Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOHLH1Q5JUK2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms