Protein–RNA interactions for Protein: P46970

NMD5, Nonsense-mediated mRNA decay protein 5, yeastyeast

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Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD5P46970 PAU16YKL224C 372 nt10.33□□□□□ -0.76
NMD5P46970 ALD4YOR374W 1560 nt10.33□□□□□ -0.76
NMD5P46970 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.32□□□□□ -0.76
NMD5P46970 ATG15YCR068W 1563 nt10.3□□□□□ -0.76
NMD5P46970 RET2YFR051C 1641 nt10.29□□□□□ -0.76
NMD5P46970 TOM6YOR045W 186 nt10.28□□□□□ -0.76
NMD5P46970 UBX6YJL048C 1191 nt10.26□□□□□ -0.77
NMD5P46970 UBA4YHR111W 1323 nt10.26□□□□□ -0.77
NMD5P46970 PHO89YBR296C 1725 nt10.23□□□□□ -0.77
NMD5P46970 CMP2YML057W 1815 nt10.21□□□□□ -0.77
NMD5P46970 THI74YDR438W 1113 nt10.21□□□□□ -0.77
NMD5P46970 DIF1YLR437C 402 nt10.21□□□□□ -0.77
NMD5P46970 YML089CYML089C 369 nt10.21□□□□□ -0.77
NMD5P46970 PEX2YJL210W 816 nt10.2□□□□□ -0.78
NMD5P46970 RPC82YPR190C 1965 nt10.19□□□□□ -0.78
NMD5P46970 SAM35YHR083W 990 nt10.18□□□□□ -0.78
NMD5P46970 YSR3YKR053C 1215 nt10.18□□□□□ -0.78
NMD5P46970 COQ2YNR041C 1119 nt10.17□□□□□ -0.78
NMD5P46970 TIF6YPR016C 738 nt10.17□□□□□ -0.78
NMD5P46970 HIP1YGR191W 1812 nt10.16□□□□□ -0.78
NMD5P46970 NDI1YML120C 1542 nt10.15□□□□□ -0.78
NMD5P46970 DBP1YPL119C 1854 nt10.15□□□□□ -0.79
NMD5P46970 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.14□□□□□ -0.79
NMD5P46970 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.14□□□□□ -0.79
NMD5P46970 XYL2YLR070C 1071 nt10.12□□□□□ -0.79
NMD5P46970 MSF1YPR047W 1410 nt10.11□□□□□ -0.79
NMD5P46970 NAT4YMR069W 858 nt10.11□□□□□ -0.79
NMD5P46970 HSL7YBR133C 2484 nt10.1□□□□□ -0.79
NMD5P46970 ZRT3YKL175W 1512 nt10.1□□□□□ -0.79
NMD5P46970 INA1YLR413W 2028 nt10.09□□□□□ -0.79
NMD5P46970 HXT1YHR094C 1713 nt10.09□□□□□ -0.79
NMD5P46970 SPT20YOL148C 1815 nt10.09□□□□□ -0.79
NMD5P46970 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.08□□□□□ -0.8
NMD5P46970 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.08□□□□□ -0.8
NMD5P46970 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.08□□□□□ -0.8
NMD5P46970 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.08□□□□□ -0.8
NMD5P46970 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.08□□□□□ -0.8
NMD5P46970 MRP20YDR405W 792 nt10.07□□□□□ -0.8
NMD5P46970 YGL034CYGL034C 366 nt10.06□□□□□ -0.8
NMD5P46970 YJL067WYJL067W 351 nt10.06□□□□□ -0.8
NMD5P46970 YCR087WYCR087W 516 nt10.04□□□□□ -0.8
NMD5P46970 YBL086CYBL086C 1401 nt10.04□□□□□ -0.8
NMD5P46970 SHY1YGR112W 1170 nt10.03□□□□□ -0.8
NMD5P46970 MTG2YHR168W 1557 nt10.03□□□□□ -0.8
NMD5P46970 YAR028WYAR028W 705 nt10.03□□□□□ -0.8
NMD5P46970 MET28YIR017C 564 nt10.02□□□□□ -0.81
NMD5P46970 ZTA1YBR046C 1005 nt10.01□□□□□ -0.81
NMD5P46970 AIM45YPR004C 1035 nt10.01□□□□□ -0.81
NMD5P46970 NRT1YOR071C 1797 nt10.01□□□□□ -0.81
NMD5P46970 LIP1YMR298W 453 nt10□□□□□ -0.81
NMD5P46970 SED1YDR077W 1017 nt9.99□□□□□ -0.81
NMD5P46970 RPL4BYDR012W 1089 nt9.98□□□□□ -0.81
NMD5P46970 RPL4AYBR031W 1089 nt9.98□□□□□ -0.81
NMD5P46970 RPS14BYJL191W 417 nt9.97□□□□□ -0.81
NMD5P46970 UTH1YKR042W 1098 nt9.97□□□□□ -0.81
NMD5P46970 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.95□□□□□ -0.82
NMD5P46970 AKR2YOR034C 2250 nt9.95□□□□□ -0.82
NMD5P46970 UFO1YML088W 2007 nt9.94□□□□□ -0.82
NMD5P46970 CLB6YGR109C 1143 nt9.93□□□□□ -0.82
NMD5P46970 YPL251WYPL251W 303 nt9.93□□□□□ -0.82
NMD5P46970 RBG1YAL036C 1110 nt9.92□□□□□ -0.82
NMD5P46970 LEU9YOR108W 1815 nt9.91□□□□□ -0.82
NMD5P46970 ALP1YNL270C 1722 nt9.9□□□□□ -0.82
NMD5P46970 SBA1YKL117W 651 nt9.9□□□□□ -0.82
NMD5P46970 SAM1YLR180W 1149 nt9.89□□□□□ -0.83
NMD5P46970 BRR1YPR057W 1026 nt9.89□□□□□ -0.83
NMD5P46970 TOA2YKL058W 369 nt9.88□□□□□ -0.83
NMD5P46970 URA6YKL024C 615 nt9.87□□□□□ -0.83
NMD5P46970 FIT3YOR383C 615 nt9.87□□□□□ -0.83
NMD5P46970 YOR325WYOR325W 474 nt9.86□□□□□ -0.83
NMD5P46970 HOL1YNR055C 1761 nt9.85□□□□□ -0.83
NMD5P46970 GND2YGR256W 1479 nt9.85□□□□□ -0.83
NMD5P46970 MUP1YGR055W 1725 nt9.85□□□□□ -0.83
NMD5P46970 YMR103CYMR103C 363 nt9.82□□□□□ -0.84
NMD5P46970 OYE3YPL171C 1203 nt9.82□□□□□ -0.84
NMD5P46970 ILV3YJR016C 1758 nt9.8□□□□□ -0.84
NMD5P46970 CWC15YDR163W 528 nt9.8□□□□□ -0.84
NMD5P46970 YNL024CYNL024C 741 nt9.8□□□□□ -0.84
NMD5P46970 MEP3YPR138C 1470 nt9.79□□□□□ -0.84
NMD5P46970 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.79□□□□□ -0.84
NMD5P46970 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.79□□□□□ -0.84
NMD5P46970 YLR279WYLR279W 390 nt9.79□□□□□ -0.84
NMD5P46970 RPM1RPM1 483 nt9.79□□□□□ -0.84
NMD5P46970 MSB4YOL112W 1479 nt9.79□□□□□ -0.84
NMD5P46970 UGA4YDL210W 1716 nt9.78□□□□□ -0.84
NMD5P46970 TSC10YBR265W 963 nt9.77□□□□□ -0.85
NMD5P46970 PET8YNL003C 855 nt9.76□□□□□ -0.85
NMD5P46970 RIM8YGL045W 1629 nt9.75□□□□□ -0.85
NMD5P46970 YGR012WYGR012W 1182 nt9.74□□□□□ -0.85
NMD5P46970 FLR1YBR008C 1647 nt9.74□□□□□ -0.85
NMD5P46970 FMS1YMR020W 1527 nt9.73□□□□□ -0.85
NMD5P46970 SDH5YOL071W 489 nt9.73□□□□□ -0.85
NMD5P46970 ACH1YBL015W 1581 nt9.72□□□□□ -0.85
NMD5P46970 SPP2YOR148C 558 nt9.71□□□□□ -0.86
NMD5P46970 CCT2YIL142W 1584 nt9.71□□□□□ -0.86
NMD5P46970 RSC8YFR037C 1674 nt9.71□□□□□ -0.86
NMD5P46970 OPI10YOL032W 741 nt9.69□□□□□ -0.86
NMD5P46970 CAB5YDR196C 726 nt9.68□□□□□ -0.86
NMD5P46970 SAM2YDR502C 1155 nt9.68□□□□□ -0.86
NMD5P46970 LSB6YJL100W 1824 nt9.68□□□□□ -0.86
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