Protein–RNA interactions for Protein: P46987

YJL181W, UPF0508 protein YJL181W, yeastyeast

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL181WP46987 GOR1YNL274C 1053 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL181WP46987 RAX1YOR301W 1308 nt12.65□□□□□ -0.38
YJL181WP46987 YPI1YFR003C 468 nt12.65□□□□□ -0.38
YJL181WP46987 PUP1YOR157C 786 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL181WP46987 SEN2YLR105C 1134 nt12.6□□□□□ -0.39
YJL181WP46987 NRT1YOR071C 1797 nt12.58□□□□□ -0.4
YJL181WP46987 TIR3YIL011W 810 nt12.57□□□□□ -0.4
YJL181WP46987 HIP1YGR191W 1812 nt12.57□□□□□ -0.4
YJL181WP46987 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.56□□□□□ -0.4
YJL181WP46987 BOP3YNL042W 1191 nt12.53□□□□□ -0.4
YJL181WP46987 TOM6YOR045W 186 nt12.53□□□□□ -0.4
YJL181WP46987 PEX2YJL210W 816 nt12.5□□□□□ -0.41
YJL181WP46987 PCH2YBR186W 1695 nt12.5□□□□□ -0.41
YJL181WP46987 MET28YIR017C 564 nt12.49□□□□□ -0.41
YJL181WP46987 SHH4YLR164W 507 nt12.49□□□□□ -0.41
YJL181WP46987 YML089CYML089C 369 nt12.49□□□□□ -0.41
YJL181WP46987 NBP35YGL091C 987 nt12.45□□□□□ -0.42
YJL181WP46987 POM34YLR018C 900 nt12.44□□□□□ -0.42
YJL181WP46987 MSB4YOL112W 1479 nt12.44□□□□□ -0.42
YJL181WP46987 FIT3YOR383C 615 nt12.43□□□□□ -0.42
YJL181WP46987 GND1YHR183W 1470 nt12.42□□□□□ -0.42
YJL181WP46987 LOT5YKL183W 921 nt12.4□□□□□ -0.42
YJL181WP46987 YJR114WYJR114W 393 nt12.39□□□□□ -0.43
YJL181WP46987 GUT2YIL155C 1950 nt12.38□□□□□ -0.43
YJL181WP46987 LSC2YGR244C 1284 nt12.38□□□□□ -0.43
YJL181WP46987 TIF6YPR016C 738 nt12.38□□□□□ -0.43
YJL181WP46987 RTF1YGL244W 1677 nt12.38□□□□□ -0.43
YJL181WP46987 AAC1YMR056C 930 nt12.37□□□□□ -0.43
YJL181WP46987 DUT1YBR252W 444 nt12.37□□□□□ -0.43
YJL181WP46987 TIM44YIL022W 1296 nt12.36□□□□□ -0.43
YJL181WP46987 YBR232CYBR232C 360 nt12.36□□□□□ -0.43
YJL181WP46987 PGC1YPL206C 966 nt12.32□□□□□ -0.44
YJL181WP46987 BDF1YLR399C 2061 nt12.31□□□□□ -0.44
YJL181WP46987 STP3YLR375W 1032 nt12.3□□□□□ -0.44
YJL181WP46987 PRO1YDR300C 1287 nt12.29□□□□□ -0.44
YJL181WP46987 YJL064WYJL064W 396 nt12.28□□□□□ -0.44
YJL181WP46987 AGP1YCL025C 1902 nt12.28□□□□□ -0.44
YJL181WP46987 PAU5YFL020C 369 nt12.26□□□□□ -0.45
YJL181WP46987 ATG15YCR068W 1563 nt12.26□□□□□ -0.45
YJL181WP46987 APT2YDR441C 546 nt12.25□□□□□ -0.45
YJL181WP46987 PAU19YMR325W 375 nt12.25□□□□□ -0.45
YJL181WP46987 RIB1YBL033C 1038 nt12.23□□□□□ -0.45
YJL181WP46987 TAT1YBR069C 1860 nt12.21□□□□□ -0.46
YJL181WP46987 PIB2YGL023C 1908 nt12.2□□□□□ -0.46
YJL181WP46987 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.18□□□□□ -0.46
YJL181WP46987 SMM1YNR015W 1155 nt12.17□□□□□ -0.46
YJL181WP46987 SLG1YOR008C 1137 nt12.17□□□□□ -0.46
YJL181WP46987 PTK1YKL198C 1989 nt12.14□□□□□ -0.47
YJL181WP46987 RIB2YOL066C 1776 nt12.14□□□□□ -0.47
YJL181WP46987 PAC11YDR488C 1602 nt12.14□□□□□ -0.47
YJL181WP46987 CCA1YER168C 1641 nt12.14□□□□□ -0.47
YJL181WP46987 ALP1YNL270C 1722 nt12.09□□□□□ -0.47
YJL181WP46987 ERG6YML008C 1152 nt12.09□□□□□ -0.47
YJL181WP46987 HXT12YIL170W 1374 nt12.08□□□□□ -0.48
YJL181WP46987 YGR139WYGR139W 339 nt12.08□□□□□ -0.48
YJL181WP46987 FCY21YER060W 1587 nt12.07□□□□□ -0.48
YJL181WP46987 YIA6YIL006W 1122 nt12.07□□□□□ -0.48
YJL181WP46987 AQY2YLL052C 450 nt12.06□□□□□ -0.48
YJL181WP46987 STR3YGL184C 1398 nt12.05□□□□□ -0.48
YJL181WP46987 ALD4YOR374W 1560 nt12.05□□□□□ -0.48
YJL181WP46987 SOD2YHR008C 702 nt12.04□□□□□ -0.48
YJL181WP46987 ARP6YLR085C 1317 nt12.04□□□□□ -0.48
YJL181WP46987 GAP1YKR039W 1809 nt12.03□□□□□ -0.48
YJL181WP46987 YFL054CYFL054C 1941 nt12.03□□□□□ -0.48
YJL181WP46987 YAR028WYAR028W 705 nt12.01□□□□□ -0.49
YJL181WP46987 DUS1YML080W 1272 nt12.01□□□□□ -0.49
YJL181WP46987 CCT5YJR064W 1689 nt12□□□□□ -0.49
YJL181WP46987 NVJ2YPR091C 2313 nt11.97□□□□□ -0.49
YJL181WP46987 VRG4YGL225W 1014 nt11.97□□□□□ -0.49
YJL181WP46987 TIP1YBR067C 633 nt11.97□□□□□ -0.49
YJL181WP46987 QDR2YIL121W 1629 nt11.96□□□□□ -0.5
YJL181WP46987 TAF13YML098W 504 nt11.95□□□□□ -0.5
YJL181WP46987 NME1NME1 340 nt11.95□□□□□ -0.5
YJL181WP46987 AKR2YOR034C 2250 nt11.94□□□□□ -0.5
YJL181WP46987 ZTA1YBR046C 1005 nt11.94□□□□□ -0.5
YJL181WP46987 PAR32YDL173W 888 nt11.93□□□□□ -0.5
YJL181WP46987 MTG2YHR168W 1557 nt11.92□□□□□ -0.5
YJL181WP46987 PRY1YJL079C 900 nt11.92□□□□□ -0.5
YJL181WP46987 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.92□□□□□ -0.5
YJL181WP46987 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.92□□□□□ -0.5
YJL181WP46987 POP2YNR052C 1302 nt11.9□□□□□ -0.5
YJL181WP46987 DIF1YLR437C 402 nt11.89□□□□□ -0.51
YJL181WP46987 YCL074WYCL074W 927 nt11.87□□□□□ -0.51
YJL181WP46987 BMT6YLR063W 1098 nt11.87□□□□□ -0.51
YJL181WP46987 THI72YOR192C 1800 nt11.83□□□□□ -0.52
YJL181WP46987 YER152W-AYER152W-A 567 nt11.81□□□□□ -0.52
YJL181WP46987 SWE1YJL187C 2460 nt11.81□□□□□ -0.52
YJL181WP46987 YJL055WYJL055W 738 nt11.8□□□□□ -0.52
YJL181WP46987 YCP4YCR004C 744 nt11.79□□□□□ -0.52
YJL181WP46987 RTN2YDL204W 1182 nt11.78□□□□□ -0.52
YJL181WP46987 PLB1YMR008C 1995 nt11.76□□□□□ -0.53
YJL181WP46987 GSF2YML048W 1212 nt11.76□□□□□ -0.53
YJL181WP46987 YMR262WYMR262W 942 nt11.75□□□□□ -0.53
YJL181WP46987 UGA4YDL210W 1716 nt11.74□□□□□ -0.53
YJL181WP46987 TUB4YLR212C 1422 nt11.73□□□□□ -0.53
YJL181WP46987 BUD20YLR074C 501 nt11.7□□□□□ -0.54
YJL181WP46987 HSP60YLR259C 1719 nt11.69□□□□□ -0.54
YJL181WP46987 SED1YDR077W 1017 nt11.67□□□□□ -0.54
YJL181WP46987 POT1YIL160C 1254 nt11.67□□□□□ -0.54
YJL181WP46987 MHF1YOL086W-A 273 nt11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.9 ms