Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
GRIN2AQ12879 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
GRIN2AQ12879 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236 ms