Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 STR3YGL184C 1398 nt9.31□□□□□ -0.92
HDA2Q06629 YKR005CYKR005C 1578 nt9.3□□□□□ -0.92
HDA2Q06629 ABZ2YMR289W 1125 nt9.3□□□□□ -0.92
HDA2Q06629 FTH1YBR207W 1398 nt9.29□□□□□ -0.92
HDA2Q06629 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.28□□□□□ -0.92
HDA2Q06629 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.28□□□□□ -0.92
HDA2Q06629 DAT1YML113W 747 nt9.28□□□□□ -0.92
HDA2Q06629 DPS1YLL018C 1674 nt9.27□□□□□ -0.93
HDA2Q06629 THI74YDR438W 1113 nt9.27□□□□□ -0.93
HDA2Q06629 YGR259CYGR259C 441 nt9.27□□□□□ -0.93
HDA2Q06629 MSF1YPR047W 1410 nt9.26□□□□□ -0.93
HDA2Q06629 YCR102CYCR102C 1107 nt9.24□□□□□ -0.93
HDA2Q06629 YDR010CYDR010C 333 nt9.24□□□□□ -0.93
HDA2Q06629 SHB17YKR043C 816 nt9.24□□□□□ -0.93
HDA2Q06629 PAU7YAR020C 168 nt9.24□□□□□ -0.93
HDA2Q06629 AAC1YMR056C 930 nt9.23□□□□□ -0.93
HDA2Q06629 CMP2YML057W 1815 nt9.21□□□□□ -0.93
HDA2Q06629 UBA4YHR111W 1323 nt9.21□□□□□ -0.94
HDA2Q06629 NAS6YGR232W 687 nt9.2□□□□□ -0.94
HDA2Q06629 RTN2YDL204W 1182 nt9.19□□□□□ -0.94
HDA2Q06629 YTH1YPR107C 627 nt9.18□□□□□ -0.94
HDA2Q06629 BSP1YPR171W 1731 nt9.17□□□□□ -0.94
HDA2Q06629 NBP35YGL091C 987 nt9.16□□□□□ -0.94
HDA2Q06629 RET2YFR051C 1641 nt9.15□□□□□ -0.94
HDA2Q06629 IRC24YIR036C 792 nt9.14□□□□□ -0.95
HDA2Q06629 CYT2YKL087C 675 nt9.14□□□□□ -0.95
HDA2Q06629 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt9.13□□□□□ -0.95
HDA2Q06629 MAS1YLR163C 1389 nt9.12□□□□□ -0.95
HDA2Q06629 YGL034CYGL034C 366 nt9.12□□□□□ -0.95
HDA2Q06629 FAF1YIL019W 1041 nt9.12□□□□□ -0.95
HDA2Q06629 HSL7YBR133C 2484 nt9.12□□□□□ -0.95
HDA2Q06629 YSR3YKR053C 1215 nt9.1□□□□□ -0.95
HDA2Q06629 YMR244WYMR244W 1068 nt9.1□□□□□ -0.95
HDA2Q06629 SFA1YDL168W 1161 nt9.09□□□□□ -0.95
HDA2Q06629 PBP1YGR178C 2169 nt9.09□□□□□ -0.95
HDA2Q06629 PHO89YBR296C 1725 nt9.08□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 SSN3YPL042C 1668 nt9.08□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 SNF1YDR477W 1902 nt9.08□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 TIR3YIL011W 810 nt9.07□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 XYL2YLR070C 1071 nt9.07□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 ARP6YLR085C 1317 nt9.06□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 SHH4YLR164W 507 nt9.06□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 YHM2YMR241W 945 nt9.06□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 PUS5YLR165C 765 nt9.05□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 BUR6YER159C 429 nt9.04□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 PLB1YMR008C 1995 nt9.04□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 GLR1YPL091W 1452 nt9.03□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 BIO5YNR056C 1686 nt9.03□□□□□ -0.96
HDA2Q06629 YCR087WYCR087W 516 nt9.02□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 COQ2YNR041C 1119 nt9.02□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 FHN1YGR131W 525 nt9.01□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 LSC2YGR244C 1284 nt9.01□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 BNS1YGR230W 414 nt9□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 AIM45YPR004C 1035 nt9□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 PRO1YDR300C 1287 nt8.98□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 REC114YMR133W 1287 nt8.98□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 HEL2YDR266C 1920 nt8.97□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 POM34YLR018C 900 nt8.97□□□□□ -0.97
HDA2Q06629 RBG1YAL036C 1110 nt8.96□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 GAP1YKR039W 1809 nt8.96□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 MCM5YLR274W 2328 nt8.96□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 PUS7YOR243C 2031 nt8.95□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 MRP20YDR405W 792 nt8.95□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 NDI1YML120C 1542 nt8.95□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 ATG15YCR068W 1563 nt8.95□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 YML089CYML089C 369 nt8.94□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 YDR306CYDR306C 1437 nt8.94□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 RBG2YGR173W 1107 nt8.93□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 SRN2YLR119W 642 nt8.93□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 TOM6YOR045W 186 nt8.93□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 HMT1YBR034C 1047 nt8.93□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 PRM5YIL117C 957 nt8.92□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 ATG17YLR423C 1254 nt8.91□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 UTR1YJR049C 1593 nt8.9□□□□□ -0.98
HDA2Q06629 HIP1YGR191W 1812 nt8.89□□□□□ -0.99
HDA2Q06629 SAM35YHR083W 990 nt8.89□□□□□ -0.99
HDA2Q06629 KDX1YKL161C 1302 nt8.88□□□□□ -0.99
HDA2Q06629 RPL4BYDR012W 1089 nt8.88□□□□□ -0.99
HDA2Q06629 RPL4AYBR031W 1089 nt8.88□□□□□ -0.99
HDA2Q06629 ALD4YOR374W 1560 nt8.87□□□□□ -0.99
HDA2Q06629 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt8.87□□□□□ -0.99
HDA2Q06629 RPS14BYJL191W 417 nt8.87□□□□□ -0.99
HDA2Q06629 PEX2YJL210W 816 nt8.87□□□□□ -0.99
HDA2Q06629 TIF6YPR016C 738 nt8.85□□□□□ -0.99
HDA2Q06629 HIF1YLL022C 1158 nt8.83□□□□□ -1
HDA2Q06629 UTH1YKR042W 1098 nt8.82□□□□□ -1
HDA2Q06629 DIF1YLR437C 402 nt8.8□□□□□ -1
HDA2Q06629 MET28YIR017C 564 nt8.79□□□□□ -1
HDA2Q06629 YMR226CYMR226C 804 nt8.79□□□□□ -1
HDA2Q06629 YAT1YAR035W 2064 nt8.79□□□□□ -1
HDA2Q06629 NRT1YOR071C 1797 nt8.78□□□□□ -1
HDA2Q06629 MET2YNL277W 1461 nt8.78□□□□□ -1
HDA2Q06629 RMA1YKL132C 1293 nt8.78□□□□□ -1
HDA2Q06629 SFP1YLR403W 2052 nt8.77□□□□□ -1
HDA2Q06629 BMT5YIL096C 1011 nt8.77□□□□□ -1.01
HDA2Q06629 YPL071CYPL071C 471 nt8.76□□□□□ -1.01
HDA2Q06629 SPT20YOL148C 1815 nt8.75□□□□□ -1.01
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