Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 SSN3YPL042C 1668 nt8.25□□□□□ -1.09
AVT5P38176 HIS2YFR025C 1008 nt8.24□□□□□ -1.09
AVT5P38176 PSD1YNL169C 1503 nt8.24□□□□□ -1.09
AVT5P38176 DAT1YML113W 747 nt8.23□□□□□ -1.09
AVT5P38176 HXK1YFR053C 1458 nt8.22□□□□□ -1.09
AVT5P38176 YNL115CYNL115C 1935 nt8.21□□□□□ -1.09
AVT5P38176 PEX25YPL112C 1185 nt8.2□□□□□ -1.1
AVT5P38176 PRM5YIL117C 957 nt8.19□□□□□ -1.1
AVT5P38176 NIT1YIL164C 600 nt8.19□□□□□ -1.1
AVT5P38176 YCR102CYCR102C 1107 nt8.18□□□□□ -1.1
AVT5P38176 CYT1YOR065W 930 nt8.18□□□□□ -1.1
AVT5P38176 ALD5YER073W 1563 nt8.18□□□□□ -1.1
AVT5P38176 VPS75YNL246W 795 nt8.17□□□□□ -1.1
AVT5P38176 ZRT3YKL175W 1512 nt8.17□□□□□ -1.1
AVT5P38176 UGP1YKL035W 1500 nt8.16□□□□□ -1.1
AVT5P38176 SGT2YOR007C 1041 nt8.16□□□□□ -1.1
AVT5P38176 ILV3YJR016C 1758 nt8.15□□□□□ -1.11
AVT5P38176 YFR018CYFR018C 1092 nt8.14□□□□□ -1.11
AVT5P38176 THI72YOR192C 1800 nt8.14□□□□□ -1.11
AVT5P38176 NBP35YGL091C 987 nt8.13□□□□□ -1.11
AVT5P38176 YOR325WYOR325W 474 nt8.13□□□□□ -1.11
AVT5P38176 COQ8YGL119W 1506 nt8.13□□□□□ -1.11
AVT5P38176 YFL066CYFL066C 1179 nt8.11□□□□□ -1.11
AVT5P38176 YJL067WYJL067W 351 nt8.11□□□□□ -1.11
AVT5P38176 ARP6YLR085C 1317 nt8.09□□□□□ -1.11
AVT5P38176 PLB1YMR008C 1995 nt8.08□□□□□ -1.12
AVT5P38176 GTB1YDR221W 2109 nt8.05□□□□□ -1.12
AVT5P38176 PAU7YAR020C 168 nt8.05□□□□□ -1.12
AVT5P38176 DMA2YNL116W 1569 nt8.05□□□□□ -1.12
AVT5P38176 LSC2YGR244C 1284 nt8.04□□□□□ -1.12
AVT5P38176 YOR072WYOR072W 315 nt8.04□□□□□ -1.12
AVT5P38176 MEP3YPR138C 1470 nt8.04□□□□□ -1.12
AVT5P38176 FRE6YLL051C 2139 nt8.03□□□□□ -1.12
AVT5P38176 TIR3YIL011W 810 nt8.03□□□□□ -1.12
AVT5P38176 ILV2YMR108W 2064 nt8.02□□□□□ -1.12
AVT5P38176 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.02□□□□□ -1.13
AVT5P38176 ARO8YGL202W 1503 nt8.02□□□□□ -1.13
AVT5P38176 YDR094WYDR094W 336 nt8.01□□□□□ -1.13
AVT5P38176 RSC8YFR037C 1674 nt8.01□□□□□ -1.13
AVT5P38176 GAL2YLR081W 1725 nt8□□□□□ -1.13
AVT5P38176 RRT5YFR032C 870 nt8□□□□□ -1.13
AVT5P38176 BET2YPR176C 978 nt8□□□□□ -1.13
AVT5P38176 KES1YPL145C 1305 nt8□□□□□ -1.13
AVT5P38176 SGA1YIL099W 1650 nt7.98□□□□□ -1.13
AVT5P38176 ESBP6YNL125C 2022 nt7.98□□□□□ -1.13
AVT5P38176 PRE6YOL038W 765 nt7.98□□□□□ -1.13
AVT5P38176 GAP1YKR039W 1809 nt7.96□□□□□ -1.13
AVT5P38176 OPI10YOL032W 741 nt7.96□□□□□ -1.14
AVT5P38176 PCP1YGR101W 1041 nt7.94□□□□□ -1.14
AVT5P38176 SAM35YHR083W 990 nt7.94□□□□□ -1.14
AVT5P38176 SHB17YKR043C 816 nt7.94□□□□□ -1.14
AVT5P38176 YML089CYML089C 369 nt7.94□□□□□ -1.14
AVT5P38176 YDR010CYDR010C 333 nt7.93□□□□□ -1.14
AVT5P38176 MTO1YGL236C 2010 nt7.93□□□□□ -1.14
AVT5P38176 UTR1YJR049C 1593 nt7.93□□□□□ -1.14
AVT5P38176 PRO1YDR300C 1287 nt7.92□□□□□ -1.14
AVT5P38176 POM34YLR018C 900 nt7.92□□□□□ -1.14
AVT5P38176 SHH4YLR164W 507 nt7.92□□□□□ -1.14
AVT5P38176 YHR218WYHR218W 1812 nt7.92□□□□□ -1.14
AVT5P38176 MIR1YJR077C 936 nt7.91□□□□□ -1.14
AVT5P38176 CCT2YIL142W 1584 nt7.91□□□□□ -1.14
AVT5P38176 RET2YFR051C 1641 nt7.91□□□□□ -1.14
AVT5P38176 MEX67YPL169C 1800 nt7.91□□□□□ -1.14
AVT5P38176 ATG15YCR068W 1563 nt7.89□□□□□ -1.15
AVT5P38176 MDL2YPL270W 2322 nt7.89□□□□□ -1.15
AVT5P38176 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.88□□□□□ -1.15
AVT5P38176 DTR1YBR180W 1719 nt7.87□□□□□ -1.15
AVT5P38176 UBA4YHR111W 1323 nt7.87□□□□□ -1.15
AVT5P38176 SFA1YDL168W 1161 nt7.87□□□□□ -1.15
AVT5P38176 PAU16YKL224C 372 nt7.87□□□□□ -1.15
AVT5P38176 NRT1YOR071C 1797 nt7.85□□□□□ -1.15
AVT5P38176 THI74YDR438W 1113 nt7.85□□□□□ -1.15
AVT5P38176 ODC1YPL134C 933 nt7.85□□□□□ -1.15
AVT5P38176 PHO89YBR296C 1725 nt7.84□□□□□ -1.15
AVT5P38176 CWC15YDR163W 528 nt7.84□□□□□ -1.15
AVT5P38176 YCR087WYCR087W 516 nt7.83□□□□□ -1.16
AVT5P38176 TOM6YOR045W 186 nt7.83□□□□□ -1.16
AVT5P38176 ZAP1YJL056C 2643 nt7.82□□□□□ -1.16
AVT5P38176 YSR3YKR053C 1215 nt7.82□□□□□ -1.16
AVT5P38176 DIF1YLR437C 402 nt7.81□□□□□ -1.16
AVT5P38176 NAT4YMR069W 858 nt7.81□□□□□ -1.16
AVT5P38176 LSB6YJL100W 1824 nt7.8□□□□□ -1.16
AVT5P38176 TOK1YJL093C 2076 nt7.8□□□□□ -1.16
AVT5P38176 RBG1YAL036C 1110 nt7.8□□□□□ -1.16
AVT5P38176 MRP20YDR405W 792 nt7.79□□□□□ -1.16
AVT5P38176 UBX6YJL048C 1191 nt7.79□□□□□ -1.16
AVT5P38176 HIP1YGR191W 1812 nt7.78□□□□□ -1.16
AVT5P38176 TIF6YPR016C 738 nt7.78□□□□□ -1.16
AVT5P38176 MSF1YPR047W 1410 nt7.78□□□□□ -1.16
AVT5P38176 SHY1YGR112W 1170 nt7.77□□□□□ -1.17
AVT5P38176 LSB5YCL034W 1065 nt7.77□□□□□ -1.17
AVT5P38176 HXT1YHR094C 1713 nt7.77□□□□□ -1.17
AVT5P38176 HXT10YFL011W 1641 nt7.77□□□□□ -1.17
AVT5P38176 MET28YIR017C 564 nt7.76□□□□□ -1.17
AVT5P38176 PEX2YJL210W 816 nt7.76□□□□□ -1.17
AVT5P38176 COQ2YNR041C 1119 nt7.76□□□□□ -1.17
AVT5P38176 DBP1YPL119C 1854 nt7.76□□□□□ -1.17
AVT5P38176 CLB6YGR109C 1143 nt7.75□□□□□ -1.17
AVT5P38176 QDR2YIL121W 1629 nt7.74□□□□□ -1.17
AVT5P38176 UFD1YGR048W 1086 nt7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.9 ms