Protein–RNA interactions for Protein: Q04336

YMR196W, Uncharacterized protein YMR196W, yeastyeast

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WQ04336 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt13.66□□□□□ -0.22
YMR196WQ04336 NRT1YOR071C 1797 nt13.65□□□□□ -0.22
YMR196WQ04336 SEC11YIR022W 504 nt13.64□□□□□ -0.23
YMR196WQ04336 RAX1YOR301W 1308 nt13.64□□□□□ -0.23
YMR196WQ04336 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.63□□□□□ -0.23
YMR196WQ04336 TOM6YOR045W 186 nt13.63□□□□□ -0.23
YMR196WQ04336 PEX2YJL210W 816 nt13.62□□□□□ -0.23
YMR196WQ04336 NCP1YHR042W 2076 nt13.62□□□□□ -0.23
YMR196WQ04336 YJR114WYJR114W 393 nt13.58□□□□□ -0.24
YMR196WQ04336 HIP1YGR191W 1812 nt13.57□□□□□ -0.24
YMR196WQ04336 SHH4YLR164W 507 nt13.54□□□□□ -0.24
YMR196WQ04336 AAC1YMR056C 930 nt13.54□□□□□ -0.24
YMR196WQ04336 TIR3YIL011W 810 nt13.52□□□□□ -0.25
YMR196WQ04336 LOT5YKL183W 921 nt13.51□□□□□ -0.25
YMR196WQ04336 MSB4YOL112W 1479 nt13.5□□□□□ -0.25
YMR196WQ04336 MET28YIR017C 564 nt13.49□□□□□ -0.25
YMR196WQ04336 CSM2YIL132C 642 nt13.48□□□□□ -0.25
YMR196WQ04336 TIM44YIL022W 1296 nt13.47□□□□□ -0.25
YMR196WQ04336 GND1YHR183W 1470 nt13.46□□□□□ -0.25
YMR196WQ04336 PAU5YFL020C 369 nt13.45□□□□□ -0.26
YMR196WQ04336 YJL064WYJL064W 396 nt13.44□□□□□ -0.26
YMR196WQ04336 DUT1YBR252W 444 nt13.44□□□□□ -0.26
YMR196WQ04336 YML089CYML089C 369 nt13.43□□□□□ -0.26
YMR196WQ04336 POM34YLR018C 900 nt13.42□□□□□ -0.26
YMR196WQ04336 PGC1YPL206C 966 nt13.42□□□□□ -0.26
YMR196WQ04336 APT2YDR441C 546 nt13.4□□□□□ -0.26
YMR196WQ04336 NBP35YGL091C 987 nt13.4□□□□□ -0.26
YMR196WQ04336 BOP3YNL042W 1191 nt13.4□□□□□ -0.26
YMR196WQ04336 YBR232CYBR232C 360 nt13.4□□□□□ -0.26
YMR196WQ04336 RIB1YBL033C 1038 nt13.37□□□□□ -0.27
YMR196WQ04336 SLG1YOR008C 1137 nt13.37□□□□□ -0.27
YMR196WQ04336 FIT3YOR383C 615 nt13.37□□□□□ -0.27
YMR196WQ04336 STP3YLR375W 1032 nt13.36□□□□□ -0.27
YMR196WQ04336 TIF6YPR016C 738 nt13.36□□□□□ -0.27
YMR196WQ04336 PAU19YMR325W 375 nt13.35□□□□□ -0.27
YMR196WQ04336 PCH2YBR186W 1695 nt13.34□□□□□ -0.27
YMR196WQ04336 PRO1YDR300C 1287 nt13.32□□□□□ -0.28
YMR196WQ04336 ATG15YCR068W 1563 nt13.3□□□□□ -0.28
YMR196WQ04336 ERG6YML008C 1152 nt13.3□□□□□ -0.28
YMR196WQ04336 LSC2YGR244C 1284 nt13.26□□□□□ -0.29
YMR196WQ04336 SOD2YHR008C 702 nt13.26□□□□□ -0.29
YMR196WQ04336 RIB2YOL066C 1776 nt13.25□□□□□ -0.29
YMR196WQ04336 LSB3YFR024C-A 1380 nt13.24□□□□□ -0.29
YMR196WQ04336 NVJ2YPR091C 2313 nt13.23□□□□□ -0.29
YMR196WQ04336 SMM1YNR015W 1155 nt13.23□□□□□ -0.29
YMR196WQ04336 RTF1YGL244W 1677 nt13.23□□□□□ -0.29
YMR196WQ04336 AGP1YCL025C 1902 nt13.23□□□□□ -0.29
YMR196WQ04336 PAC11YDR488C 1602 nt13.22□□□□□ -0.29
YMR196WQ04336 GUT2YIL155C 1950 nt13.19□□□□□ -0.3
YMR196WQ04336 YIA6YIL006W 1122 nt13.17□□□□□ -0.3
YMR196WQ04336 PAU21YOR394W 495 nt13.17□□□□□ -0.3
YMR196WQ04336 PAU22YPL282C 495 nt13.17□□□□□ -0.3
YMR196WQ04336 TIP1YBR067C 633 nt13.15□□□□□ -0.3
YMR196WQ04336 AQY2YLL052C 450 nt13.13□□□□□ -0.31
YMR196WQ04336 ALD4YOR374W 1560 nt13.11□□□□□ -0.31
YMR196WQ04336 CCA1YER168C 1641 nt13.07□□□□□ -0.32
YMR196WQ04336 QDR2YIL121W 1629 nt13.07□□□□□ -0.32
YMR196WQ04336 DUS1YML080W 1272 nt13.07□□□□□ -0.32
YMR196WQ04336 VRG4YGL225W 1014 nt13.06□□□□□ -0.32
YMR196WQ04336 BMT6YLR063W 1098 nt13.06□□□□□ -0.32
YMR196WQ04336 ALP1YNL270C 1722 nt13.04□□□□□ -0.32
YMR196WQ04336 BDF1YLR399C 2061 nt13.03□□□□□ -0.32
YMR196WQ04336 ARO7YPR060C 771 nt13.02□□□□□ -0.33
YMR196WQ04336 HXT12YIL170W 1374 nt13.01□□□□□ -0.33
YMR196WQ04336 STR3YGL184C 1398 nt12.99□□□□□ -0.33
YMR196WQ04336 FCY21YER060W 1587 nt12.98□□□□□ -0.33
YMR196WQ04336 GAP1YKR039W 1809 nt12.98□□□□□ -0.33
YMR196WQ04336 TAF13YML098W 504 nt12.98□□□□□ -0.33
YMR196WQ04336 CCT5YJR064W 1689 nt12.97□□□□□ -0.33
YMR196WQ04336 ZTA1YBR046C 1005 nt12.97□□□□□ -0.33
YMR196WQ04336 AKR2YOR034C 2250 nt12.97□□□□□ -0.33
YMR196WQ04336 POP2YNR052C 1302 nt12.96□□□□□ -0.33
YMR196WQ04336 YFL054CYFL054C 1941 nt12.96□□□□□ -0.34
YMR196WQ04336 PTK1YKL198C 1989 nt12.95□□□□□ -0.34
YMR196WQ04336 PIB2YGL023C 1908 nt12.95□□□□□ -0.34
YMR196WQ04336 PRY1YJL079C 900 nt12.94□□□□□ -0.34
YMR196WQ04336 YAR028WYAR028W 705 nt12.94□□□□□ -0.34
YMR196WQ04336 PAR32YDL173W 888 nt12.92□□□□□ -0.34
YMR196WQ04336 TAT1YBR069C 1860 nt12.91□□□□□ -0.34
YMR196WQ04336 YER152W-AYER152W-A 567 nt12.91□□□□□ -0.34
YMR196WQ04336 YJL055WYJL055W 738 nt12.9□□□□□ -0.34
YMR196WQ04336 THI72YOR192C 1800 nt12.89□□□□□ -0.35
YMR196WQ04336 ARP6YLR085C 1317 nt12.88□□□□□ -0.35
YMR196WQ04336 MTG2YHR168W 1557 nt12.86□□□□□ -0.35
YMR196WQ04336 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.84□□□□□ -0.35
YMR196WQ04336 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.84□□□□□ -0.35
YMR196WQ04336 BUD20YLR074C 501 nt12.84□□□□□ -0.35
YMR196WQ04336 YMR262WYMR262W 942 nt12.81□□□□□ -0.36
YMR196WQ04336 YCP4YCR004C 744 nt12.8□□□□□ -0.36
YMR196WQ04336 DIF1YLR437C 402 nt12.79□□□□□ -0.36
YMR196WQ04336 TUB4YLR212C 1422 nt12.78□□□□□ -0.36
YMR196WQ04336 YCL074WYCL074W 927 nt12.75□□□□□ -0.37
YMR196WQ04336 HSP60YLR259C 1719 nt12.74□□□□□ -0.37
YMR196WQ04336 SAM50YNL026W 1455 nt12.72□□□□□ -0.37
YMR196WQ04336 UGA4YDL210W 1716 nt12.72□□□□□ -0.37
YMR196WQ04336 GSF2YML048W 1212 nt12.71□□□□□ -0.37
YMR196WQ04336 PLB1YMR008C 1995 nt12.69□□□□□ -0.38
YMR196WQ04336 KRE1YNL322C 942 nt12.68□□□□□ -0.38
YMR196WQ04336 POT1YIL160C 1254 nt12.66□□□□□ -0.38
YMR196WQ04336 REG2YBR050C 1017 nt12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms