Protein–RNA interactions for Protein: P08432

SPE1, Ornithine decarboxylase, yeastyeast

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE1P08432 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.38□□□□□ -0.75
SPE1P08432 SHH4YLR164W 507 nt10.36□□□□□ -0.75
SPE1P08432 RPM1RPM1 483 nt10.36□□□□□ -0.75
SPE1P08432 DPS1YLL018C 1674 nt10.34□□□□□ -0.75
SPE1P08432 CAB5YDR196C 726 nt10.34□□□□□ -0.75
SPE1P08432 UTH1YKR042W 1098 nt10.34□□□□□ -0.75
SPE1P08432 TIR3YIL011W 810 nt10.33□□□□□ -0.76
SPE1P08432 STE4YOR212W 1272 nt10.33□□□□□ -0.76
SPE1P08432 NBP35YGL091C 987 nt10.32□□□□□ -0.76
SPE1P08432 YNR029CYNR029C 1290 nt10.32□□□□□ -0.76
SPE1P08432 YKR005CYKR005C 1578 nt10.31□□□□□ -0.76
SPE1P08432 YCL074WYCL074W 927 nt10.31□□□□□ -0.76
SPE1P08432 YLR349WYLR349W 507 nt10.31□□□□□ -0.76
SPE1P08432 DUS1YML080W 1272 nt10.31□□□□□ -0.76
SPE1P08432 TOM6YOR045W 186 nt10.31□□□□□ -0.76
SPE1P08432 TSC10YBR265W 963 nt10.31□□□□□ -0.76
SPE1P08432 HIP1YGR191W 1812 nt10.29□□□□□ -0.76
SPE1P08432 RIB3YDR487C 627 nt10.29□□□□□ -0.76
SPE1P08432 YGR012WYGR012W 1182 nt10.29□□□□□ -0.76
SPE1P08432 YGR139WYGR139W 339 nt10.28□□□□□ -0.76
SPE1P08432 AAC1YMR056C 930 nt10.28□□□□□ -0.76
SPE1P08432 PEX2YJL210W 816 nt10.27□□□□□ -0.77
SPE1P08432 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.26□□□□□ -0.77
SPE1P08432 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.26□□□□□ -0.77
SPE1P08432 POM34YLR018C 900 nt10.26□□□□□ -0.77
SPE1P08432 FUN14YAL008W 597 nt10.25□□□□□ -0.77
SPE1P08432 NRT1YOR071C 1797 nt10.24□□□□□ -0.77
SPE1P08432 SNF1YDR477W 1902 nt10.24□□□□□ -0.77
SPE1P08432 STR3YGL184C 1398 nt10.24□□□□□ -0.77
SPE1P08432 MCH5YOR306C 1566 nt10.22□□□□□ -0.77
SPE1P08432 YML089CYML089C 369 nt10.22□□□□□ -0.77
SPE1P08432 YGR259CYGR259C 441 nt10.21□□□□□ -0.77
SPE1P08432 YJL195CYJL195C 702 nt10.21□□□□□ -0.77
SPE1P08432 ADH7YCR105W 1086 nt10.2□□□□□ -0.78
SPE1P08432 BMT6YLR063W 1098 nt10.2□□□□□ -0.78
SPE1P08432 YLR279WYLR279W 390 nt10.2□□□□□ -0.78
SPE1P08432 BIO5YNR056C 1686 nt10.19□□□□□ -0.78
SPE1P08432 PRO1YDR300C 1287 nt10.18□□□□□ -0.78
SPE1P08432 LSC2YGR244C 1284 nt10.18□□□□□ -0.78
SPE1P08432 MET28YIR017C 564 nt10.18□□□□□ -0.78
SPE1P08432 PAU15YIR041W 375 nt10.18□□□□□ -0.78
SPE1P08432 TIF6YPR016C 738 nt10.18□□□□□ -0.78
SPE1P08432 ADH1YOL086C 1047 nt10.15□□□□□ -0.78
SPE1P08432 AQY2YLL052C 450 nt10.14□□□□□ -0.79
SPE1P08432 MSB4YOL112W 1479 nt10.13□□□□□ -0.79
SPE1P08432 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.13□□□□□ -0.79
SPE1P08432 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.13□□□□□ -0.79
SPE1P08432 IRC24YIR036C 792 nt10.12□□□□□ -0.79
SPE1P08432 ATG15YCR068W 1563 nt10.12□□□□□ -0.79
SPE1P08432 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.11□□□□□ -0.79
SPE1P08432 YPI1YFR003C 468 nt10.09□□□□□ -0.79
SPE1P08432 FIT3YOR383C 615 nt10.09□□□□□ -0.79
SPE1P08432 NAR1YNL240C 1476 nt10.09□□□□□ -0.79
SPE1P08432 PBP1YGR178C 2169 nt10.07□□□□□ -0.8
SPE1P08432 GPN2YOR262W 1044 nt10.06□□□□□ -0.8
SPE1P08432 YEL008WYEL008W 381 nt10.05□□□□□ -0.8
SPE1P08432 ARP6YLR085C 1317 nt10.04□□□□□ -0.8
SPE1P08432 GND1YHR183W 1470 nt10.03□□□□□ -0.8
SPE1P08432 CPD1YGR247W 720 nt10.02□□□□□ -0.81
SPE1P08432 LOT5YKL183W 921 nt10.02□□□□□ -0.81
SPE1P08432 ESS1YJR017C 513 nt10.01□□□□□ -0.81
SPE1P08432 RTN2YDL204W 1182 nt10□□□□□ -0.81
SPE1P08432 GAP1YKR039W 1809 nt10□□□□□ -0.81
SPE1P08432 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.97□□□□□ -0.81
SPE1P08432 CYT2YKL087C 675 nt9.96□□□□□ -0.82
SPE1P08432 APT2YDR441C 546 nt9.93□□□□□ -0.82
SPE1P08432 PLB1YMR008C 1995 nt9.91□□□□□ -0.82
SPE1P08432 ALP1YNL270C 1722 nt9.9□□□□□ -0.82
SPE1P08432 YAR028WYAR028W 705 nt9.89□□□□□ -0.83
SPE1P08432 SMM1YNR015W 1155 nt9.89□□□□□ -0.83
SPE1P08432 ZTA1YBR046C 1005 nt9.89□□□□□ -0.83
SPE1P08432 DIF1YLR437C 402 nt9.88□□□□□ -0.83
SPE1P08432 MTG2YHR168W 1557 nt9.87□□□□□ -0.83
SPE1P08432 AKR2YOR034C 2250 nt9.85□□□□□ -0.83
SPE1P08432 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.85□□□□□ -0.83
SPE1P08432 FCY21YER060W 1587 nt9.84□□□□□ -0.83
SPE1P08432 NAP1YKR048C 1254 nt9.84□□□□□ -0.83
SPE1P08432 SEN2YLR105C 1134 nt9.84□□□□□ -0.83
SPE1P08432 RIB2YOL066C 1776 nt9.83□□□□□ -0.84
SPE1P08432 PUP1YOR157C 786 nt9.82□□□□□ -0.84
SPE1P08432 PRM5YIL117C 957 nt9.8□□□□□ -0.84
SPE1P08432 YAT1YAR035W 2064 nt9.79□□□□□ -0.84
SPE1P08432 HXT12YIL170W 1374 nt9.78□□□□□ -0.84
SPE1P08432 UTR1YJR049C 1593 nt9.77□□□□□ -0.85
SPE1P08432 HIF1YLL022C 1158 nt9.77□□□□□ -0.85
SPE1P08432 PGC1YPL206C 966 nt9.76□□□□□ -0.85
SPE1P08432 PRY1YJL079C 900 nt9.75□□□□□ -0.85
SPE1P08432 YBR232CYBR232C 360 nt9.74□□□□□ -0.85
SPE1P08432 PAU5YFL020C 369 nt9.73□□□□□ -0.85
SPE1P08432 ALD4YOR374W 1560 nt9.72□□□□□ -0.85
SPE1P08432 VRG4YGL225W 1014 nt9.72□□□□□ -0.85
SPE1P08432 UGA4YDL210W 1716 nt9.7□□□□□ -0.86
SPE1P08432 STP3YLR375W 1032 nt9.69□□□□□ -0.86
SPE1P08432 SED1YDR077W 1017 nt9.67□□□□□ -0.86
SPE1P08432 CMP2YML057W 1815 nt9.66□□□□□ -0.86
SPE1P08432 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.66□□□□□ -0.86
SPE1P08432 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.66□□□□□ -0.86
SPE1P08432 YJL055WYJL055W 738 nt9.66□□□□□ -0.86
SPE1P08432 YJL064WYJL064W 396 nt9.66□□□□□ -0.86
SPE1P08432 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.66□□□□□ -0.86
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