Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms