Protein–RNA interactions for Protein: Q05498

FCF1, rRNA-processing protein FCF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FCF1Q05498 ARP6YLR085C 1317 nt7.54□□□□□ -1.2
FCF1Q05498 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.53□□□□□ -1.2
FCF1Q05498 NBP35YGL091C 987 nt7.53□□□□□ -1.2
FCF1Q05498 BDH1YAL060W 1149 nt7.53□□□□□ -1.2
FCF1Q05498 RIM8YGL045W 1629 nt7.52□□□□□ -1.2
FCF1Q05498 YCR102CYCR102C 1107 nt7.52□□□□□ -1.21
FCF1Q05498 YGL114WYGL114W 2178 nt7.5□□□□□ -1.21
FCF1Q05498 NIT1YIL164C 600 nt7.49□□□□□ -1.21
FCF1Q05498 UBX6YJL048C 1191 nt7.49□□□□□ -1.21
FCF1Q05498 ZRT3YKL175W 1512 nt7.48□□□□□ -1.21
FCF1Q05498 UTR1YJR049C 1593 nt7.48□□□□□ -1.21
FCF1Q05498 SAM35YHR083W 990 nt7.47□□□□□ -1.21
FCF1Q05498 SGT2YOR007C 1041 nt7.46□□□□□ -1.22
FCF1Q05498 MUP1YGR055W 1725 nt7.44□□□□□ -1.22
FCF1Q05498 YSP3YOR003W 1437 nt7.44□□□□□ -1.22
FCF1Q05498 TOK1YJL093C 2076 nt7.43□□□□□ -1.22
FCF1Q05498 GAL2YLR081W 1725 nt7.43□□□□□ -1.22
FCF1Q05498 ACO2YJL200C 2370 nt7.42□□□□□ -1.22
FCF1Q05498 GAP1YKR039W 1809 nt7.41□□□□□ -1.22
FCF1Q05498 YFR018CYFR018C 1092 nt7.39□□□□□ -1.23
FCF1Q05498 YJL067WYJL067W 351 nt7.39□□□□□ -1.23
FCF1Q05498 LSC2YGR244C 1284 nt7.38□□□□□ -1.23
FCF1Q05498 YDR094WYDR094W 336 nt7.37□□□□□ -1.23
FCF1Q05498 HOL1YNR055C 1761 nt7.37□□□□□ -1.23
FCF1Q05498 TIR3YIL011W 810 nt7.36□□□□□ -1.23
FCF1Q05498 PEX25YPL112C 1185 nt7.36□□□□□ -1.23
FCF1Q05498 THI72YOR192C 1800 nt7.36□□□□□ -1.23
FCF1Q05498 YNL024CYNL024C 741 nt7.34□□□□□ -1.23
FCF1Q05498 PRO1YDR300C 1287 nt7.33□□□□□ -1.24
FCF1Q05498 YNL115CYNL115C 1935 nt7.33□□□□□ -1.24
FCF1Q05498 HXT1YHR094C 1713 nt7.32□□□□□ -1.24
FCF1Q05498 SHH4YLR164W 507 nt7.31□□□□□ -1.24
FCF1Q05498 VPS75YNL246W 795 nt7.31□□□□□ -1.24
FCF1Q05498 ILV3YJR016C 1758 nt7.31□□□□□ -1.24
FCF1Q05498 ATG15YCR068W 1563 nt7.3□□□□□ -1.24
FCF1Q05498 DBP1YPL119C 1854 nt7.29□□□□□ -1.24
FCF1Q05498 YFL066CYFL066C 1179 nt7.28□□□□□ -1.24
FCF1Q05498 SHY1YGR112W 1170 nt7.27□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt7.27□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 POM34YLR018C 900 nt7.27□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 YOR325WYOR325W 474 nt7.27□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 HEM14YER014W 1620 nt7.27□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 DIF1YLR437C 402 nt7.26□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 YML089CYML089C 369 nt7.25□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 HIS2YFR025C 1008 nt7.24□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 PRE6YOL038W 765 nt7.24□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 YMR209CYMR209C 1374 nt7.23□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 RRT5YFR032C 870 nt7.23□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 NRT1YOR071C 1797 nt7.23□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 CWC15YDR163W 528 nt7.22□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 COQ8YGL119W 1506 nt7.22□□□□□ -1.25
FCF1Q05498 MRP20YDR405W 792 nt7.2□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 PAU7YAR020C 168 nt7.2□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 LIP1YMR298W 453 nt7.19□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 OPI10YOL032W 741 nt7.19□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 RET2YFR051C 1641 nt7.19□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.18□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 TOM6YOR045W 186 nt7.18□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 YBL086CYBL086C 1401 nt7.18□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 YHL008CYHL008C 1884 nt7.17□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 ARO8YGL202W 1503 nt7.17□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 CCT2YIL142W 1584 nt7.17□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 URA6YKL024C 615 nt7.17□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 PAU16YKL224C 372 nt7.17□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 UGP1YKL035W 1500 nt7.17□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 BET2YPR176C 978 nt7.16□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 SED1YDR077W 1017 nt7.15□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.15□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.15□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.15□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.15□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.15□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 KES1YPL145C 1305 nt7.15□□□□□ -1.26
FCF1Q05498 SFA1YDL168W 1161 nt7.14□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 MIR1YJR077C 936 nt7.14□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 YAR028WYAR028W 705 nt7.13□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 SAM1YLR180W 1149 nt7.13□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 FRA1YLL029W 2250 nt7.13□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 SGA1YIL099W 1650 nt7.12□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 HXK1YFR053C 1458 nt7.11□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 TIF6YPR016C 738 nt7.11□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 UFO1YML088W 2007 nt7.1□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 YDR010CYDR010C 333 nt7.1□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt7.1□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 PEX2YJL210W 816 nt7.1□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 TOA2YKL058W 369 nt7.1□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 PET8YNL003C 855 nt7.1□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 OYE3YPL171C 1203 nt7.1□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 PSD1YNL169C 1503 nt7.1□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 SHB17YKR043C 816 nt7.09□□□□□ -1.27
FCF1Q05498 CYT1YOR065W 930 nt7.08□□□□□ -1.28
FCF1Q05498 LEU9YOR108W 1815 nt7.08□□□□□ -1.28
FCF1Q05498 MTO1YGL236C 2010 nt7.08□□□□□ -1.28
FCF1Q05498 BRR1YPR057W 1026 nt7.07□□□□□ -1.28
FCF1Q05498 YRF1-2YER190W 5046 nt7.06□□□□□ -1.28
FCF1Q05498 LSB6YJL100W 1824 nt7.06□□□□□ -1.28
FCF1Q05498 THI74YDR438W 1113 nt7.06□□□□□ -1.28
FCF1Q05498 ALD5YER073W 1563 nt7.06□□□□□ -1.28
FCF1Q05498 MTG2YHR168W 1557 nt7.06□□□□□ -1.28
FCF1Q05498 GND2YGR256W 1479 nt7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.5 ms