Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMOQ99835 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMOQ99835 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMOQ99835 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMOQ99835 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMOQ99835 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMOQ99835 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMOQ99835 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMOQ99835 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOQ99835 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOQ99835 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOQ99835 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOQ99835 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOQ99835 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOQ99835 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOQ99835 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOQ99835 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOQ99835 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMOQ99835 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMOQ99835 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMOQ99835 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOQ99835 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOQ99835 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOQ99835 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOQ99835 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOQ99835 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOQ99835 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOQ99835 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOQ99835 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOQ99835 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOQ99835 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOQ99835 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOQ99835 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOQ99835 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOQ99835 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOQ99835 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOQ99835 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOQ99835 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOQ99835 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOQ99835 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOQ99835 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOQ99835 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOQ99835 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOQ99835 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOQ99835 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms