Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 AAC1YMR056C 930 nt11.75□□□□□ -0.53
RIM20Q12033 MRP20YDR405W 792 nt11.74□□□□□ -0.53
RIM20Q12033 RBG1YAL036C 1110 nt11.74□□□□□ -0.53
RIM20Q12033 AIM45YPR004C 1035 nt11.74□□□□□ -0.53
RIM20Q12033 PEX2YJL210W 816 nt11.7□□□□□ -0.54
RIM20Q12033 GAP1YKR039W 1809 nt11.7□□□□□ -0.54
RIM20Q12033 IRC24YIR036C 792 nt11.69□□□□□ -0.54
RIM20Q12033 ATG15YCR068W 1563 nt11.69□□□□□ -0.54
RIM20Q12033 YJL225CYJL225C 5277 nt11.67□□□□□ -0.54
RIM20Q12033 NDI1YML120C 1542 nt11.67□□□□□ -0.54
RIM20Q12033 YML089CYML089C 369 nt11.67□□□□□ -0.54
RIM20Q12033 HIP1YGR191W 1812 nt11.65□□□□□ -0.55
RIM20Q12033 UTR1YJR049C 1593 nt11.63□□□□□ -0.55
RIM20Q12033 TIF6YPR016C 738 nt11.62□□□□□ -0.55
RIM20Q12033 ALG12YNR030W 1656 nt11.62□□□□□ -0.55
RIM20Q12033 BIO5YNR056C 1686 nt11.62□□□□□ -0.55
RIM20Q12033 RPL4BYDR012W 1089 nt11.6□□□□□ -0.55
RIM20Q12033 RPL4AYBR031W 1089 nt11.6□□□□□ -0.55
RIM20Q12033 PRM5YIL117C 957 nt11.59□□□□□ -0.55
RIM20Q12033 RPS14BYJL191W 417 nt11.57□□□□□ -0.56
RIM20Q12033 CLB6YGR109C 1143 nt11.54□□□□□ -0.56
RIM20Q12033 UTH1YKR042W 1098 nt11.54□□□□□ -0.56
RIM20Q12033 GLR1YPL091W 1452 nt11.54□□□□□ -0.56
RIM20Q12033 NRT1YOR071C 1797 nt11.54□□□□□ -0.56
RIM20Q12033 DIF1YLR437C 402 nt11.53□□□□□ -0.56
RIM20Q12033 MET28YIR017C 564 nt11.51□□□□□ -0.57
RIM20Q12033 YMR244WYMR244W 1068 nt11.51□□□□□ -0.57
RIM20Q12033 HIF1YLL022C 1158 nt11.43□□□□□ -0.58
RIM20Q12033 SDH5YOL071W 489 nt11.42□□□□□ -0.58
RIM20Q12033 ALD4YOR374W 1560 nt11.41□□□□□ -0.58
RIM20Q12033 SAM35YHR083W 990 nt11.4□□□□□ -0.58
RIM20Q12033 YAR028WYAR028W 705 nt11.4□□□□□ -0.58
RIM20Q12033 ZTA1YBR046C 1005 nt11.4□□□□□ -0.58
RIM20Q12033 MTG2YHR168W 1557 nt11.39□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 TSC10YBR265W 963 nt11.38□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 PBP1YGR178C 2169 nt11.37□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 YLR279WYLR279W 390 nt11.37□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.36□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 YGR012WYGR012W 1182 nt11.36□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.36□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.36□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.36□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 FIT3YOR383C 615 nt11.36□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.36□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 NAR1YNL240C 1476 nt11.34□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 CAB5YDR196C 726 nt11.34□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 AKR2YOR034C 2250 nt11.34□□□□□ -0.59
RIM20Q12033 MSB4YOL112W 1479 nt11.32□□□□□ -0.6
RIM20Q12033 ALP1YNL270C 1722 nt11.31□□□□□ -0.6
RIM20Q12033 DBP1YPL119C 1854 nt11.31□□□□□ -0.6
RIM20Q12033 YLR111WYLR111W 333 nt11.3□□□□□ -0.6
RIM20Q12033 MCH5YOR306C 1566 nt11.29□□□□□ -0.6
RIM20Q12033 RBG2YGR173W 1107 nt11.29□□□□□ -0.6
RIM20Q12033 SED1YDR077W 1017 nt11.27□□□□□ -0.61
RIM20Q12033 RAD23YEL037C 1197 nt11.27□□□□□ -0.61
RIM20Q12033 HXT1YHR094C 1713 nt11.26□□□□□ -0.61
RIM20Q12033 CYT2YKL087C 675 nt11.26□□□□□ -0.61
RIM20Q12033 YMR226CYMR226C 804 nt11.26□□□□□ -0.61
RIM20Q12033 UME6YDR207C 2511 nt11.26□□□□□ -0.61
RIM20Q12033 LIP1YMR298W 453 nt11.25□□□□□ -0.61
RIM20Q12033 YBL086CYBL086C 1401 nt11.25□□□□□ -0.61
RIM20Q12033 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.22□□□□□ -0.61
RIM20Q12033 YPL251WYPL251W 303 nt11.19□□□□□ -0.62
RIM20Q12033 RIB3YDR487C 627 nt11.18□□□□□ -0.62
RIM20Q12033 SHY1YGR112W 1170 nt11.17□□□□□ -0.62
RIM20Q12033 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.17□□□□□ -0.62
RIM20Q12033 UGA4YDL210W 1716 nt11.15□□□□□ -0.63
RIM20Q12033 BRR1YPR057W 1026 nt11.14□□□□□ -0.63
RIM20Q12033 LEU9YOR108W 1815 nt11.14□□□□□ -0.63
RIM20Q12033 SAM1YLR180W 1149 nt11.13□□□□□ -0.63
RIM20Q12033 ZRT3YKL175W 1512 nt11.12□□□□□ -0.63
RIM20Q12033 YAT1YAR035W 2064 nt11.12□□□□□ -0.63
RIM20Q12033 TOA2YKL058W 369 nt11.11□□□□□ -0.63
RIM20Q12033 YMR103CYMR103C 363 nt11.1□□□□□ -0.63
RIM20Q12033 FCY21YER060W 1587 nt11.09□□□□□ -0.63
RIM20Q12033 MEP3YPR138C 1470 nt11.08□□□□□ -0.64
RIM20Q12033 UFO1YML088W 2007 nt11.08□□□□□ -0.64
RIM20Q12033 GND2YGR256W 1479 nt11.06□□□□□ -0.64
RIM20Q12033 YJL067WYJL067W 351 nt11.06□□□□□ -0.64
RIM20Q12033 GND1YHR183W 1470 nt11.06□□□□□ -0.64
RIM20Q12033 LOT5YKL183W 921 nt11.05□□□□□ -0.64
RIM20Q12033 SMM1YNR015W 1155 nt11.05□□□□□ -0.64
RIM20Q12033 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.02□□□□□ -0.65
RIM20Q12033 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.02□□□□□ -0.65
RIM20Q12033 PRY1YJL079C 900 nt11.01□□□□□ -0.65
RIM20Q12033 URA6YKL024C 615 nt11.01□□□□□ -0.65
RIM20Q12033 APT2YDR441C 546 nt11□□□□□ -0.65
RIM20Q12033 TRT2tT(CGU)K 72 nt11□□□□□ -0.65
RIM20Q12033 OYE3YPL171C 1203 nt10.98□□□□□ -0.65
RIM20Q12033 SSN3YPL042C 1668 nt10.95□□□□□ -0.66
RIM20Q12033 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.94□□□□□ -0.66
RIM20Q12033 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.94□□□□□ -0.66
RIM20Q12033 RPC82YPR190C 1965 nt10.92□□□□□ -0.66
RIM20Q12033 CSM1YCR086W 573 nt10.92□□□□□ -0.66
RIM20Q12033 BNI5YNL166C 1347 nt10.91□□□□□ -0.66
RIM20Q12033 PET8YNL003C 855 nt10.91□□□□□ -0.66
RIM20Q12033 YPI1YFR003C 468 nt10.9□□□□□ -0.66
RIM20Q12033 ADH1YOL086C 1047 nt10.9□□□□□ -0.66
RIM20Q12033 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.9□□□□□ -0.67
RIM20Q12033 INA1YLR413W 2028 nt10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.5 ms