Protein–RNA interactions for Protein: Q06147

LCB5, Sphingoid long chain base kinase 5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB5Q06147 AGP1YCL025C 1902 nt10.6□□□□□ -0.71
LCB5Q06147 PAU7YAR020C 168 nt10.6□□□□□ -0.71
LCB5Q06147 DUS1YML080W 1272 nt10.6□□□□□ -0.71
LCB5Q06147 YGL188CYGL188C 174 nt10.59□□□□□ -0.71
LCB5Q06147 PET20YPL159C 762 nt10.58□□□□□ -0.72
LCB5Q06147 BNA2YJR078W 1362 nt10.56□□□□□ -0.72
LCB5Q06147 YOR169CYOR169C 465 nt10.56□□□□□ -0.72
LCB5Q06147 DAT1YML113W 747 nt10.53□□□□□ -0.72
LCB5Q06147 ABZ2YMR289W 1125 nt10.53□□□□□ -0.72
LCB5Q06147 HEL2YDR266C 1920 nt10.52□□□□□ -0.73
LCB5Q06147 MIC12YBR262C 321 nt10.51□□□□□ -0.73
LCB5Q06147 SPT20YOL148C 1815 nt10.51□□□□□ -0.73
LCB5Q06147 SHM2YLR058C 1410 nt10.5□□□□□ -0.73
LCB5Q06147 XDJ1YLR090W 1380 nt10.5□□□□□ -0.73
LCB5Q06147 YLR122CYLR122C 378 nt10.48□□□□□ -0.73
LCB5Q06147 UBA4YHR111W 1323 nt10.48□□□□□ -0.73
LCB5Q06147 YGL034CYGL034C 366 nt10.46□□□□□ -0.73
LCB5Q06147 SHB17YKR043C 816 nt10.46□□□□□ -0.73
LCB5Q06147 ATP6Q0085 780 nt10.45□□□□□ -0.74
LCB5Q06147 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt10.45□□□□□ -0.74
LCB5Q06147 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.43□□□□□ -0.74
LCB5Q06147 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.43□□□□□ -0.74
LCB5Q06147 YSR3YKR053C 1215 nt10.43□□□□□ -0.74
LCB5Q06147 GDH3YAL062W 1374 nt10.42□□□□□ -0.74
LCB5Q06147 RPM1RPM1 483 nt10.42□□□□□ -0.74
LCB5Q06147 YGR201CYGR201C 678 nt10.41□□□□□ -0.74
LCB5Q06147 YMR244WYMR244W 1068 nt10.41□□□□□ -0.74
LCB5Q06147 SGT2YOR007C 1041 nt10.41□□□□□ -0.74
LCB5Q06147 HHO1YPL127C 777 nt10.41□□□□□ -0.74
LCB5Q06147 NIT1YIL164C 600 nt10.4□□□□□ -0.74
LCB5Q06147 STR3YGL184C 1398 nt10.39□□□□□ -0.75
LCB5Q06147 GLR1YPL091W 1452 nt10.39□□□□□ -0.75
LCB5Q06147 AIR1YIL079C 1083 nt10.39□□□□□ -0.75
LCB5Q06147 RPC82YPR190C 1965 nt10.38□□□□□ -0.75
LCB5Q06147 FRE6YLL051C 2139 nt10.38□□□□□ -0.75
LCB5Q06147 snR78snR78 87 nt10.36□□□□□ -0.75
LCB5Q06147 YDR010CYDR010C 333 nt10.36□□□□□ -0.75
LCB5Q06147 YNR068CYNR068C 819 nt10.36□□□□□ -0.75
LCB5Q06147 INA1YLR413W 2028 nt10.34□□□□□ -0.75
LCB5Q06147 RIM8YGL045W 1629 nt10.34□□□□□ -0.75
LCB5Q06147 YCR087WYCR087W 516 nt10.34□□□□□ -0.75
LCB5Q06147 XYL2YLR070C 1071 nt10.34□□□□□ -0.75
LCB5Q06147 UTP6YDR449C 1323 nt10.33□□□□□ -0.76
LCB5Q06147 RET2YFR051C 1641 nt10.33□□□□□ -0.76
LCB5Q06147 AVT6YER119C 1347 nt10.33□□□□□ -0.76
LCB5Q06147 PHO89YBR296C 1725 nt10.31□□□□□ -0.76
LCB5Q06147 RBG1YAL036C 1110 nt10.31□□□□□ -0.76
LCB5Q06147 YGL114WYGL114W 2178 nt10.28□□□□□ -0.76
LCB5Q06147 SKG1YKR100C 1068 nt10.27□□□□□ -0.77
LCB5Q06147 GOR1YNL274C 1053 nt10.27□□□□□ -0.77
LCB5Q06147 RTN2YDL204W 1182 nt10.26□□□□□ -0.77
LCB5Q06147 AIM45YPR004C 1035 nt10.26□□□□□ -0.77
LCB5Q06147 RBG2YGR173W 1107 nt10.24□□□□□ -0.77
LCB5Q06147 DUT1YBR252W 444 nt10.24□□□□□ -0.77
LCB5Q06147 MRP20YDR405W 792 nt10.22□□□□□ -0.77
LCB5Q06147 AQY2YLL052C 450 nt10.22□□□□□ -0.77
LCB5Q06147 KTR3YBR205W 1215 nt10.22□□□□□ -0.77
LCB5Q06147 MUP1YGR055W 1725 nt10.21□□□□□ -0.78
LCB5Q06147 YCR102CYCR102C 1107 nt10.2□□□□□ -0.78
LCB5Q06147 MAE1YKL029C 2010 nt10.17□□□□□ -0.78
LCB5Q06147 NEM1YHR004C 1341 nt10.17□□□□□ -0.78
LCB5Q06147 HIF1YLL022C 1158 nt10.17□□□□□ -0.78
LCB5Q06147 YMR226CYMR226C 804 nt10.17□□□□□ -0.78
LCB5Q06147 COQ2YNR041C 1119 nt10.16□□□□□ -0.78
LCB5Q06147 YPL168WYPL168W 1293 nt10.16□□□□□ -0.78
LCB5Q06147 TOM20YGR082W 552 nt10.14□□□□□ -0.79
LCB5Q06147 MET8YBR213W 825 nt10.14□□□□□ -0.79
LCB5Q06147 SFA1YDL168W 1161 nt10.13□□□□□ -0.79
LCB5Q06147 ALD4YOR374W 1560 nt10.1□□□□□ -0.79
LCB5Q06147 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.1□□□□□ -0.79
LCB5Q06147 HOL1YNR055C 1761 nt10.09□□□□□ -0.79
LCB5Q06147 RPL4BYDR012W 1089 nt10.08□□□□□ -0.8
LCB5Q06147 RPL4AYBR031W 1089 nt10.08□□□□□ -0.8
LCB5Q06147 PHO92YDR374C 921 nt10.07□□□□□ -0.8
LCB5Q06147 YLR111WYLR111W 333 nt10.07□□□□□ -0.8
LCB5Q06147 MET2YNL277W 1461 nt10.06□□□□□ -0.8
LCB5Q06147 CLB6YGR109C 1143 nt10.06□□□□□ -0.8
LCB5Q06147 URE2YNL229C 1065 nt10.06□□□□□ -0.8
LCB5Q06147 TIR3YIL011W 810 nt10.05□□□□□ -0.8
LCB5Q06147 NBP35YGL091C 987 nt10.03□□□□□ -0.8
LCB5Q06147 PRM5YIL117C 957 nt10.03□□□□□ -0.8
LCB5Q06147 PLB1YMR008C 1995 nt10.03□□□□□ -0.8
LCB5Q06147 YPL071CYPL071C 471 nt10.02□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 SDH5YOL071W 489 nt10.01□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 SHH4YLR164W 507 nt10□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 AST1YBL069W 1290 nt10□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 HMT1YBR034C 1047 nt10□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 ACO2YJL200C 2370 nt10□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 LCP5YER127W 1074 nt9.99□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 RPS14BYJL191W 417 nt9.99□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 UTH1YKR042W 1098 nt9.99□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 STD1YOR047C 1335 nt9.99□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 ZRT3YKL175W 1512 nt9.98□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 SAM1YLR180W 1149 nt9.98□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 SFP1YLR403W 2052 nt9.97□□□□□ -0.81
LCB5Q06147 YHL044WYHL044W 708 nt9.96□□□□□ -0.82
LCB5Q06147 TOM6YOR045W 186 nt9.95□□□□□ -0.82
LCB5Q06147 RAD23YEL037C 1197 nt9.94□□□□□ -0.82
LCB5Q06147 YML089CYML089C 369 nt9.94□□□□□ -0.82
LCB5Q06147 ARP6YLR085C 1317 nt9.93□□□□□ -0.82
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