Protein–RNA interactions for Protein: P53333

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CWC22P53333 MUP1YGR055W 1725 nt10.96□□□□□ -0.65
CWC22P53333 TIM17YJL143W 477 nt10.94□□□□□ -0.66
CWC22P53333 NRT1YOR071C 1797 nt10.94□□□□□ -0.66
CWC22P53333 MCM5YLR274W 2328 nt10.92□□□□□ -0.66
CWC22P53333 RPC82YPR190C 1965 nt10.92□□□□□ -0.66
CWC22P53333 MRPL8YJL063C 717 nt10.91□□□□□ -0.66
CWC22P53333 NIT1YIL164C 600 nt10.9□□□□□ -0.66
CWC22P53333 RTN2YDL204W 1182 nt10.89□□□□□ -0.67
CWC22P53333 DAT1YML113W 747 nt10.89□□□□□ -0.67
CWC22P53333 FRA1YLL029W 2250 nt10.88□□□□□ -0.67
CWC22P53333 ADO1YJR105W 1023 nt10.86□□□□□ -0.67
CWC22P53333 YNL115CYNL115C 1935 nt10.86□□□□□ -0.67
CWC22P53333 YHL008CYHL008C 1884 nt10.84□□□□□ -0.67
CWC22P53333 SGT2YOR007C 1041 nt10.83□□□□□ -0.68
CWC22P53333 PEX25YPL112C 1185 nt10.82□□□□□ -0.68
CWC22P53333 RSC4YKR008W 1878 nt10.82□□□□□ -0.68
CWC22P53333 MTO1YGL236C 2010 nt10.79□□□□□ -0.68
CWC22P53333 YCR102CYCR102C 1107 nt10.79□□□□□ -0.68
CWC22P53333 NBP35YGL091C 987 nt10.79□□□□□ -0.68
CWC22P53333 YFL066CYFL066C 1179 nt10.75□□□□□ -0.69
CWC22P53333 VPS75YNL246W 795 nt10.74□□□□□ -0.69
CWC22P53333 PLB1YMR008C 1995 nt10.73□□□□□ -0.69
CWC22P53333 ARP6YLR085C 1317 nt10.73□□□□□ -0.69
CWC22P53333 ALR1YOL130W 2580 nt10.71□□□□□ -0.7
CWC22P53333 HOL1YNR055C 1761 nt10.68□□□□□ -0.7
CWC22P53333 YFR018CYFR018C 1092 nt10.68□□□□□ -0.7
CWC22P53333 HXK1YFR053C 1458 nt10.67□□□□□ -0.7
CWC22P53333 ILV3YJR016C 1758 nt10.65□□□□□ -0.71
CWC22P53333 ALD5YER073W 1563 nt10.63□□□□□ -0.71
CWC22P53333 YMR209CYMR209C 1374 nt10.62□□□□□ -0.71
CWC22P53333 TIR3YIL011W 810 nt10.61□□□□□ -0.71
CWC22P53333 PRM5YIL117C 957 nt10.61□□□□□ -0.71
CWC22P53333 PRE6YOL038W 765 nt10.61□□□□□ -0.71
CWC22P53333 INA1YLR413W 2028 nt10.61□□□□□ -0.71
CWC22P53333 SHH4YLR164W 507 nt10.59□□□□□ -0.71
CWC22P53333 LSC2YGR244C 1284 nt10.58□□□□□ -0.72
CWC22P53333 HIF1YLL022C 1158 nt10.57□□□□□ -0.72
CWC22P53333 UTR1YJR049C 1593 nt10.56□□□□□ -0.72
CWC22P53333 SFL1YOR140W 2301 nt10.56□□□□□ -0.72
CWC22P53333 ALD4YOR374W 1560 nt10.56□□□□□ -0.72
CWC22P53333 PAU7YAR020C 168 nt10.55□□□□□ -0.72
CWC22P53333 GAP1YKR039W 1809 nt10.54□□□□□ -0.72
CWC22P53333 YDR010CYDR010C 333 nt10.53□□□□□ -0.72
CWC22P53333 PRO1YDR300C 1287 nt10.53□□□□□ -0.72
CWC22P53333 TPN1YGL186C 1740 nt10.53□□□□□ -0.72
CWC22P53333 MDL2YPL270W 2322 nt10.52□□□□□ -0.73
CWC22P53333 TOM71YHR117W 1920 nt10.51□□□□□ -0.73
CWC22P53333 POM34YLR018C 900 nt10.51□□□□□ -0.73
CWC22P53333 SHB17YKR043C 816 nt10.5□□□□□ -0.73
CWC22P53333 YDR094WYDR094W 336 nt10.48□□□□□ -0.73
CWC22P53333 DUR3YHL016C 2208 nt10.48□□□□□ -0.73
CWC22P53333 SFA1YDL168W 1161 nt10.47□□□□□ -0.73
CWC22P53333 RRT5YFR032C 870 nt10.46□□□□□ -0.73
CWC22P53333 YLR173WYLR173W 1827 nt10.45□□□□□ -0.74
CWC22P53333 MEP3YPR138C 1470 nt10.45□□□□□ -0.74
CWC22P53333 MIR1YJR077C 936 nt10.45□□□□□ -0.74
CWC22P53333 ATG15YCR068W 1563 nt10.44□□□□□ -0.74
CWC22P53333 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.44□□□□□ -0.74
CWC22P53333 SAM35YHR083W 990 nt10.44□□□□□ -0.74
CWC22P53333 YML089CYML089C 369 nt10.43□□□□□ -0.74
CWC22P53333 RET2YFR051C 1641 nt10.42□□□□□ -0.74
CWC22P53333 GNP1YDR508C 1992 nt10.42□□□□□ -0.74
CWC22P53333 TOM6YOR045W 186 nt10.41□□□□□ -0.74
CWC22P53333 UBA4YHR111W 1323 nt10.38□□□□□ -0.75
CWC22P53333 PAU16YKL224C 372 nt10.38□□□□□ -0.75
CWC22P53333 DIF1YLR437C 402 nt10.38□□□□□ -0.75
CWC22P53333 MAS1YLR163C 1389 nt10.38□□□□□ -0.75
CWC22P53333 PHO89YBR296C 1725 nt10.36□□□□□ -0.75
CWC22P53333 THI6YPL214C 1623 nt10.35□□□□□ -0.75
CWC22P53333 ADE5,7YGL234W 2409 nt10.35□□□□□ -0.75
CWC22P53333 ZRT3YKL175W 1512 nt10.34□□□□□ -0.75
CWC22P53333 PSD1YNL169C 1503 nt10.33□□□□□ -0.76
CWC22P53333 THI74YDR438W 1113 nt10.32□□□□□ -0.76
CWC22P53333 PEX2YJL210W 816 nt10.31□□□□□ -0.76
CWC22P53333 NSG2YNL156C 900 nt10.31□□□□□ -0.76
CWC22P53333 TIF6YPR016C 738 nt10.31□□□□□ -0.76
CWC22P53333 DBP1YPL119C 1854 nt10.3□□□□□ -0.76
CWC22P53333 YSR3YKR053C 1215 nt10.29□□□□□ -0.76
CWC22P53333 HIP1YGR191W 1812 nt10.28□□□□□ -0.76
CWC22P53333 COQ2YNR041C 1119 nt10.28□□□□□ -0.76
CWC22P53333 HXT1YHR094C 1713 nt10.27□□□□□ -0.76
CWC22P53333 UGP1YKL035W 1500 nt10.26□□□□□ -0.77
CWC22P53333 GCD11YER025W 1584 nt10.26□□□□□ -0.77
CWC22P53333 YJL067WYJL067W 351 nt10.24□□□□□ -0.77
CWC22P53333 LPD1YFL018C 1500 nt10.23□□□□□ -0.77
CWC22P53333 RTG2YGL252C 1767 nt10.23□□□□□ -0.77
CWC22P53333 YCR087WYCR087W 516 nt10.22□□□□□ -0.77
CWC22P53333 MRP20YDR405W 792 nt10.22□□□□□ -0.77
CWC22P53333 YAR028WYAR028W 705 nt10.22□□□□□ -0.77
CWC22P53333 MSF1YPR047W 1410 nt10.22□□□□□ -0.77
CWC22P53333 SHY1YGR112W 1170 nt10.21□□□□□ -0.77
CWC22P53333 MET28YIR017C 564 nt10.21□□□□□ -0.77
CWC22P53333 NAT4YMR069W 858 nt10.21□□□□□ -0.77
CWC22P53333 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.2□□□□□ -0.78
CWC22P53333 XYL2YLR070C 1071 nt10.2□□□□□ -0.78
CWC22P53333 YBL086CYBL086C 1401 nt10.18□□□□□ -0.78
CWC22P53333 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
CWC22P53333 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
CWC22P53333 RBG1YAL036C 1110 nt10.18□□□□□ -0.78
CWC22P53333 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms