Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 PAU7YAR020C 168 nt9.07□□□□□ -0.96
RRN9P53437 YDR010CYDR010C 333 nt9.06□□□□□ -0.96
RRN9P53437 TIR3YIL011W 810 nt9.06□□□□□ -0.96
RRN9P53437 UBX6YJL048C 1191 nt9.06□□□□□ -0.96
RRN9P53437 HEL2YDR266C 1920 nt9.05□□□□□ -0.96
RRN9P53437 MIR1YJR077C 936 nt9.05□□□□□ -0.96
RRN9P53437 PAU16YKL224C 372 nt9.05□□□□□ -0.96
RRN9P53437 GID7YCL039W 2238 nt9.05□□□□□ -0.96
RRN9P53437 SHB17YKR043C 816 nt9.04□□□□□ -0.96
RRN9P53437 SHH4YLR164W 507 nt9.04□□□□□ -0.96
RRN9P53437 LSC2YGR244C 1284 nt9.03□□□□□ -0.96
RRN9P53437 UTR1YJR049C 1593 nt8.99□□□□□ -0.97
RRN9P53437 SFA1YDL168W 1161 nt8.98□□□□□ -0.97
RRN9P53437 PRO1YDR300C 1287 nt8.98□□□□□ -0.97
RRN9P53437 POM34YLR018C 900 nt8.98□□□□□ -0.97
RRN9P53437 BSP1YPR171W 1731 nt8.97□□□□□ -0.97
RRN9P53437 GAP1YKR039W 1809 nt8.97□□□□□ -0.97
RRN9P53437 RET2YFR051C 1641 nt8.97□□□□□ -0.97
RRN9P53437 ZRT3YKL175W 1512 nt8.96□□□□□ -0.97
RRN9P53437 SAM35YHR083W 990 nt8.96□□□□□ -0.98
RRN9P53437 UBA4YHR111W 1323 nt8.96□□□□□ -0.98
RRN9P53437 THI74YDR438W 1113 nt8.94□□□□□ -0.98
RRN9P53437 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.93□□□□□ -0.98
RRN9P53437 YML089CYML089C 369 nt8.92□□□□□ -0.98
RRN9P53437 PHO89YBR296C 1725 nt8.91□□□□□ -0.98
RRN9P53437 TOM6YOR045W 186 nt8.91□□□□□ -0.98
RRN9P53437 ATG15YCR068W 1563 nt8.9□□□□□ -0.99
RRN9P53437 YSR3YKR053C 1215 nt8.88□□□□□ -0.99
RRN9P53437 NAT4YMR069W 858 nt8.88□□□□□ -0.99
RRN9P53437 MET2YNL277W 1461 nt8.87□□□□□ -0.99
RRN9P53437 MSF1YPR047W 1410 nt8.87□□□□□ -0.99
RRN9P53437 RIM8YGL045W 1629 nt8.86□□□□□ -0.99
RRN9P53437 YJL067WYJL067W 351 nt8.85□□□□□ -0.99
RRN9P53437 COQ2YNR041C 1119 nt8.85□□□□□ -0.99
RRN9P53437 MUP1YGR055W 1725 nt8.84□□□□□ -0.99
RRN9P53437 NPP1YCR026C 2229 nt8.84□□□□□ -0.99
RRN9P53437 DIF1YLR437C 402 nt8.83□□□□□ -1
RRN9P53437 TIF6YPR016C 738 nt8.83□□□□□ -1
RRN9P53437 ESBP6YNL125C 2022 nt8.83□□□□□ -1
RRN9P53437 YGL114WYGL114W 2178 nt8.82□□□□□ -1
RRN9P53437 PEX2YJL210W 816 nt8.82□□□□□ -1
RRN9P53437 HIP1YGR191W 1812 nt8.82□□□□□ -1
RRN9P53437 YCR087WYCR087W 516 nt8.81□□□□□ -1
RRN9P53437 XYL2YLR070C 1071 nt8.81□□□□□ -1
RRN9P53437 SFP1YLR403W 2052 nt8.81□□□□□ -1
RRN9P53437 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.8□□□□□ -1
RRN9P53437 YGL034CYGL034C 366 nt8.8□□□□□ -1
RRN9P53437 DBP1YPL119C 1854 nt8.79□□□□□ -1
RRN9P53437 HOL1YNR055C 1761 nt8.79□□□□□ -1
RRN9P53437 MRP20YDR405W 792 nt8.79□□□□□ -1
RRN9P53437 HXT1YHR094C 1713 nt8.78□□□□□ -1
RRN9P53437 MET28YIR017C 564 nt8.75□□□□□ -1.01
RRN9P53437 AIM45YPR004C 1035 nt8.75□□□□□ -1.01
RRN9P53437 ILV3YJR016C 1758 nt8.74□□□□□ -1.01
RRN9P53437 MAE1YKL029C 2010 nt8.74□□□□□ -1.01
RRN9P53437 RPL4BYDR012W 1089 nt8.73□□□□□ -1.01
RRN9P53437 SHY1YGR112W 1170 nt8.73□□□□□ -1.01
RRN9P53437 RPL4AYBR031W 1089 nt8.73□□□□□ -1.01
RRN9P53437 YNL024CYNL024C 741 nt8.72□□□□□ -1.01
RRN9P53437 UTH1YKR042W 1098 nt8.71□□□□□ -1.02
RRN9P53437 YAR028WYAR028W 705 nt8.71□□□□□ -1.02
RRN9P53437 NRT1YOR071C 1797 nt8.71□□□□□ -1.02
RRN9P53437 CLB6YGR109C 1143 nt8.7□□□□□ -1.02
RRN9P53437 ILV2YMR108W 2064 nt8.69□□□□□ -1.02
RRN9P53437 MTG2YHR168W 1557 nt8.69□□□□□ -1.02
RRN9P53437 RPS14BYJL191W 417 nt8.68□□□□□ -1.02
RRN9P53437 YOR325WYOR325W 474 nt8.68□□□□□ -1.02
RRN9P53437 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.67□□□□□ -1.02
RRN9P53437 DTR1YBR180W 1719 nt8.67□□□□□ -1.02
RRN9P53437 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.66□□□□□ -1.02
RRN9P53437 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.66□□□□□ -1.02
RRN9P53437 RBG1YAL036C 1110 nt8.66□□□□□ -1.02
RRN9P53437 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.66□□□□□ -1.02
RRN9P53437 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.66□□□□□ -1.02
RRN9P53437 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.66□□□□□ -1.02
RRN9P53437 YBL086CYBL086C 1401 nt8.65□□□□□ -1.02
RRN9P53437 LIP1YMR298W 453 nt8.65□□□□□ -1.02
RRN9P53437 SED1YDR077W 1017 nt8.64□□□□□ -1.03
RRN9P53437 FIT3YOR383C 615 nt8.64□□□□□ -1.03
RRN9P53437 URA6YKL024C 615 nt8.62□□□□□ -1.03
RRN9P53437 ZTA1YBR046C 1005 nt8.62□□□□□ -1.03
RRN9P53437 ALP1YNL270C 1722 nt8.62□□□□□ -1.03
RRN9P53437 OPI10YOL032W 741 nt8.61□□□□□ -1.03
RRN9P53437 COQ8YGL119W 1506 nt8.6□□□□□ -1.03
RRN9P53437 AKR2YOR034C 2250 nt8.6□□□□□ -1.03
RRN9P53437 CWC15YDR163W 528 nt8.6□□□□□ -1.03
RRN9P53437 HIS2YFR025C 1008 nt8.6□□□□□ -1.03
RRN9P53437 LEU9YOR108W 1815 nt8.59□□□□□ -1.03
RRN9P53437 ACO2YJL200C 2370 nt8.58□□□□□ -1.04
RRN9P53437 UFO1YML088W 2007 nt8.58□□□□□ -1.04
RRN9P53437 CCT2YIL142W 1584 nt8.56□□□□□ -1.04
RRN9P53437 ARO8YGL202W 1503 nt8.56□□□□□ -1.04
RRN9P53437 RFC1YOR217W 2586 nt8.56□□□□□ -1.04
RRN9P53437 YPL251WYPL251W 303 nt8.56□□□□□ -1.04
RRN9P53437 UGP1YKL035W 1500 nt8.55□□□□□ -1.04
RRN9P53437 SAM1YLR180W 1149 nt8.55□□□□□ -1.04
RRN9P53437 TSC10YBR265W 963 nt8.55□□□□□ -1.04
RRN9P53437 YMR209CYMR209C 1374 nt8.55□□□□□ -1.04
RRN9P53437 HMG2YLR450W 3138 nt8.54□□□□□ -1.04
RRN9P53437 YLR279WYLR279W 390 nt8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.1 ms