Protein–RNA interactions for Protein: P36113

HEL1, E3 ubiquitin-protein ligase HEL1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEL1P36113 YAT1YAR035W 2064 nt10.8□□□□□ -0.68
HEL1P36113 MRP20YDR405W 792 nt10.79□□□□□ -0.68
HEL1P36113 YCL074WYCL074W 927 nt10.78□□□□□ -0.68
HEL1P36113 YCR102CYCR102C 1107 nt10.78□□□□□ -0.68
HEL1P36113 SFA1YDL168W 1161 nt10.77□□□□□ -0.69
HEL1P36113 YMR226CYMR226C 804 nt10.77□□□□□ -0.69
HEL1P36113 DUT1YBR252W 444 nt10.77□□□□□ -0.69
HEL1P36113 DUS1YML080W 1272 nt10.73□□□□□ -0.69
HEL1P36113 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.71□□□□□ -0.69
HEL1P36113 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.71□□□□□ -0.69
HEL1P36113 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.71□□□□□ -0.69
HEL1P36113 RPL4BYDR012W 1089 nt10.67□□□□□ -0.7
HEL1P36113 RPL4AYBR031W 1089 nt10.67□□□□□ -0.7
HEL1P36113 NBP35YGL091C 987 nt10.65□□□□□ -0.7
HEL1P36113 TIR3YIL011W 810 nt10.64□□□□□ -0.71
HEL1P36113 YLR111WYLR111W 333 nt10.64□□□□□ -0.71
HEL1P36113 SHH4YLR164W 507 nt10.64□□□□□ -0.71
HEL1P36113 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.63□□□□□ -0.71
HEL1P36113 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.63□□□□□ -0.71
HEL1P36113 SAM1YLR180W 1149 nt10.63□□□□□ -0.71
HEL1P36113 RPS14BYJL191W 417 nt10.62□□□□□ -0.71
HEL1P36113 CLB6YGR109C 1143 nt10.6□□□□□ -0.71
HEL1P36113 UTH1YKR042W 1098 nt10.57□□□□□ -0.72
HEL1P36113 SDH5YOL071W 489 nt10.57□□□□□ -0.72
HEL1P36113 STR3YGL184C 1398 nt10.55□□□□□ -0.72
HEL1P36113 POM34YLR018C 900 nt10.55□□□□□ -0.72
HEL1P36113 TOM6YOR045W 186 nt10.55□□□□□ -0.72
HEL1P36113 HIP1YGR191W 1812 nt10.54□□□□□ -0.72
HEL1P36113 SPT20YOL148C 1815 nt10.54□□□□□ -0.72
HEL1P36113 RAD23YEL037C 1197 nt10.54□□□□□ -0.72
HEL1P36113 HEL2YDR266C 1920 nt10.53□□□□□ -0.72
HEL1P36113 PEX2YJL210W 816 nt10.52□□□□□ -0.73
HEL1P36113 YML089CYML089C 369 nt10.51□□□□□ -0.73
HEL1P36113 LSC2YGR244C 1284 nt10.5□□□□□ -0.73
HEL1P36113 AQY2YLL052C 450 nt10.5□□□□□ -0.73
HEL1P36113 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.5□□□□□ -0.73
HEL1P36113 TSC10YBR265W 963 nt10.5□□□□□ -0.73
HEL1P36113 CAB5YDR196C 726 nt10.48□□□□□ -0.73
HEL1P36113 RPC82YPR190C 1965 nt10.48□□□□□ -0.73
HEL1P36113 NRT1YOR071C 1797 nt10.47□□□□□ -0.73
HEL1P36113 PRO1YDR300C 1287 nt10.47□□□□□ -0.73
HEL1P36113 YGR012WYGR012W 1182 nt10.47□□□□□ -0.73
HEL1P36113 TIF6YPR016C 738 nt10.45□□□□□ -0.74
HEL1P36113 RIB3YDR487C 627 nt10.43□□□□□ -0.74
HEL1P36113 MET28YIR017C 564 nt10.43□□□□□ -0.74
HEL1P36113 ATG15YCR068W 1563 nt10.43□□□□□ -0.74
HEL1P36113 RAD51YER095W 1203 nt10.41□□□□□ -0.74
HEL1P36113 ARP6YLR085C 1317 nt10.4□□□□□ -0.74
HEL1P36113 YLR279WYLR279W 390 nt10.4□□□□□ -0.74
HEL1P36113 RTN2YDL204W 1182 nt10.39□□□□□ -0.75
HEL1P36113 INA1YLR413W 2028 nt10.38□□□□□ -0.75
HEL1P36113 RIM8YGL045W 1629 nt10.36□□□□□ -0.75
HEL1P36113 FIT3YOR383C 615 nt10.35□□□□□ -0.75
HEL1P36113 MSB4YOL112W 1479 nt10.34□□□□□ -0.75
HEL1P36113 GAP1YKR039W 1809 nt10.33□□□□□ -0.76
HEL1P36113 HIF1YLL022C 1158 nt10.32□□□□□ -0.76
HEL1P36113 YLR349WYLR349W 507 nt10.31□□□□□ -0.76
HEL1P36113 STE4YOR212W 1272 nt10.31□□□□□ -0.76
HEL1P36113 YGL114WYGL114W 2178 nt10.29□□□□□ -0.76
HEL1P36113 MUP1YGR055W 1725 nt10.28□□□□□ -0.76
HEL1P36113 PLB1YMR008C 1995 nt10.27□□□□□ -0.77
HEL1P36113 FUN14YAL008W 597 nt10.27□□□□□ -0.77
HEL1P36113 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.27□□□□□ -0.77
HEL1P36113 YJL195CYJL195C 702 nt10.25□□□□□ -0.77
HEL1P36113 YNR029CYNR029C 1290 nt10.25□□□□□ -0.77
HEL1P36113 ADH1YOL086C 1047 nt10.24□□□□□ -0.77
HEL1P36113 YPI1YFR003C 468 nt10.22□□□□□ -0.77
HEL1P36113 DIF1YLR437C 402 nt10.21□□□□□ -0.77
HEL1P36113 ALD4YOR374W 1560 nt10.21□□□□□ -0.78
HEL1P36113 GND1YHR183W 1470 nt10.2□□□□□ -0.78
HEL1P36113 PRM5YIL117C 957 nt10.2□□□□□ -0.78
HEL1P36113 LOT5YKL183W 921 nt10.2□□□□□ -0.78
HEL1P36113 YAR028WYAR028W 705 nt10.2□□□□□ -0.78
HEL1P36113 HOL1YNR055C 1761 nt10.19□□□□□ -0.78
HEL1P36113 MAE1YKL029C 2010 nt10.18□□□□□ -0.78
HEL1P36113 ADH7YCR105W 1086 nt10.18□□□□□ -0.78
HEL1P36113 RPM1RPM1 483 nt10.18□□□□□ -0.78
HEL1P36113 ZTA1YBR046C 1005 nt10.18□□□□□ -0.78
HEL1P36113 ALP1YNL270C 1722 nt10.17□□□□□ -0.78
HEL1P36113 MTG2YHR168W 1557 nt10.15□□□□□ -0.78
HEL1P36113 UTR1YJR049C 1593 nt10.14□□□□□ -0.79
HEL1P36113 AKR2YOR034C 2250 nt10.14□□□□□ -0.79
HEL1P36113 PAU15YIR041W 375 nt10.12□□□□□ -0.79
HEL1P36113 YEL008WYEL008W 381 nt10.11□□□□□ -0.79
HEL1P36113 FCY21YER060W 1587 nt10.09□□□□□ -0.79
HEL1P36113 APT2YDR441C 546 nt10.08□□□□□ -0.8
HEL1P36113 SMM1YNR015W 1155 nt10.07□□□□□ -0.8
HEL1P36113 ZRT3YKL175W 1512 nt10.06□□□□□ -0.8
HEL1P36113 GPN2YOR262W 1044 nt10.05□□□□□ -0.8
HEL1P36113 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.03□□□□□ -0.8
HEL1P36113 CPD1YGR247W 720 nt10.03□□□□□ -0.8
HEL1P36113 YJL067WYJL067W 351 nt10.02□□□□□ -0.81
HEL1P36113 ACO2YJL200C 2370 nt10.02□□□□□ -0.81
HEL1P36113 SAM35YHR083W 990 nt10.01□□□□□ -0.81
HEL1P36113 SED1YDR077W 1017 nt10□□□□□ -0.81
HEL1P36113 RIB2YOL066C 1776 nt9.99□□□□□ -0.81
HEL1P36113 PRY1YJL079C 900 nt9.99□□□□□ -0.81
HEL1P36113 SFP1YLR403W 2052 nt9.98□□□□□ -0.81
HEL1P36113 MET2YNL277W 1461 nt9.98□□□□□ -0.81
HEL1P36113 ESS1YJR017C 513 nt9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.5 ms