Protein–RNA interactions for Protein: P35177

SPT7, Transcriptional activator SPT7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT7P35177 YMR226CYMR226C 804 nt13.31□□□□□ -0.28
SPT7P35177 CYT2YKL087C 675 nt13.29□□□□□ -0.28
SPT7P35177 SAM1YLR180W 1149 nt13.28□□□□□ -0.28
SPT7P35177 PRM5YIL117C 957 nt13.27□□□□□ -0.29
SPT7P35177 SHB17YKR043C 816 nt13.26□□□□□ -0.29
SPT7P35177 TIR3YIL011W 810 nt13.23□□□□□ -0.29
SPT7P35177 XYL2YLR070C 1071 nt13.23□□□□□ -0.29
SPT7P35177 SFA1YDL168W 1161 nt13.21□□□□□ -0.29
SPT7P35177 PRO1YDR300C 1287 nt13.21□□□□□ -0.29
SPT7P35177 UTR1YJR049C 1593 nt13.21□□□□□ -0.29
SPT7P35177 RPM1RPM1 483 nt13.2□□□□□ -0.3
SPT7P35177 YCR087WYCR087W 516 nt13.19□□□□□ -0.3
SPT7P35177 YAT1YAR035W 2064 nt13.17□□□□□ -0.3
SPT7P35177 HIF1YLL022C 1158 nt13.16□□□□□ -0.3
SPT7P35177 POM34YLR018C 900 nt13.16□□□□□ -0.3
SPT7P35177 GAP1YKR039W 1809 nt13.16□□□□□ -0.3
SPT7P35177 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt13.13□□□□□ -0.31
SPT7P35177 LSC2YGR244C 1284 nt13.12□□□□□ -0.31
SPT7P35177 RET2YFR051C 1641 nt13.11□□□□□ -0.31
SPT7P35177 YLR111WYLR111W 333 nt13.11□□□□□ -0.31
SPT7P35177 AIM45YPR004C 1035 nt13.11□□□□□ -0.31
SPT7P35177 TOM6YOR045W 186 nt13.1□□□□□ -0.31
SPT7P35177 YJL225CYJL225C 5277 nt13.09□□□□□ -0.31
SPT7P35177 PHO89YBR296C 1725 nt13.08□□□□□ -0.32
SPT7P35177 ATG15YCR068W 1563 nt13.06□□□□□ -0.32
SPT7P35177 ALD4YOR374W 1560 nt13.06□□□□□ -0.32
SPT7P35177 RAD51YER095W 1203 nt13.02□□□□□ -0.33
SPT7P35177 MRP20YDR405W 792 nt12.99□□□□□ -0.33
SPT7P35177 PEX2YJL210W 816 nt12.99□□□□□ -0.33
SPT7P35177 COQ2YNR041C 1119 nt12.99□□□□□ -0.33
SPT7P35177 DIF1YLR437C 402 nt12.98□□□□□ -0.33
SPT7P35177 TIF6YPR016C 738 nt12.95□□□□□ -0.34
SPT7P35177 YML089CYML089C 369 nt12.94□□□□□ -0.34
SPT7P35177 YNR029CYNR029C 1290 nt12.92□□□□□ -0.34
SPT7P35177 HIP1YGR191W 1812 nt12.91□□□□□ -0.34
SPT7P35177 STE4YOR212W 1272 nt12.91□□□□□ -0.34
SPT7P35177 SDH5YOL071W 489 nt12.87□□□□□ -0.35
SPT7P35177 DBP1YPL119C 1854 nt12.86□□□□□ -0.35
SPT7P35177 RPC82YPR190C 1965 nt12.85□□□□□ -0.35
SPT7P35177 ADH7YCR105W 1086 nt12.84□□□□□ -0.35
SPT7P35177 SAM35YHR083W 990 nt12.84□□□□□ -0.35
SPT7P35177 CMP2YML057W 1815 nt12.83□□□□□ -0.35
SPT7P35177 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.82□□□□□ -0.36
SPT7P35177 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.82□□□□□ -0.36
SPT7P35177 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.82□□□□□ -0.36
SPT7P35177 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.82□□□□□ -0.36
SPT7P35177 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.82□□□□□ -0.36
SPT7P35177 PAU15YIR041W 375 nt12.8□□□□□ -0.36
SPT7P35177 YLR349WYLR349W 507 nt12.8□□□□□ -0.36
SPT7P35177 RDN25-1RDN25-1 3396 nt12.79□□□□□ -0.36
SPT7P35177 RDN25-2RDN25-2 3396 nt12.79□□□□□ -0.36
SPT7P35177 ZTA1YBR046C 1005 nt12.78□□□□□ -0.36
SPT7P35177 HXT1YHR094C 1713 nt12.77□□□□□ -0.36
SPT7P35177 YJL067WYJL067W 351 nt12.76□□□□□ -0.37
SPT7P35177 MTG2YHR168W 1557 nt12.75□□□□□ -0.37
SPT7P35177 YBL086CYBL086C 1401 nt12.75□□□□□ -0.37
SPT7P35177 ZRT3YKL175W 1512 nt12.74□□□□□ -0.37
SPT7P35177 RAD23YEL037C 1197 nt12.74□□□□□ -0.37
SPT7P35177 YAR028WYAR028W 705 nt12.74□□□□□ -0.37
SPT7P35177 RPL4BYDR012W 1089 nt12.73□□□□□ -0.37
SPT7P35177 SHY1YGR112W 1170 nt12.73□□□□□ -0.37
SPT7P35177 MET28YIR017C 564 nt12.73□□□□□ -0.37
SPT7P35177 RPL4AYBR031W 1089 nt12.73□□□□□ -0.37
SPT7P35177 CLB6YGR109C 1143 nt12.72□□□□□ -0.37
SPT7P35177 NRT1YOR071C 1797 nt12.72□□□□□ -0.37
SPT7P35177 RPS14BYJL191W 417 nt12.71□□□□□ -0.37
SPT7P35177 INA1YLR413W 2028 nt12.71□□□□□ -0.38
SPT7P35177 HSL7YBR133C 2484 nt12.71□□□□□ -0.38
SPT7P35177 FUN14YAL008W 597 nt12.7□□□□□ -0.38
SPT7P35177 SPT20YOL148C 1815 nt12.7□□□□□ -0.38
SPT7P35177 UTH1YKR042W 1098 nt12.67□□□□□ -0.38
SPT7P35177 LIP1YMR298W 453 nt12.67□□□□□ -0.38
SPT7P35177 AKR2YOR034C 2250 nt12.67□□□□□ -0.38
SPT7P35177 SED1YDR077W 1017 nt12.66□□□□□ -0.38
SPT7P35177 YLR279WYLR279W 390 nt12.64□□□□□ -0.39
SPT7P35177 YPL251WYPL251W 303 nt12.64□□□□□ -0.39
SPT7P35177 YJL195CYJL195C 702 nt12.63□□□□□ -0.39
SPT7P35177 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.63□□□□□ -0.39
SPT7P35177 UFO1YML088W 2007 nt12.61□□□□□ -0.39
SPT7P35177 LEU9YOR108W 1815 nt12.57□□□□□ -0.4
SPT7P35177 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.56□□□□□ -0.4
SPT7P35177 TSC10YBR265W 963 nt12.56□□□□□ -0.4
SPT7P35177 ALP1YNL270C 1722 nt12.55□□□□□ -0.4
SPT7P35177 RIB3YDR487C 627 nt12.55□□□□□ -0.4
SPT7P35177 GPN2YOR262W 1044 nt12.55□□□□□ -0.4
SPT7P35177 BRR1YPR057W 1026 nt12.55□□□□□ -0.4
SPT7P35177 YGR012WYGR012W 1182 nt12.53□□□□□ -0.4
SPT7P35177 FIT3YOR383C 615 nt12.53□□□□□ -0.4
SPT7P35177 TOA2YKL058W 369 nt12.52□□□□□ -0.41
SPT7P35177 YOR325WYOR325W 474 nt12.51□□□□□ -0.41
SPT7P35177 URA6YKL024C 615 nt12.5□□□□□ -0.41
SPT7P35177 GND2YGR256W 1479 nt12.49□□□□□ -0.41
SPT7P35177 ESS1YJR017C 513 nt12.49□□□□□ -0.41
SPT7P35177 MSB4YOL112W 1479 nt12.49□□□□□ -0.41
SPT7P35177 CPD1YGR247W 720 nt12.48□□□□□ -0.41
SPT7P35177 YMR103CYMR103C 363 nt12.48□□□□□ -0.41
SPT7P35177 UGA4YDL210W 1716 nt12.48□□□□□ -0.41
SPT7P35177 CAB5YDR196C 726 nt12.45□□□□□ -0.42
SPT7P35177 OYE3YPL171C 1203 nt12.45□□□□□ -0.42
SPT7P35177 MEP3YPR138C 1470 nt12.44□□□□□ -0.42
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