Protein–RNA interactions for Protein: P0CF17

YML002W, UPF0507 protein YML002W, yeastyeast

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML002WP0CF17 LSC2YGR244C 1284 nt10.28□□□□□ -0.76
YML002WP0CF17 POM34YLR018C 900 nt10.27□□□□□ -0.77
YML002WP0CF17 HIF1YLL022C 1158 nt10.25□□□□□ -0.77
YML002WP0CF17 ATG15YCR068W 1563 nt10.25□□□□□ -0.77
YML002WP0CF17 UBA4YHR111W 1323 nt10.25□□□□□ -0.77
YML002WP0CF17 PHO89YBR296C 1725 nt10.24□□□□□ -0.77
YML002WP0CF17 ALD4YOR374W 1560 nt10.24□□□□□ -0.77
YML002WP0CF17 RET2YFR051C 1641 nt10.24□□□□□ -0.77
YML002WP0CF17 THI74YDR438W 1113 nt10.23□□□□□ -0.77
YML002WP0CF17 TOM6YOR045W 186 nt10.23□□□□□ -0.77
YML002WP0CF17 CMP2YML057W 1815 nt10.19□□□□□ -0.78
YML002WP0CF17 YSR3YKR053C 1215 nt10.19□□□□□ -0.78
YML002WP0CF17 HSL7YBR133C 2484 nt10.19□□□□□ -0.78
YML002WP0CF17 YML089CYML089C 369 nt10.17□□□□□ -0.78
YML002WP0CF17 SAM35YHR083W 990 nt10.16□□□□□ -0.78
YML002WP0CF17 PEX2YJL210W 816 nt10.16□□□□□ -0.78
YML002WP0CF17 NAT4YMR069W 858 nt10.16□□□□□ -0.78
YML002WP0CF17 YAT1YAR035W 2064 nt10.16□□□□□ -0.78
YML002WP0CF17 COQ2YNR041C 1119 nt10.14□□□□□ -0.79
YML002WP0CF17 MSF1YPR047W 1410 nt10.14□□□□□ -0.79
YML002WP0CF17 XYL2YLR070C 1071 nt10.13□□□□□ -0.79
YML002WP0CF17 DIF1YLR437C 402 nt10.11□□□□□ -0.79
YML002WP0CF17 MRP20YDR405W 792 nt10.1□□□□□ -0.79
YML002WP0CF17 TIF6YPR016C 738 nt10.09□□□□□ -0.79
YML002WP0CF17 YGL034CYGL034C 366 nt10.07□□□□□ -0.8
YML002WP0CF17 HIP1YGR191W 1812 nt10.07□□□□□ -0.8
YML002WP0CF17 YCR087WYCR087W 516 nt10.06□□□□□ -0.8
YML002WP0CF17 HEL2YDR266C 1920 nt10.04□□□□□ -0.8
YML002WP0CF17 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.01□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.01□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 AIM45YPR004C 1035 nt10.01□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 HXT1YHR094C 1713 nt10.01□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 MET28YIR017C 564 nt10□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 NRT1YOR071C 1797 nt9.99□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 ZRT3YKL175W 1512 nt9.99□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 DBP1YPL119C 1854 nt9.98□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.98□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.98□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 YAR028WYAR028W 705 nt9.98□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.98□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.98□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.98□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 NDI1YML120C 1542 nt9.97□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 INA1YLR413W 2028 nt9.97□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 RPL4BYDR012W 1089 nt9.97□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 UTH1YKR042W 1098 nt9.97□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 RPL4AYBR031W 1089 nt9.97□□□□□ -0.81
YML002WP0CF17 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.96□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 CLB6YGR109C 1143 nt9.96□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 RBG1YAL036C 1110 nt9.96□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 LIP1YMR298W 453 nt9.95□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 RPC82YPR190C 1965 nt9.94□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 SHY1YGR112W 1170 nt9.93□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 RPS14BYJL191W 417 nt9.93□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 ZTA1YBR046C 1005 nt9.93□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 AKR2YOR034C 2250 nt9.93□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 MTG2YHR168W 1557 nt9.92□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 SED1YDR077W 1017 nt9.92□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 YJL067WYJL067W 351 nt9.92□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 YBL086CYBL086C 1401 nt9.91□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 SPT20YOL148C 1815 nt9.9□□□□□ -0.82
YML002WP0CF17 FRE6YLL051C 2139 nt9.86□□□□□ -0.83
YML002WP0CF17 ALP1YNL270C 1722 nt9.85□□□□□ -0.83
YML002WP0CF17 SAM1YLR180W 1149 nt9.85□□□□□ -0.83
YML002WP0CF17 FIT3YOR383C 615 nt9.85□□□□□ -0.83
YML002WP0CF17 TOA2YKL058W 369 nt9.84□□□□□ -0.83
YML002WP0CF17 MET2YNL277W 1461 nt9.84□□□□□ -0.83
YML002WP0CF17 YPL251WYPL251W 303 nt9.82□□□□□ -0.84
YML002WP0CF17 BRR1YPR057W 1026 nt9.82□□□□□ -0.84
YML002WP0CF17 SBA1YKL117W 651 nt9.8□□□□□ -0.84
YML002WP0CF17 SDH5YOL071W 489 nt9.79□□□□□ -0.84
YML002WP0CF17 LEU9YOR108W 1815 nt9.79□□□□□ -0.84
YML002WP0CF17 GND2YGR256W 1479 nt9.79□□□□□ -0.84
YML002WP0CF17 URA6YKL024C 615 nt9.78□□□□□ -0.84
YML002WP0CF17 UFO1YML088W 2007 nt9.78□□□□□ -0.84
YML002WP0CF17 TSC10YBR265W 963 nt9.77□□□□□ -0.85
YML002WP0CF17 YMR103CYMR103C 363 nt9.76□□□□□ -0.85
YML002WP0CF17 MEP3YPR138C 1470 nt9.75□□□□□ -0.85
YML002WP0CF17 YLR279WYLR279W 390 nt9.75□□□□□ -0.85
YML002WP0CF17 OYE3YPL171C 1203 nt9.74□□□□□ -0.85
YML002WP0CF17 SFP1YLR403W 2052 nt9.73□□□□□ -0.85
YML002WP0CF17 CWC15YDR163W 528 nt9.73□□□□□ -0.85
YML002WP0CF17 YGR012WYGR012W 1182 nt9.72□□□□□ -0.85
YML002WP0CF17 MSB4YOL112W 1479 nt9.72□□□□□ -0.85
YML002WP0CF17 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.71□□□□□ -0.86
YML002WP0CF17 PET8YNL003C 855 nt9.7□□□□□ -0.86
YML002WP0CF17 YOR325WYOR325W 474 nt9.7□□□□□ -0.86
YML002WP0CF17 UGA4YDL210W 1716 nt9.69□□□□□ -0.86
YML002WP0CF17 YNL024CYNL024C 741 nt9.69□□□□□ -0.86
YML002WP0CF17 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.68□□□□□ -0.86
YML002WP0CF17 SAM2YDR502C 1155 nt9.67□□□□□ -0.86
YML002WP0CF17 MUP1YGR055W 1725 nt9.66□□□□□ -0.86
YML002WP0CF17 RIM8YGL045W 1629 nt9.64□□□□□ -0.87
YML002WP0CF17 MAE1YKL029C 2010 nt9.63□□□□□ -0.87
YML002WP0CF17 ILV3YJR016C 1758 nt9.63□□□□□ -0.87
YML002WP0CF17 SPP2YOR148C 558 nt9.63□□□□□ -0.87
YML002WP0CF17 GLR1YPL091W 1452 nt9.62□□□□□ -0.87
YML002WP0CF17 NPP1YCR026C 2229 nt9.62□□□□□ -0.87
YML002WP0CF17 FMS1YMR020W 1527 nt9.61□□□□□ -0.87
YML002WP0CF17 RSC8YFR037C 1674 nt9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.6 ms