Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 THI74YDR438W 1113 nt10.78□□□□□ -0.68
VFA1P40080 POM34YLR018C 900 nt10.77□□□□□ -0.69
VFA1P40080 PHO89YBR296C 1725 nt10.76□□□□□ -0.69
VFA1P40080 ATG15YCR068W 1563 nt10.74□□□□□ -0.69
VFA1P40080 TOM6YOR045W 186 nt10.74□□□□□ -0.69
VFA1P40080 YSR3YKR053C 1215 nt10.72□□□□□ -0.69
VFA1P40080 HIF1YLL022C 1158 nt10.72□□□□□ -0.69
VFA1P40080 NAT4YMR069W 858 nt10.71□□□□□ -0.69
VFA1P40080 ALD4YOR374W 1560 nt10.69□□□□□ -0.7
VFA1P40080 MSF1YPR047W 1410 nt10.68□□□□□ -0.7
VFA1P40080 YML089CYML089C 369 nt10.67□□□□□ -0.7
VFA1P40080 PEX2YJL210W 816 nt10.66□□□□□ -0.7
VFA1P40080 COQ2YNR041C 1119 nt10.66□□□□□ -0.7
VFA1P40080 XYL2YLR070C 1071 nt10.65□□□□□ -0.7
VFA1P40080 SAM35YHR083W 990 nt10.62□□□□□ -0.71
VFA1P40080 YAT1YAR035W 2064 nt10.62□□□□□ -0.71
VFA1P40080 YGL034CYGL034C 366 nt10.61□□□□□ -0.71
VFA1P40080 DIF1YLR437C 402 nt10.61□□□□□ -0.71
VFA1P40080 MRP20YDR405W 792 nt10.6□□□□□ -0.71
VFA1P40080 TIF6YPR016C 738 nt10.6□□□□□ -0.71
VFA1P40080 HIP1YGR191W 1812 nt10.59□□□□□ -0.71
VFA1P40080 YCR087WYCR087W 516 nt10.59□□□□□ -0.71
VFA1P40080 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.59□□□□□ -0.71
VFA1P40080 AIM45YPR004C 1035 nt10.53□□□□□ -0.72
VFA1P40080 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.5□□□□□ -0.73
VFA1P40080 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.5□□□□□ -0.73
VFA1P40080 RPL4BYDR012W 1089 nt10.49□□□□□ -0.73
VFA1P40080 MET28YIR017C 564 nt10.49□□□□□ -0.73
VFA1P40080 RPL4AYBR031W 1089 nt10.49□□□□□ -0.73
VFA1P40080 NRT1YOR071C 1797 nt10.49□□□□□ -0.73
VFA1P40080 DBP1YPL119C 1854 nt10.49□□□□□ -0.73
VFA1P40080 RBG1YAL036C 1110 nt10.48□□□□□ -0.73
VFA1P40080 HXT1YHR094C 1713 nt10.47□□□□□ -0.73
VFA1P40080 UTH1YKR042W 1098 nt10.47□□□□□ -0.73
VFA1P40080 YAR028WYAR028W 705 nt10.47□□□□□ -0.73
VFA1P40080 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.46□□□□□ -0.73
VFA1P40080 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.46□□□□□ -0.73
VFA1P40080 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.46□□□□□ -0.73
VFA1P40080 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.46□□□□□ -0.73
VFA1P40080 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.46□□□□□ -0.73
VFA1P40080 CLB6YGR109C 1143 nt10.45□□□□□ -0.74
VFA1P40080 RPS14BYJL191W 417 nt10.45□□□□□ -0.74
VFA1P40080 ZRT3YKL175W 1512 nt10.44□□□□□ -0.74
VFA1P40080 CMP2YML057W 1815 nt10.43□□□□□ -0.74
VFA1P40080 ZTA1YBR046C 1005 nt10.43□□□□□ -0.74
VFA1P40080 MTG2YHR168W 1557 nt10.43□□□□□ -0.74
VFA1P40080 LIP1YMR298W 453 nt10.41□□□□□ -0.74
VFA1P40080 NDI1YML120C 1542 nt10.4□□□□□ -0.74
VFA1P40080 RPC82YPR190C 1965 nt10.4□□□□□ -0.74
VFA1P40080 SED1YDR077W 1017 nt10.4□□□□□ -0.74
VFA1P40080 YBL086CYBL086C 1401 nt10.4□□□□□ -0.75
VFA1P40080 AKR2YOR034C 2250 nt10.4□□□□□ -0.75
VFA1P40080 SHY1YGR112W 1170 nt10.39□□□□□ -0.75
VFA1P40080 INA1YLR413W 2028 nt10.39□□□□□ -0.75
VFA1P40080 YJL067WYJL067W 351 nt10.37□□□□□ -0.75
VFA1P40080 FIT3YOR383C 615 nt10.35□□□□□ -0.75
VFA1P40080 ALP1YNL270C 1722 nt10.34□□□□□ -0.75
VFA1P40080 SPT20YOL148C 1815 nt10.33□□□□□ -0.76
VFA1P40080 SAM1YLR180W 1149 nt10.31□□□□□ -0.76
VFA1P40080 YPL251WYPL251W 303 nt10.31□□□□□ -0.76
VFA1P40080 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.3□□□□□ -0.76
VFA1P40080 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.3□□□□□ -0.76
VFA1P40080 SBA1YKL117W 651 nt10.29□□□□□ -0.76
VFA1P40080 TOA2YKL058W 369 nt10.28□□□□□ -0.76
VFA1P40080 SDH5YOL071W 489 nt10.28□□□□□ -0.76
VFA1P40080 BRR1YPR057W 1026 nt10.28□□□□□ -0.76
VFA1P40080 TSC10YBR265W 963 nt10.28□□□□□ -0.76
VFA1P40080 LEU9YOR108W 1815 nt10.28□□□□□ -0.76
VFA1P40080 UFO1YML088W 2007 nt10.26□□□□□ -0.77
VFA1P40080 YLR279WYLR279W 390 nt10.26□□□□□ -0.77
VFA1P40080 MSB4YOL112W 1479 nt10.23□□□□□ -0.77
VFA1P40080 YGR012WYGR012W 1182 nt10.23□□□□□ -0.77
VFA1P40080 URA6YKL024C 615 nt10.23□□□□□ -0.77
VFA1P40080 GND2YGR256W 1479 nt10.23□□□□□ -0.77
VFA1P40080 YMR103CYMR103C 363 nt10.22□□□□□ -0.77
VFA1P40080 MEP3YPR138C 1470 nt10.22□□□□□ -0.77
VFA1P40080 OYE3YPL171C 1203 nt10.19□□□□□ -0.78
VFA1P40080 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.18□□□□□ -0.78
VFA1P40080 UGA4YDL210W 1716 nt10.18□□□□□ -0.78
VFA1P40080 CWC15YDR163W 528 nt10.16□□□□□ -0.78
VFA1P40080 GLR1YPL091W 1452 nt10.16□□□□□ -0.78
VFA1P40080 PET8YNL003C 855 nt10.14□□□□□ -0.79
VFA1P40080 HSL7YBR133C 2484 nt10.13□□□□□ -0.79
VFA1P40080 YOR325WYOR325W 474 nt10.13□□□□□ -0.79
VFA1P40080 CAB5YDR196C 726 nt10.12□□□□□ -0.79
VFA1P40080 SAM2YDR502C 1155 nt10.1□□□□□ -0.79
VFA1P40080 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.1□□□□□ -0.79
VFA1P40080 RAD23YEL037C 1197 nt10.09□□□□□ -0.79
VFA1P40080 YLR111WYLR111W 333 nt10.08□□□□□ -0.8
VFA1P40080 YNL024CYNL024C 741 nt10.08□□□□□ -0.8
VFA1P40080 ILV3YJR016C 1758 nt10.08□□□□□ -0.8
VFA1P40080 FLR1YBR008C 1647 nt10.07□□□□□ -0.8
VFA1P40080 MUP1YGR055W 1725 nt10.07□□□□□ -0.8
VFA1P40080 SSN3YPL042C 1668 nt10.07□□□□□ -0.8
VFA1P40080 FMS1YMR020W 1527 nt10.07□□□□□ -0.8
VFA1P40080 FCY21YER060W 1587 nt10.06□□□□□ -0.8
VFA1P40080 SPP2YOR148C 558 nt10.06□□□□□ -0.8
VFA1P40080 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.06□□□□□ -0.8
VFA1P40080 RSC8YFR037C 1674 nt10.06□□□□□ -0.8
VFA1P40080 YMR244WYMR244W 1068 nt10.05□□□□□ -0.8
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