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Protein–RNA interactions for Protein: P53047
RTA1, Protein RTA1, yeast
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317 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTA1
P53047
YSR3
YKR053C
1215 nt
10.19
□□□□□ -0.78
RTA1
P53047
MSF1
YPR047W
1410 nt
10.18
□□□□□ -0.78
RTA1
P53047
SFA1
YDL168W
1161 nt
10.18
□□□□□ -0.78
RTA1
P53047
POM34
YLR018C
900 nt
10.18
□□□□□ -0.78
RTA1
P53047
GAP1
YKR039W
1809 nt
10.18
□□□□□ -0.78
RTA1
P53047
YML089C
YML089C
369 nt
10.16
□□□□□ -0.78
RTA1
P53047
NAR1
YNL240C
1476 nt
10.16
□□□□□ -0.78
RTA1
P53047
ATG15
YCR068W
1563 nt
10.15
□□□□□ -0.78
RTA1
P53047
Q0010
Q0010
387 nt
10.15
□□□□□ -0.78
RTA1
P53047
YCR087W
YCR087W
516 nt
10.14
□□□□□ -0.79
RTA1
P53047
CLB6
YGR109C
1143 nt
10.12
□□□□□ -0.79
RTA1
P53047
TOM6
YOR045W
186 nt
10.12
□□□□□ -0.79
RTA1
P53047
MET8
YBR213W
825 nt
10.12
□□□□□ -0.79
RTA1
P53047
UTR1
YJR049C
1593 nt
10.12
□□□□□ -0.79
RTA1
P53047
MCH5
YOR306C
1566 nt
10.12
□□□□□ -0.79
RTA1
P53047
MRP20
YDR405W
792 nt
10.11
□□□□□ -0.79
RTA1
P53047
SAM35
YHR083W
990 nt
10.11
□□□□□ -0.79
RTA1
P53047
PRM5
YIL117C
957 nt
10.11
□□□□□ -0.79
RTA1
P53047
YGL034C
YGL034C
366 nt
10.08
□□□□□ -0.8
RTA1
P53047
XYL2
YLR070C
1071 nt
10.08
□□□□□ -0.8
RTA1
P53047
ALD4
YOR374W
1560 nt
10.08
□□□□□ -0.8
RTA1
P53047
PBP1
YGR178C
2169 nt
10.07
□□□□□ -0.8
RTA1
P53047
YFL015W-A
YFL015W-A
318 nt
10.07
□□□□□ -0.8
RTA1
P53047
CYT2
YKL087C
675 nt
10.07
□□□□□ -0.8
RTA1
P53047
COQ2
YNR041C
1119 nt
10.07
□□□□□ -0.8
RTA1
P53047
PEX2
YJL210W
816 nt
10.05
□□□□□ -0.8
RTA1
P53047
YGR139W
YGR139W
339 nt
10.04
□□□□□ -0.8
RTA1
P53047
HIF1
YLL022C
1158 nt
10.03
□□□□□ -0.8
RTA1
P53047
AIM45
YPR004C
1035 nt
10.03
□□□□□ -0.8
RTA1
P53047
HIP1
YGR191W
1812 nt
10.01
□□□□□ -0.81
RTA1
P53047
TIF6
YPR016C
738 nt
10.01
□□□□□ -0.81
RTA1
P53047
DIF1
YLR437C
402 nt
10
□□□□□ -0.81
RTA1
P53047
RPL4B
YDR012W
1089 nt
9.99
□□□□□ -0.81
RTA1
P53047
YJR154W
YJR154W
1041 nt
9.99
□□□□□ -0.81
RTA1
P53047
RPL4A
YBR031W
1089 nt
9.99
□□□□□ -0.81
RTA1
P53047
MET28
YIR017C
564 nt
9.98
□□□□□ -0.81
RTA1
P53047
UTH1
YKR042W
1098 nt
9.98
□□□□□ -0.81
RTA1
P53047
NRT1
YOR071C
1797 nt
9.96
□□□□□ -0.82
RTA1
P53047
RBG1
YAL036C
1110 nt
9.95
□□□□□ -0.82
RTA1
P53047
YAR028W
YAR028W
705 nt
9.91
□□□□□ -0.82
RTA1
P53047
NDI1
YML120C
1542 nt
9.89
□□□□□ -0.83
RTA1
P53047
RPS14B
YJL191W
417 nt
9.89
□□□□□ -0.83
RTA1
P53047
FIT3
YOR383C
615 nt
9.88
□□□□□ -0.83
RTA1
P53047
HXT1
YHR094C
1713 nt
9.87
□□□□□ -0.83
RTA1
P53047
ZRT3
YKL175W
1512 nt
9.87
□□□□□ -0.83
RTA1
P53047
DBP1
YPL119C
1854 nt
9.85
□□□□□ -0.83
RTA1
P53047
SED1
YDR077W
1017 nt
9.84
□□□□□ -0.83
RTA1
P53047
LIP1
YMR298W
453 nt
9.83
□□□□□ -0.84
RTA1
P53047
MTG2
YHR168W
1557 nt
9.83
□□□□□ -0.84
RTA1
P53047
ALP1
YNL270C
1722 nt
9.82
□□□□□ -0.84
RTA1
P53047
AKR2
YOR034C
2250 nt
9.82
□□□□□ -0.84
RTA1
P53047
TSC10
YBR265W
963 nt
9.8
□□□□□ -0.84
RTA1
P53047
YAT1
YAR035W
2064 nt
9.79
□□□□□ -0.84
RTA1
P53047
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YDR510C-A
117 nt
9.79
□□□□□ -0.84
RTA1
P53047
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YER190C-A
576 nt
9.79
□□□□□ -0.84
RTA1
P53047
YGR296C-A
YGR296C-A
576 nt
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RTA1
P53047
YML133W-A
YML133W-A
576 nt
9.79
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RTA1
P53047
YNL339W-A
YNL339W-A
576 nt
9.79
□□□□□ -0.84
RTA1
P53047
SDH5
YOL071W
489 nt
9.79
□□□□□ -0.84
RTA1
P53047
YPL283W-A
YPL283W-A
576 nt
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□□□□□ -0.84
RTA1
P53047
ZTA1
YBR046C
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RTA1
P53047
INA1
YLR413W
2028 nt
9.76
□□□□□ -0.85
RTA1
P53047
YBL086C
YBL086C
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□□□□□ -0.85
RTA1
P53047
SHY1
YGR112W
1170 nt
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□□□□□ -0.85
RTA1
P53047
SAM1
YLR180W
1149 nt
9.75
□□□□□ -0.85
RTA1
P53047
BSP1
YPR171W
1731 nt
9.72
□□□□□ -0.85
RTA1
P53047
CMP2
YML057W
1815 nt
9.72
□□□□□ -0.85
RTA1
P53047
GLR1
YPL091W
1452 nt
9.72
□□□□□ -0.85
RTA1
P53047
YGR012W
YGR012W
1182 nt
9.71
□□□□□ -0.86
RTA1
P53047
CSM2
YIL132C
642 nt
9.7
□□□□□ -0.86
RTA1
P53047
YJL067W
YJL067W
351 nt
9.7
□□□□□ -0.86
RTA1
P53047
TOA2
YKL058W
369 nt
9.7
□□□□□ -0.86
RTA1
P53047
YLR279W
YLR279W
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9.7
□□□□□ -0.86
RTA1
P53047
BRR1
YPR057W
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RTA1
P53047
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YOR108W
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□□□□□ -0.86
RTA1
P53047
YPL251W
YPL251W
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□□□□□ -0.86
RTA1
P53047
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YKL024C
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RTA1
P53047
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YLR111W
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RTA1
P53047
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YEL037C
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RTA1
P53047
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YOL148C
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RTA1
P53047
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YPR190C
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RTA1
P53047
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YOL112W
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□□□□□ -0.87
RTA1
P53047
SBA1
YKL117W
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□□□□□ -0.87
RTA1
P53047
PAB1
YER165W
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RTA1
P53047
MEP3
YPR138C
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RTA1
P53047
UFO1
YML088W
2007 nt
9.61
□□□□□ -0.87
RTA1
P53047
GND2
YGR256W
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RTA1
P53047
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RTA1
P53047
TRT2
tT(CGU)K
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□□□□□ -0.87
RTA1
P53047
YMR103C
YMR103C
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9.6
□□□□□ -0.87
RTA1
P53047
OYE3
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□□□□□ -0.87
RTA1
P53047
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YPL222C-A
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9.6
□□□□□ -0.87
RTA1
P53047
YMR244W
YMR244W
1068 nt
9.59
□□□□□ -0.87
RTA1
P53047
PET8
YNL003C
855 nt
9.59
□□□□□ -0.87
RTA1
P53047
YMR226C
YMR226C
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9.58
□□□□□ -0.88
RTA1
P53047
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YDR163W
528 nt
9.57
□□□□□ -0.88
RTA1
P53047
SAM2
YDR502C
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□□□□□ -0.88
RTA1
P53047
APT2
YDR441C
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□□□□□ -0.88
RTA1
P53047
UGA4
YDL210W
1716 nt
9.55
□□□□□ -0.88
RTA1
P53047
RIB3
YDR487C
627 nt
9.54
□□□□□ -0.88
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