Q12074 DBP1YPL119C 1854 nt9.74□□□□□ -0.85
SPE3Q12074 VRG4YGL225W 1014 nt9.72□□□□□ -0.85
SPE3Q12074 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.71□□□□□ -0.86
SPE3Q12074 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.71□□□□□ -0.86
SPE3Q12074 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.71□□□□□ -0.86
SPE3Q12074 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.71□□□□□ -0.86
SPE3Q12074 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.71□□□□□ -0.86
SPE3Q12074 FCY21YER060W 1587 nt9.71□□□□□ -0.86
SPE3Q12074 PRY1YJL079C 900 nt9.7□□□□□ -0.86
SPE3Q12074 NAP1YKR048C 1254 nt9.69□□□□□ -0.86
SPE3Q12074 SEN2YLR105C 1134 nt9.69□□□□□ -0.86
SPE3Q12074 ZRT3YKL175W 1512 nt9.68□□□□□ -0.86
SPE3Q12074 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.67□□□□□ -0.86
SPE3Q12074 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.67□□□□□ -0.86
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