Protein–RNA interactions for Protein: P53148

SPC105, Spindle pole body component SPC105, yeastyeast

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105P53148 CYT2YKL087C 675 nt10.07□□□□□ -0.8
SPC105P53148 YCL074WYCL074W 927 nt10.06□□□□□ -0.8
SPC105P53148 NBP35YGL091C 987 nt10.06□□□□□ -0.8
SPC105P53148 SFA1YDL168W 1161 nt10.05□□□□□ -0.8
SPC105P53148 COQ2YNR041C 1119 nt10.05□□□□□ -0.8
SPC105P53148 STR3YGL184C 1398 nt10.04□□□□□ -0.8
SPC105P53148 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.04□□□□□ -0.8
SPC105P53148 TIR3YIL011W 810 nt10.04□□□□□ -0.8
SPC105P53148 SSN3YPL042C 1668 nt10.02□□□□□ -0.8
SPC105P53148 AQY2YLL052C 450 nt10.02□□□□□ -0.81
SPC105P53148 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.99□□□□□ -0.81
SPC105P53148 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.99□□□□□ -0.81
SPC105P53148 RPL4BYDR012W 1089 nt9.98□□□□□ -0.81
SPC105P53148 RPL4AYBR031W 1089 nt9.98□□□□□ -0.81
SPC105P53148 SHH4YLR164W 507 nt9.97□□□□□ -0.81
SPC105P53148 SNF1YDR477W 1902 nt9.96□□□□□ -0.81
SPC105P53148 CLB6YGR109C 1143 nt9.96□□□□□ -0.82
SPC105P53148 LSC2YGR244C 1284 nt9.95□□□□□ -0.82
SPC105P53148 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.95□□□□□ -0.82
SPC105P53148 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.95□□□□□ -0.82
SPC105P53148 RBG2YGR173W 1107 nt9.94□□□□□ -0.82
SPC105P53148 BMT6YLR063W 1098 nt9.94□□□□□ -0.82
SPC105P53148 POM34YLR018C 900 nt9.93□□□□□ -0.82
SPC105P53148 YML089CYML089C 369 nt9.93□□□□□ -0.82
SPC105P53148 YMR226CYMR226C 804 nt9.93□□□□□ -0.82
SPC105P53148 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.91□□□□□ -0.82
SPC105P53148 UTH1YKR042W 1098 nt9.91□□□□□ -0.82
SPC105P53148 TOM6YOR045W 186 nt9.91□□□□□ -0.82
SPC105P53148 RPS14BYJL191W 417 nt9.89□□□□□ -0.83
SPC105P53148 ARP6YLR085C 1317 nt9.88□□□□□ -0.83
SPC105P53148 HEL2YDR266C 1920 nt9.88□□□□□ -0.83
SPC105P53148 RTN2YDL204W 1182 nt9.88□□□□□ -0.83
SPC105P53148 PRO1YDR300C 1287 nt9.88□□□□□ -0.83
SPC105P53148 HIP1YGR191W 1812 nt9.87□□□□□ -0.83
SPC105P53148 PEX2YJL210W 816 nt9.86□□□□□ -0.83
SPC105P53148 YLR111WYLR111W 333 nt9.86□□□□□ -0.83
SPC105P53148 ATG15YCR068W 1563 nt9.85□□□□□ -0.83
SPC105P53148 YKR005CYKR005C 1578 nt9.85□□□□□ -0.83
SPC105P53148 SDH5YOL071W 489 nt9.85□□□□□ -0.83
SPC105P53148 NRT1YOR071C 1797 nt9.83□□□□□ -0.84
SPC105P53148 MET28YIR017C 564 nt9.81□□□□□ -0.84
SPC105P53148 TIF6YPR016C 738 nt9.81□□□□□ -0.84
SPC105P53148 Q0010Q0010 387 nt9.81□□□□□ -0.84
SPC105P53148 TSC10YBR265W 963 nt9.8□□□□□ -0.84
SPC105P53148 GAP1YKR039W 1809 nt9.79□□□□□ -0.84
SPC105P53148 YAT1YAR035W 2064 nt9.79□□□□□ -0.84
SPC105P53148 RAD23YEL037C 1197 nt9.79□□□□□ -0.84
SPC105P53148 YGR259CYGR259C 441 nt9.78□□□□□ -0.84
SPC105P53148 PLB1YMR008C 1995 nt9.77□□□□□ -0.85
SPC105P53148 IRC24YIR036C 792 nt9.75□□□□□ -0.85
SPC105P53148 FIT3YOR383C 615 nt9.75□□□□□ -0.85
SPC105P53148 YGR012WYGR012W 1182 nt9.74□□□□□ -0.85
SPC105P53148 MAS1YLR163C 1389 nt9.72□□□□□ -0.85
SPC105P53148 SAM1YLR180W 1149 nt9.68□□□□□ -0.86
SPC105P53148 YLR279WYLR279W 390 nt9.68□□□□□ -0.86
SPC105P53148 RIB3YDR487C 627 nt9.67□□□□□ -0.86
SPC105P53148 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.66□□□□□ -0.86
SPC105P53148 MCM5YLR274W 2328 nt9.66□□□□□ -0.86
SPC105P53148 DIF1YLR437C 402 nt9.65□□□□□ -0.86
SPC105P53148 UTR1YJR049C 1593 nt9.64□□□□□ -0.87
SPC105P53148 SPT20YOL148C 1815 nt9.64□□□□□ -0.87
SPC105P53148 YAR028WYAR028W 705 nt9.64□□□□□ -0.87
SPC105P53148 RIM8YGL045W 1629 nt9.62□□□□□ -0.87
SPC105P53148 MSB4YOL112W 1479 nt9.61□□□□□ -0.87
SPC105P53148 SAM35YHR083W 990 nt9.61□□□□□ -0.87
SPC105P53148 MET2YNL277W 1461 nt9.6□□□□□ -0.87
SPC105P53148 ALP1YNL270C 1722 nt9.6□□□□□ -0.87
SPC105P53148 CAB5YDR196C 726 nt9.6□□□□□ -0.87
SPC105P53148 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.6□□□□□ -0.87
SPC105P53148 YJR154WYJR154W 1041 nt9.59□□□□□ -0.87
SPC105P53148 AKR2YOR034C 2250 nt9.56□□□□□ -0.88
SPC105P53148 MTG2YHR168W 1557 nt9.56□□□□□ -0.88
SPC105P53148 ZTA1YBR046C 1005 nt9.54□□□□□ -0.88
SPC105P53148 PRM5YIL117C 957 nt9.53□□□□□ -0.88
SPC105P53148 SFP1YLR403W 2052 nt9.51□□□□□ -0.89
SPC105P53148 YGL114WYGL114W 2178 nt9.51□□□□□ -0.89
SPC105P53148 MAE1YKL029C 2010 nt9.51□□□□□ -0.89
SPC105P53148 GND1YHR183W 1470 nt9.49□□□□□ -0.89
SPC105P53148 SED1YDR077W 1017 nt9.49□□□□□ -0.89
SPC105P53148 RSC4YKR008W 1878 nt9.49□□□□□ -0.89
SPC105P53148 YPI1YFR003C 468 nt9.48□□□□□ -0.89
SPC105P53148 RPC82YPR190C 1965 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC105P53148 LOT5YKL183W 921 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC105P53148 INA1YLR413W 2028 nt9.45□□□□□ -0.9
SPC105P53148 GID7YCL039W 2238 nt9.45□□□□□ -0.9
SPC105P53148 ALD4YOR374W 1560 nt9.44□□□□□ -0.9
SPC105P53148 FCY21YER060W 1587 nt9.43□□□□□ -0.9
SPC105P53148 YDR306CYDR306C 1437 nt9.43□□□□□ -0.9
SPC105P53148 APT2YDR441C 546 nt9.42□□□□□ -0.9
SPC105P53148 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.42□□□□□ -0.9
SPC105P53148 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.42□□□□□ -0.9
SPC105P53148 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.42□□□□□ -0.9
SPC105P53148 LIP1YMR298W 453 nt9.42□□□□□ -0.9
SPC105P53148 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.42□□□□□ -0.9
SPC105P53148 ADH1YOL086C 1047 nt9.42□□□□□ -0.9
SPC105P53148 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.42□□□□□ -0.9
SPC105P53148 MET8YBR213W 825 nt9.42□□□□□ -0.9
SPC105P53148 YJL195CYJL195C 702 nt9.41□□□□□ -0.9
SPC105P53148 MUP1YGR055W 1725 nt9.41□□□□□ -0.9
SPC105P53148 ESBP6YNL125C 2022 nt9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms